EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-46845 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:58421327-58422943 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MIXL1MA0662.1chr4:58422661-58422671GTTAATTAGA-6.02
NFYAMA0060.3chr4:58422271-58422282GGCCAATCAGA+6.02
ZNF384MA1125.1chr4:58422159-58422171TTTTTTTTTAAT-6.74
Enhancer Sequence
GTGCTGCAGC TGCTCTGACA AAAATAACTA ACGTTTGCAA CCTCCTCCTG GAGAAGAGAA 60
AGTCTCAGAG CCTGGATCAC AGTTCTTCTT GGGAGGGACT GTCACATGCT CGGTGTAAGA 120
GCATCCTATC GACACCACAA CTTGCCATGA CAACAAAGCA CAGCATGCGT TTTAGGAACT 180
CCATGTTCAC CGAGCCGTGT CCTCTTTCCA AGGACCATGC TAATGAGCAC AGCTGATGCG 240
GACTGGGCCA GTGGCGCAAT GGATAACGCG TCTGACTACG GATCAGAAGA TTCTAGGTTC 300
GACCCCTGGC TGGCTCGTTC AGGATTTTTT TGCGTTTCTC TCAGTGCAGT GCGGTCGCGG 360
TTTGCCCCTG CCGGAGTTGT TCGGTTCTAC TCTGGAGTGA ATCGAGTTTC TGGGGCCGCC 420
AGCACAGAGC CTGTGGGGTG CTCTCCTGGG TTCAAAGGCT GCCCCAACTG CTCTAATGTC 480
TTGGTCCCGT ACATCCCTCA GGACTTCCAG AAGAAACCAG TAAAGCCACT CTCCTGGGAA 540
GATGGCAGTG ACAGCTTGTA GACCAAAATG TTTGCTGTGA GGCTAAGGCG TTCTACTGCA 600
GCACAGATAC GCATTCGAAA AGCAGACAAT ATTCAAAAAC AAAGTGCCAA CCTAAAACAA 660
GATTGCAGTC AAAATGACCA CCTCAGACAA GTGTGAGCAA TGTTTCAGTC TCTGTTATAT 720
GTCGGCAAAT ATGCCACACA GTGCAGACTG GGCCAGTGGC GCATACTGTC ACCTGTAAGT 780
TGTGGTTATT CTTGGTTACA CCGGCCAATC ACGTTCTGAG TTGGAACCAA GATTTTTTTT 840
TAATTCTTGG TCATGCTGGC CAATCACGTC CCGAGCTGGA ACCAAGATTC ACCCTATTCT 900
TTGTTACGGC AGCCAATCGT GTTCCGAGTT ACAATGAACG CTATGGCCAA TCAGAGCCCT 960
TATACCATTC AAGATTTGTA CTGTTATAAC AGATTTCGTT GCAGATTAAT TCGGACAACA 1020
ATTGCAAACT AAGTATTTTT ATAACAAGTT GGTTTAAATG AATAACCATT ACAGTAACGT 1080
TGAATACTAC ACTGTTAAAA ATTGTCCCGT TAAAAAACAG TAAAATACTG GCAGCTGCAG 1140
TTGCCAGCAA TGTACTGTTA TTTTACAGTA TGTTGCTGTA AAAATACATG GACTACATTG 1200
ATTTACACAA TACTCAAGTG AACTCATTTT GCTCACTGAA AGCAACTGCC TCAACTTGGT 1260
CAACTGCTGA ATGAGTTTAT GAAGTAATGT GCTATATATG CTTAGAAGCA TACTTATAAT 1320
GATAACTTAT TTTAGTTAAT TAGAAAAGTT CAGTTTAACT CTAATGTCTT ATTTTTCACA 1380
ACAGCACACA TACATGTAAA TCTGGAATCA CCAGAGAGAT TCTGACTGCA TCAGCAACTA 1440
AACAGCCGCT ATCTTTAAAT AGAAAAAAAC CATGCAAAAT AACATCAGCA GTTCATTGTT 1500
CATCTTTAAC TCATACACTG GCTCTACTCT CCTCCACAAC GGTGACAGAC AGAAGAAATT 1560
AGCTTCAGGT CTTACAGTAA AATACTGTTT TTTCCTTGAT TTAACAGTAA TCTACT 1616