EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-47226 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:60977183-60978050 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESR1MA0112.3chr4:60977952-60977969GAGGTCATGGAGACCTT-6.39
FOXF2MA0030.1chr4:60977546-60977560AATGTTTACGTTTC-6.34
LMX1BMA0703.2chr4:60977850-60977861ATTTTAATTAA+6.62
NR2C2MA0504.1chr4:60977944-60977959CTAGGTCAGAGGTCA+6.84
Nr2f6MA0677.1chr4:60977945-60977959TAGGTCAGAGGTCA+6.55
RXRBMA0855.1chr4:60977945-60977959TAGGTCAGAGGTCA+6
RXRGMA0856.1chr4:60977945-60977959TAGGTCAGAGGTCA+6.18
RxraMA0512.2chr4:60977945-60977959TAGGTCAGAGGTCA+6.03
SOX13MA1120.1chr4:60977259-60977270TTCCATTGTTT-6.32
Enhancer Sequence
TCCCCGCGCA GGTTCGAATC CTGCCGACTA CGTCCTCAAA CTTTTTAAAA TTGCAGCAGT 60
CATCAATTGT TTGCATTTCC ATTGTTTCTT GGGAAAAGCG TTGTGCTGGT AGGAGGAGAA 120
AAACAACAGC GTGTTCTCAC TGAACAGAAA GGGGGCATAT CACAGGGAGG AACATGCCAC 180
ACAAGAGCTA CAATGGCTGT CCCGTAGCTC GCCGTGATCG TATAGTGGTT AGTACTCTGC 240
GTTGTGGCCG CAGCAACCCC GGTTCGAATC TGGGTCACGG CAGGTTTTGC AAGGTGACAT 300
CGGTGTTGCC ATCAATAATC TCCAACCACA TTTTAGTGCA GGCTGTGCTA CTGGCACGTC 360
CTGAATGTTT ACGTTTCCTA AAGTGTGGAA GACTAGGGAT TCGATATGAG AAACAGGATC 420
TTTGATGCCA GCATGCTGTG TAGATAAGTA CTGATCAAGT CACGCTTCTA AGGCATGGAA 480
GGAATCTTTT CAATTGTTGA CTTGTGGCAA TTCATTGCCA CAACAGCAGA AAGACCTTCT 540
GCAGTTATCA TTGATCTATT TAATGTCTCC TATGAAGGAT TCGGATTTCT GTTTTCCAGT 600
CCATCTCATC ATGGACCAAC GTTTATCCTT TTCATCATCC TGTTTCTCAG TATTTAACTG 660
TGAATTGATT TTAATTAATG AATAAGTTAA CACATTGCTT AATATAAGAA TGTTCAGTGC 720
ATTTGCCTGT CTCTTTATAC CTATTTTCAG GAGCCAGCAA ACTAGGTCAG AGGTCATGGA 780
GACCTTGAGT GGAACTGAGG GCTGAGGACT GGAAACAACT GTTTCTATTG TTATTTCTAG 840
GAGTTAATAC TGTCTAAAAT GTCTAAA 867