EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-46627 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:57381936-57385199 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F7MA0758.1chr4:57383988-57384002TTTTCTCGCCAAAA+6.64
E2F8MA0865.1chr4:57383989-57384001TTTCTCGCCAAA+6.27
ESRRBMA0141.3chr4:57382380-57382391TCAAGGTCAAT+6.02
Foxd3MA0041.1chr4:57382360-57382372AAACAAACAAAC-6.32
IKZF1MA1508.1chr4:57382451-57382463ACTTCCTGTTTG-6.02
IRF7MA0772.1chr4:57383327-57383341AAGAAAACGAAACT+6.09
IRF9MA0653.1chr4:57383326-57383341AAAGAAAACGAAACT+6.22
PKNOX1MA0782.1chr4:57382500-57382512TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX1MA0782.1chr4:57382500-57382512TGACAGCTGTCA-6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:57382500-57382512TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:57382500-57382512TGACAGCTGTCA-6.92
TGIF1MA0796.1chr4:57382500-57382512TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF1MA0796.1chr4:57382500-57382512TGACAGCTGTCA-7.22
TGIF2MA0797.1chr4:57382500-57382512TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF2MA0797.1chr4:57382500-57382512TGACAGCTGTCA-7.22
Enhancer Sequence
CTCCATTGTT ACTTCATACT CCCTTGTTTG TTTGGGTCTC ACCGCCAGAA TTCTTCCTTC 60
TCCAATCAGC TCCGTGACTG CTTTGATTAT ATCAAATCTT CTTGCATCTT TTACATTTCT 120
ACGTCTACAG TTACTGTTGC TTTCTTTGTG CATACTCTTC TTTGTATCTC TTGCTTATCC 180
TTACCTTTTT CACCTCTTCG TTGGCCGGGC TCTTCATTTT ATTTATCTCT TTGTCTGTTG 240
TCAAGTCCAT TTTCTTTATC TCTTCGTCTA TCATCCAGCC CATTTTCTTT ATCCTTTCGT 300
GCAAGTCCCT CCATTTCCAT GTCGTTGCCG GGTAATCTGT CCATGATTAA AAATAAAACA 360
CACAACATAA CCACCCTCAA GTCAGCAAAA TGCTGCTGTT AGGTGGTTTT TAAAGACAAA 420
AAGAAAACAA ACAAACAAAA ACACTCAAGG TCAATAAACA AAAAGGTAGA CAAACAAAAT 480
GGGGAGAGCC TTTCTCTCCT TACTGCTGCC AACTCACTTC CTGTTTGCTC TATAGCCCCC 540
TCAGGGTGGT GTGGCCGTAA GCAATGACAG CTGTCAAGTG TTGGCTATTG AAACTAGGCG 600
CAGCCCCAGG AGGCGAGCAC AGATTAGCTG CCTGCAGCGC CAATGAGTGA GAATAGACGG 660
AGCTGGGCAA GCTGTGAAGC ACCAGATTCC ATGTACTGCG GTGTGGCTCC CAGGAGACAG 720
CTCCTGCCAA GCTTGCATGT CAGGATGGCC GAGCGGTCTA AGGCGCTGCG TTCAGATCGC 780
AGTCTCCCCT GGAGGCGTGG GTTCGAATCC CACTTCTGAC AAACCGAGCC TGCGGCAGTG 840
CGCTCAGGCT GAATTCTTTA ACTCTCTGCC CCCATGTCCG AATGATACAG TAACACTGAC 900
AAAGTGCCGC ATCACGCAGG CTTTTATGCA AGTGTACTGA AAGGGGATCA AAAGAATTGT 960
CCTGGGATAG TGTTGCTTTT TAAGGTTTGC AGGGCATTTT TTTCGTCAAA TCCTCGTACA 1020
ACGTCAAGTC ATGACATTTG ACAGATCCAT GCCCTTGTAT CGTGGATCAT CCAGTGAGCA 1080
GAGAGCCAAT TGAGAATGTG CGTAAAAGCA AATCTGAATG TTTCCGCCCA GTTGCTAACA 1140
GGAGACTCTC CGCTTGTAAA GCCATCGTGA TAACCACAGG AGCCTCCGGT TAGGGTGAGA 1200
GCACTGTCTT GTGGTGCCAG CGCAGAGAGA CGGAAAGTCA CTTTCCACAA TGTTTTCATT 1260
CAATGTTCTA CGCTGGTGGA ATCACCTTCC CATTCCCAGT CGGATTACGG ATACACTGGT 1320
GTCCTTCAAA CGACAGCTAA CACCCATCTC TTCAGAGTAC ACCCGAACCC CGGTGAATAT 1380
CCCTCTCTCT AAAGAAAACG AAACTCCTAC TCCAGCACTA AATTCTCTGA GCACAAACAA 1440
ATTACTTGGA ATAAATAGCC CTTTTTCGTA TGCATTGCCT CGTCTTGTTG AATACCTCCA 1500
CTATTGTATG TCGCTTTGGA CAAAAGTGTC CGCTAATTGT ATGCTTCCGC CCAGTTTCGA 1560
ACAGGAGACC TTTAGCGTGT AATGCAAACA TGATAAACAC TACACTACGG AAACCAATAG 1620
GCCAGTGCTG CTTCAAGTAT TTATAGTCTT TTTTTTATAG AGCTGTCTTG TACGGTCTGC 1680
ACCGTGAAGG GCCAGCAAAC GCACTGGCCA CCTGCTCATG CACAACACAA AGCTAAAAGA 1740
AATCAGATTC TACGCAAGTT TGCGACACCG CGAGGGGCGG TAAACACTGA GTTAAATTCA 1800
AACTTCTAGC CTCACACCGC TCTGCAGAAA GAATGTTTTT AGTGAACGTC AGTACTCAAC 1860
AGAAGCCTGA TTTGACAATT GTCATAAAAG CCAGAGGTTG TTTCCGCCCA GTTTCGAACT 1920
GGGGACCTTT CGCGTGTGAG GCGAACGTGA TAACCACTAC ACTACGGAAA CCTTCAGGCA 1980
AATCGAGCTG ATAACCCTTT TTGATTGGGT GCCTGTCGAC GATCATTGCT GGTGCGGCAG 2040
TGGATGCTAT TATTTTCTCG CCAAAAGAAG AGCACGGTTT CTGCTCGGTT TCAAACCGAG 2100
GACCTATCGC GTGTTAGGCG AACGTGATGA CCACTACACT ACAGAAACCC CACAAGTGCT 2160
TTCACCAGCG AAGTTAGGCC TGCAAGGATA AAACAAGGCG TACGCGTTGG TCAATCGAGC 2220
GGACAAAGCC AACTCAGCGT GACAAGCTCC CTGCAGGTAT TAGGGCCAAT TTACAATCCG 2280
GGCCCGACAC AGCTGTACAG GTCCTTGCGA AATGTCCCCT TTCGTCACAT TTGAAGCACC 2340
TGAATTCTGG GCGTTCCTTC ATCACATATT CTGAGCTCAT GCATAGTCGA CAGGTTTTTA 2400
CCTGATTGGT GTGCATGACT CTAAAGTGCT GTGGCGCTTC CGCCGTCTCG ATTTTGGTAC 2460
TGTATGGTAA GGAGACCATC TCTTCCGGAA ATCTGTTTTT TACAAACCTT GTTCCATCTT 2520
CTATGTTTGT GCCAGGATAC AATCTTCTTT TAATTTTAGA TATGGGGAAA ACTGCCCATC 2580
TCTCTAGCTT GCTTAAAATT TCTTCATTTG CTAGGTAAAC AGGCAGATGC TTGAACGAAA 2640
CAACATAGTC TCTGTTTTGT AACCTCCGTA CTTCAGATTT CACTCCTTTA ATTGTCAATC 2700
CATTGTCTAT TAAAATTTCG GTGTCATCTT CAGTCTCCAT TGTTACTTCA TACTCCCTTG 2760
GTTTGTTTGG GTCTCACCGC CAGCATTCTT CCTTCTCCAA TCAGCTCCGT GACTGCTTTG 2820
GTTATATCAA ATCTTCTTGC ATCTTTTACA TTTTCTACTT CTACAGTTAC TGTTGCTTCC 2880
TTTGTGCATA CTCTTCTTTG TACCTCTTGC TTATCCTTAC CTTTCTCACC TCTTCGTTGG 2940
CCGGGCTCTT CATTTTATTT ATCTCTTTGT CTGTTGTCAA GTCCATTTTC TTTACCTCTT 3000
CGTCTATTAT CCAGCCCATT TTCTTTATCC TTTCTTGCAA GTCCCTCCAT TTCCATGTCG 3060
TTGCCGGGGA ATCTGTCCAT GATTAAAAAT AAAACACACT ACATAACCAC CCTTCAGTCA 3120
GCAAAATGCT GCTGTTGAAG ATTTCTATTC TCTCAGTGTG AAGTATTTTC TAAGTGTAAA 3180
GCAGTTAATT TTCTCTTCAC AAAATGTATG TAGTCTTTGC AGCAAACATG CCAGCGTGTG 3240
TTAAAAATAC AGTGATATGT CTG 3263