EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-47346 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:62013870-62016145 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EOMESMA0800.1chr4:62014155-62014168GTTTTCACACCTC-6.78
IKZF1MA1508.1chr4:62015207-62015219CAAACAGGAAGT+6.02
IRF1MA0050.2chr4:62014921-62014942AGAGAGAAAATGAAAACGAAA-6.16
IRF1MA0050.2chr4:62014927-62014948AAAATGAAAACGAAACTTAAC-7.08
IRF3MA1418.1chr4:62014924-62014945GAGAAAATGAAAACGAAACTT+6.98
IRF9MA0653.1chr4:62014929-62014944AATGAAAACGAAACT+6.41
KLF13MA0657.1chr4:62014185-62014203GAAAAGTGGGCGTGTCCA-6.67
KLF14MA0740.1chr4:62014188-62014202AAGTGGGCGTGTCC-7.06
KLF4MA0039.3chr4:62014240-62014251GGAGGGTGTGG-6.32
NR2C2MA0504.1chr4:62016038-62016053TGAACTCTGACCTGC-6.16
SP4MA0685.1chr4:62014187-62014204AAAGTGGGCGTGTCCAG-6.7
SP8MA0747.1chr4:62014189-62014201AGTGGGCGTGTC-6.37
STAT1MA0137.3chr4:62014539-62014550TTTCCCAGAAA-6.02
STAT3MA0144.2chr4:62014539-62014550TTTCCCAGAAA-6.32
TBR1MA0802.1chr4:62014157-62014167TTTCACACCT-6.02
TBX2MA0688.1chr4:62014157-62014168TTTCACACCTC-6.14
Enhancer Sequence
ACTGATGGTA TTTTGAAAAG GGGAGACAAA AATAGTTTCA CCTGCACTCA GTGTGGAAAG 60
AGTTATGGAA GTAAAGGCTA TCTTAAGATT CACATGAGGA TCCACACTGG AGAGAAACTA 120
TTCACATGCC CTCAGTGTGG GAAGAGTTTT GGAAGAAAAA GGGAACTTAA GATTCACAGG 180
AGGATCCACA CTGGAGAGAA ACCATACACA TGCACTCGGT GTGGAAAGTG TTTTAGCCAA 240
TCATCAAACT TAAAGGGCCA TGAAACCCCC TCGTTTCAGC AGGGTGTTTT CACACCTCTT 300
CTTTGGAAAA AGTCAGAAAA GTGGGCGTGT CCAGCTCTGT TTAGGGGGGA GTGTCGGAGG 360
AACTAAAGTG GGAGGGTGTG GGAGTGTCGA TTTGGGCACG CGCGAGTTTC AGAGTCAAAA 420
TACACACACA CACACACATA CATACAGGAG AATGTGATGG TGTTTAACCT ACATGGACAT 480
CTGTAGTTGA ATTATTAGCC AAATTATTAA ATGGTGGACT TTAACTGCAG TTTGGCTCTT 540
TCATTCAGGG AATTCATTCA TGCCCCTCGC GACACACGAG ATATTTGATT CGAGGAGCTG 600
CTCTAAGCGT GTGTTTTTCA TGCAATGTTT GATACCGCAC GGCGAATGAG AGAAAAAAAA 660
CCCTCTGCAT TTCCCAGAAA CTTAGATGCA CACGACAGGT AGTGTCAGAA AGCCACGCGT 720
GTTATTCCGG TCACTAAATG CGGTAAAAAC CCTACACGAG GTTAAAGTTT GGTTGTGGTG 780
CTAACGTGTT AACACTCTGT GCAATAGTTT GTTAGATACG AACAAACTGA ATAAACAAAG 840
AGCACTGGTC GCTCACTTAC CAAATCTGTA GAGACAGGAC AATCACCAGC AACTAGAGCC 900
GCGTCTTTAT GAAGAGAATA CTACAAACGA TTCCAGATCC CAGCGTTTGC AGATGAGAAC 960
AGCTCTCAGG TAAACAATAA TCCTCCTTAG ACACGTAATT GTTGTCGCGC GTCGCGTACA 1020
CTGTAATCCA CACGTGAGTC TGAGCTCTCA CAGAGAGAAA ATGAAAACGA AACTTAACTG 1080
CAGCAAACTA TAAAAGCAAC ACTTCACGCT TGTTTTGCCA ACACAACGTG GCGTCTCTGT 1140
CCTGAAAACA CGGTGATAGT AATGAATATT AATGAAGTTG CACAATAGAG CGCGCTGATT 1200
GGTTTGACCC AAGCCTTACT CATGCATTAA TGCAACACAC TGTAAGACGT AATAAGACAC 1260
ACTCTGGCAC AGACGCCCAG TCTGCACGCT GGAATACACG CTATTATGTC ATGACCGTGA 1320
CCGAAACAAA TTCGTTTCAA ACAGGAAGTA CGAATTTGCT TGAAATAACG CAAAAACAAC 1380
CAATTTACAC TTTTTAGTGA AATATAGGGG TCCTAATAGT GTTTTTAGCA GTGTGGGACA 1440
CATATACGAC TGTCAACAGC TCAAAAAATG TGTTTTGGTG TTTCGTGACC CTTTAAATCA 1500
ACACATGAGG ATCCACACTG GAGAGAAACC ATTCACATGC ACTCAGTGTG GAAAGAGTTT 1560
CAGCCGATCA TCACACCTTA ATGAACACAT GATGATTCAT ACCGGAGAGA AACCATTCAC 1620
ATGCACTCAG TGTGGGAAGA GTTTTGGAAG AAATTTCGAT CTTAAGATTC ACATGATGAT 1680
CCACACTGGA GAGAACCCAT TCAGATGCAC GCATTGTGCG AAGAGTTTTA GCCAATCATC 1740
ATCCCTTAAT CAACACAAGA AGATCCACAC TAGAGAGAAA CCCTTTACTT GCACCCAGTG 1800
TGGAAAAACC TTTAACTACT CATCACACCT TTATGAACAC ATGCGGATCC ACACTGGAGA 1860
GAAACCATTT ACATGCACTC AGTGTGGGAA GAATTTCAAC CAATCATCAA ACCTTAATCG 1920
ACACATGAGG ATCCACACTA GAGAGAAACC ATTCACATGC ACTCAGTGTG GGAAGAGTTT 1980
CATCTGCTCA TCATCCCTTA ATCTACACAT TATGAGCCAC ACTGGAGAGA AACTTGCACT 2040
TAAGCAGCGG TCACAATGGA CTTTTTTCCC CATGGATTTC CATTCATACG CACGGGAATG 2100
TGTCAGACCG GAAACCACGT TTGTGTGTCA AGTTTCGCAG TTCACTGCAT TGCAAAGTTC 2160
AAGCTTGGTG AACTCTGACC TGCAAAATCG CATCACTTGA CTGTGTGAGA CCAATCAAAG 2220
ATCAAAACAT GACCTTTCTG GACAGAAATG TAAAATATGG ACCAATAGCT CGCTT 2275