EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-46530 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:56966682-56969172 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GSX1MA0892.1chr4:56967082-56967092CCTAATTAAA+6.02
PBX2MA1113.1chr4:56968449-56968461GTGATTGACAGC+6.92
PBX2MA1113.1chr4:56968462-56968474GTGATTGACAGC+6.92
RESTMA0138.2chr4:56968360-56968381GGCACTGGTCATTGTGCTGAA-6.16
Enhancer Sequence
TCTGCTTTAC AAATTTTAGG AAAAAAAAAA TCTTATTATG AATATATACA AATAAATATA 60
GGCCATTTAC ATCTTTCAAA TCTGTGTCTT ATCAATATGA CCAAAATGAC TTTTATAATC 120
AATTATGTAA GGAACTCTGA AAACTGGGCT GACACGGTTT CAATTTACTA TAACTTCTAT 180
GTTAAGTGGC TTTGACACAA TATACATTGT AAAAGCACTA GATAAATAAA GATTAATTGA 240
ATCTGCTAAA TCTGTACAGG TTGATGGACC AAACATAAAA TGATCTGATT TATTTACATT 300
TAATGTGCAT CAAAATTACA GTGTGTAGCC AATGTTTCCA GTGTCTTTTC ACTTTTCAGC 360
TTTTGATGAG TTTTTAAGAC TTAATGTTTG TTTTTTCAGA CCTAATTAAA GAGAATGAGG 420
GGAGTAAAGA GGAGGAACAT CATGTCAAAA TTGAGGAAAA AACTAATTTA CAGACTGATG 480
TTATTTTGAA AAGGAGAGAC AAGAATCGTT TCACCTGCAC CTGCCCTCAG TGTGGAAAGA 540
GTTTGGCAAG CAAAAGCAAA CTTAAGATTC ACATGATGAT CCACACTGGA GAGAAACCAT 600
TCACATGCAC TCAGTGTGGG AAGAGTTTCA ACCAATCATC ATCCTTTATT CAACACACGA 660
GGATCCACAC TGGAGAGAAA CCATTCACAT GCACTCAGTG TGGGAAGAGT TTTAACTGCT 720
CATCACACCT TAATGACCAC ATGATGATCC ACACTGGAGA GAAACCATTC GCATGCACTC 780
AGTGTGGAAA GAGTTTCCGC CAATCATCAT CCCTTAATCA ACACACTAGG ATCCACACTG 840
GAGAGAGACC ATTCACATGC ACTCAGTGTG GGAGGAGTTT TAAATGCTCA TCACACCTTA 900
ACCACCACAC GATGATCCAC ACTGGAGAGA AACCATTTAC ATGCACTCAG TGTGGGAAGA 960
GTTTCCGCCA ATCATCATCC TTTAATAAAC ACATGAGGAT CCACACTGGA GAGAAACCAT 1020
TCACATGCAC TCAGTGTGGG AAGAGTTTTA ACTGCTCATC ACAAATTAAT GAACACATGA 1080
GGATCCACAC TGGAAAGAAA CCATTCACAT GCACTCAGTG TGGGAAAAGT TTCAGTCAGT 1140
CATCATACCT AAATAGACAC ACAAGGATCC ACACTGGAGA GAAGCCATTC ACATGTACAC 1200
TGTGTGGGAA AAGTTTTAAC CGCTCATCAC ACCTTAATAA ACACATGAGG ATCCACACTG 1260
GAGAGAAACC ATTCACATGC ACTCAGTGTG GGAAGAGTTT CTGCCAAACA TCATCCCTTA 1320
ATAAACACAT AAGGATCCAC ACTGGAGAGT AACCATTCAC GTGCACTCAG TGTGGAAAGA 1380
GTTGCAGCGA ATCAACATCC CTTAATCTAC ACATGATGCA CCACACTGGA GAGAAACCAT 1440
TCACTTGCAC TTAAGCCGTG GTCACACTGG ACTTTTCTCT CCATAGACTT CCATCAAGTG 1500
TGCCGCAAGC CTGCGTTTGA GTGAAGGTCT TGGCCGTTAG ATCGCCCCCT GGGGGCTGGC 1560
TGCAGTACAA GTCAAAAAGC CCGCCTCCTC CGTGTCAATG ACTCGAGACT TGAGCCCAAA 1620
TAAAAAAATT AATTACACTT GCAAAAAAAT TTCCTGAAAG ATAGTTCTGG TCGATTAAGG 1680
CACTGGTCAT TGTGCTGAAA TAGGTGCAGA TCCTCATTTT TGTAAACAGT TTGTTTTTAG 1740
CTGTAATTTA ATGCTGGGCG TGTCATCGTG ATTGACAGCT GTGATTGACA GCTTCTCAAA 1800
GCAGACCGTC TGAGCTTCGG CAGGAGACTG AAATGTTATT ATTCGATTTC TGTGTTATTT 1860
TACCATGCCA AAATGAGTTC AGCAGTAAAC TATAGTTTCT GACATACATG ATCCTGGTGG 1920
AACACTGTTT ATTAGCTAAG GTCAGGGCTT TTTTTCGGGC TTTATTAGTT TGCTTATACA 1980
CGCCTAGCCA CCCAGATAGC AAAATACACT CCGGCCAGTT CCGGCTAGAT TCTCGCCTGC 2040
CGGAGACTTA CCCCTCAGAC TGACTACTTC TGCTGGACCT ACTCCGGATG CCTGGACTCA 2100
CTGCCCGATT CCAGCCCGAG TCAATCGAGC CAGATGCGGC GGCCGAGCGA GCCGGTGCTG 2160
CCGCATGCAA GCCGGAATCA GCCCGCAACG CCGCGAGTAG GTTATGCGCT GCGGCCCGGA 2220
GCTGGCGCGA TTGAATCTTC ATTATAAAAA ACCCTCACCT TTGTTAACAT TATTACATCC 2280
ATTTGTGTTG ATATGACAGC AAACGCAGGC TACTATGTAA ACGCAAAGTG TATCACTGAG 2340
TTTAACCTTT GAATAAAGAT GCAAACAGCA TACATAGCAA TTATTTAAAT AAAGGACAAA 2400
ATAAAAACCT GTATTGATTG CACAAGTATT AAATAATAAT ACAATTGAAT ACATTTTGTA 2460
GTGCACAAGA ATTAAGAAAT ATAAAAATGA 2490