EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-46490 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:56762619-56764484 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F7MA0758.1chr4:56764387-56764401TTTTCTCGCCAAAA+6.64
E2F8MA0865.1chr4:56764388-56764400TTTCTCGCCAAA+6.27
ESRRBMA0141.3chr4:56762775-56762786TCAAGGTCAAT+6.02
Foxd3MA0041.1chr4:56762755-56762767AAACAAACAAAC-6.32
IKZF1MA1508.1chr4:56762846-56762858ACTTCCTGTTTG-6.02
IRF7MA0772.1chr4:56763727-56763741AAGAAAACGAAACT+6.09
IRF9MA0653.1chr4:56763726-56763741AAAGAAAACGAAACT+6.22
PKNOX1MA0782.1chr4:56762895-56762907TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX1MA0782.1chr4:56762895-56762907TGACAGCTGTCA-6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:56762895-56762907TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:56762895-56762907TGACAGCTGTCA-6.92
TGIF1MA0796.1chr4:56762895-56762907TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF1MA0796.1chr4:56762895-56762907TGACAGCTGTCA-7.22
TGIF2MA0797.1chr4:56762895-56762907TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF2MA0797.1chr4:56762895-56762907TGACAGCTGTCA-7.22
Enhancer Sequence
TTATCCTTTC TTGCAAGTCC CTCCATTTCC ATGTCGTTGC CGGGGAATCT GTCCATGATT 60
AAAAATAAAA CACACTACAT AACCACCCTT CAGTCAGCAA AATGCTGCTG TTAGGTGGTT 120
TTTAAAGACA AAAAGAAAAC AAACAAACAA AAACACTCAA GGTCAATAAA CAAAAAGGTA 180
GACAAACAAA ATGGGGAGAG CCTTTCTCTC CTTACTGCTG CCAACTCACT TCCTGTTTGC 240
TCTATAGCCC CCTCAGGGTG GTGTGGCCGT AAGCAATGAC AGCTGTCAAG TGTTGGCTAT 300
TGAAACTAGG CGCAGCCCCA GGAGGCGAGC ACAGATTAGC TGCCTGCAGC GCCAATGAGC 360
TGGACAGCCG GAGCTGGGCA AGCTGTGAAG CACCAGATTC CATGTCACGG TACTGCGGTG 420
TGGCTCCCAG GAGACAGCTC CTGCCAAGCT TGCATGTCAG GATGGCCGAG CGGTCTAAGG 480
CGCTGCGTTC AGGTTGCAGT CTCCCCTGGA GGCGTGGGTT CAAATCCCAC TTCTGACAAA 540
CTGAGGCTGC GGCAGTGCGC TCAGGCTGAA TTCTTTAACT CTCTGCCCCC ATGTCCGAAC 600
GATACAGTAA CACTGACAAA GTGCCGCATC ACACGGGCTT TAATGCAAGT GCACTGAAAG 660
GGGATCAAAA GAATTGTCCT GGGATGGTGT TGCTTTTTAA GGTTTGCAGG GCATTTTTTT 720
CGTCAAATCC TCGTACAACG TCAAGTCATG ACATTTGACA GATCCATGCC CTTGTATCGT 780
GGATCATCCA GTGAGCAGAG AGCCAATTGA GAATGTGCGT AAAAACAAAT CTGAATGTTT 840
CCGCCCAGTT GCTAACAGGA GACCCTCCGC TTGTAAAGCC ATCGTGATAA CCACAGGAGC 900
CTCCGGTTAG GGTCAGAGCA CTGTCTTGTG GTGCCAGCGC AGAGAGACGG AAAGTCACTT 960
TCCACAATGT TTTCATTCAA TGTTCTACGC TGGTGGAATC ACCTTCCCAT TCCCACTCGG 1020
ATTACGGATA CACCGGTGTC CTTCAAACGA CAGCTAACAC CCATCTCTTC AGAGTACACC 1080
CGAACCCCGG TGAATATCCC TCTCTCTAAA GAAAACGAAA CTCCTACTCC AGCACTAAAT 1140
TCTCTGAGCA CAAACAAATT ACTTGGAATA AATAGCCCTT TTTCGTATGC ATTGCCTCGT 1200
CTTGTTGAAT ACCTCCACTA TTGTATGTCG CTTTGGACAA AAGTGTCCGC TAATTGTATG 1260
CTTCCGCCCA GTTTCGAACA GGAGACCTTT AGCGTGTAAT GCAAACATGA TAAACACTAC 1320
ACTACGGAAA CCAATAGGCC AGTGCTGCTT CAAGTATTTA TAGTCTTTTT TTATAGAGCT 1380
GTCTTGTACG GTCTGCACCG TGAAGGGCCA GCAAACGCAC TGGCCACCTG CTCATGCACA 1440
ACACAAAGCT AAAAGAAATC AGATTCTACG CAAGTTTGCG ACACCGCGAG GGGCGGTAAA 1500
CACTGAGCTG AATTCAAACT TCTAGCCTCA CACCGCTCTG CAGAAAGAAT GTTTTCAGTG 1560
AACGTCAGTA CTCAACAGAA GCCTGATTTG ACAATTGTCA TAAAAGCCAG AGGTTGTTTC 1620
CGCCCAGTTT CGAACTGGGG ACCTTTCGCG TGTGAGGCGA ACGTGATAAC CACTACACTA 1680
CAGTAACCTT CAGGCAGATC GAGCTGATAA CCCTTTTTGA TTGGGTGCTT GTCGACGATC 1740
ATTGCTGGTG CGGCAGTGGA TGCTATTATT TTCTCGCCAA AAGAACAGCA CTGTTTCTGC 1800
TCGGTTTCGA ACCGAGGACC TTTCGCGTGT TAGGCGAACG TGATGACCAC TACACTACAG 1860
AAACC 1865