EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-46318 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:55708455-55710986 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESRRBMA0141.3chr4:55709673-55709684ATTGACCTTGA-6.02
Foxd3MA0041.1chr4:55709692-55709704GTTTGTTTGTTT+6.32
IKZF1MA1508.1chr4:55709601-55709613CAAACAGGAAGT+6.02
IRF7MA0772.1chr4:55708718-55708732AGTTTCGTTTTCTT-6.09
IRF9MA0653.1chr4:55708718-55708733AGTTTCGTTTTCTTT-6.22
PKNOX1MA0782.1chr4:55709552-55709564TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX1MA0782.1chr4:55709552-55709564TGACAGCTGTCA-6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:55709552-55709564TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:55709552-55709564TGACAGCTGTCA-6.92
TGIF1MA0796.1chr4:55709552-55709564TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF1MA0796.1chr4:55709552-55709564TGACAGCTGTCA-7.22
TGIF2MA0797.1chr4:55709552-55709564TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF2MA0797.1chr4:55709552-55709564TGACAGCTGTCA-7.22
ZNF384MA1125.1chr4:55710671-55710683TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:55710672-55710684TTTTTTTTTTTT-6.22
Enhancer Sequence
TTTTTTTCTA AGGTGGTACT TGGTGAAAAA AGTTTGAGAA CCACTGGCCT ATTGGTTTCC 60
GTAGTGTAGT GTTTATCATG TTTGCATTAC ACGCTAAAGG TCTCCTGTTC GAAACTGGGC 120
GGAAGCATAC AATTAGCGGA CACTTTTGTC CAAAGCGACA TACAATAGTG GAGGTATTCA 180
ACAAGACGAG GCAACGCATA CGAAAAAGGG CTATTTATTC CAAGTAATTT GTTTGTGCTC 240
AGAGAATTTA GTGCTGGAGT AGGAGTTTCG TTTTCTTTAG AGAGAGGGAT ATTCACCGGG 300
GTTCGGGTGT ACTCTGAAGA GATGGGTGTT AGCTGTCGTT TGAAGGACAC CGGTGTATCC 360
GTAATCCGAG TGGGAATGGG AAGGTGATTC CACCAGCGTA GAACATTGAA TGAAAACATT 420
GTGGAAAGTG ACTTTCCGTC TCTCTGCGCT GGCACCACAA GACAGTGCTC TCACCCTAAC 480
CGGAGGCTCC TGTGGTTATC ACGATGGCTT TACAAGCGGA GGGTCTCCTG TTAGCAACTG 540
GGCGGAAACA TTCAGATTTG CTTTTACGCA CATTCTCAAT TGGCTCTCTG CTCACTGGAT 600
GATCCACGAT ACAAGGGCAT GGATCTGTCA AATGTCATGA CTTGACGTTG TACGAGGATT 660
TGACGAAAAA AATGCCCTGC AAACCTTAAA AAGCAACACC ATCCCAGGAC AATTCTTTTG 720
ATCCCCTTTC AGTGCACTTG CATTAAAGCC CGCGTGATGC GGCACTTTGT CAGTGTTACT 780
GTATCATTCG GACATGGGGG CAGAGAGTTA AAGAACTCAG CCTGAGCGCA CTGCCACAGG 840
CTCGGTTTGT CAGAAGTGGG ATTCGAACCC ACGCCTCCAG GGGAGACTGC GACCTGAACG 900
CAGCGCCTTA GACCGCTCGG CCATCCTGAC ATGCAAGCTT GGCAGGAGCT GTCTCCTGGG 960
AGCCACACCG CAGTACCGTG ACATGGAATC TGGTGCTTCA CAGCTTGCCC AGCTCCGGCT 1020
GTCCAGCTCA TTGGCGCTGC AGGCAGCTAA TCTGTGCTCG CCTCCTGGGG CTGCGCCTAG 1080
TTTCAATAGC CAACACTTGA CAGCTGTCAT TGCTTACGGC CACACCACCC TGAGGGGGCT 1140
ATAGAGCAAA CAGGAAGTGA GTTGGCAGCA GTAAGGAGAG AAAGGCTCTC CCCATTTTGT 1200
TTGTCTACCT TTTTGTTTAT TGACCTTGAG TGTTTTTGTT TGTTTGTTTT CGTTTTGTTT 1260
TTAAAAACCA CCTAACAGCA GCATTTTGCT GATTGAAGGG TGGTTATGTA GTGTGTTTTA 1320
TTTTTAATCA TGGACAGATT CCCCGGCAAC GACATGGAAA TGGAGGGACT TGCAAGAAAG 1380
GATAAAGAAA ATGGGCTGGA TAATAGACGG AGAGGTAAAG AAAATGGACT TGACAACAGA 1440
CAAAGAGATA AATAAAATGA AGAGCCCGGC CAACGAAGAG GTGAGAAAGG TAAGGGTAAG 1500
CAAGAGGTAC AAAGAAGAGT ATGCACAAAG GAAGCAACAG TAACTGTAGA AGTAGAAAAT 1560
GTAAAAGATG CAAGAAGATT TGATATAACC AAAGCAGTCA CGGAGCTGAT TGGAGAAGGA 1620
AGAATGCTGG CGGTGAGACC CAAACAAACA AAGGGAGTAT GAAGTAACAA TGGAGACTGA 1680
AGATGACACC GAAATTTTAA TAGACAATGG ATTGACAATT AAAGGAGTGA AATCTGAAGT 1740
ACGGAGGTTA CAAAACAGAG ACTATGTTGT TTCGTTCAAG CATCTGCCTG TTTACCTAGC 1800
AAATGAAGAA ATTTTAAGCA AGCTAGAGAG ATGGGGAGTT TTCCCCATAT CTAAAATTAA 1860
AAGAAGATTG TATCCTGGCA CAAACATAGA AGATGGAACA AGGTTTGTAA AAAACAGATT 1920
TCCGGAAGAG ATGGTCTCCT TACCATACAG TACCAAAATC GAGACGGCGG AAGCGCCACA 1980
GCACTTTAGA GTCATGCACA CCAATCAGGT AAAAACCTGT CGACTATGCA TGAGCTCAGA 2040
AAATGTGATG AAGGAACGCC CAGAATTCAG GTGCTTCAAA TGTGACGAAA GGGGACATTT 2100
CGCAAGGACC TGTACAGCTG TGTCGGGCCC GGATTGTAAA TTGGCCCTAA TACCTGCAGG 2160
GAGCTTGTCA CGCCGAGTTG GCTTTGTCCG CTCGATTGAT CAATGCGTAC GCCTTGTTTT 2220
TTTTTTTTTG GGTTTCTGTA GTGTAGTGGT CATCACGTTT GCCTAACACG CGAAAGGTCC 2280
TCGGTTCGAA ACCGAGCAGA AACAGTGCTC TTCTTTTGGC AAGAAAGTAA TGGCATCCAC 2340
TGCCGCACCA GCAATGATCG TCGACAGGCA CCCAATCAAA AAGGGTTATC AGCTCGATCT 2400
GCCTGAAGGT TTCTGTAGTG TAGTGGTTAT CACGTTCGCC TCACACGCGA AAGGTCCCCA 2460
GTTCGGAACT GGGCGGAAAC AATCTCTGGC TTTTATGACA AAGCGACATA CAATAGTGGA 2520
GGTATTCAAC A 2531