EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-46186 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:55090146-55091334 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MIXL1MA0662.1chr4:55090150-55090160TCTAATTAAC+6.02
NFYAMA0060.3chr4:55090539-55090550TCTGATTGGCC-6.02
ZNF384MA1125.1chr4:55090650-55090662ATTAAAAAAAAA+6.74
Enhancer Sequence
CTTTTCTAAT TAACTAAAAT AAGTTATCAT TATAAGTATG CTTCTAAGCA TATATAGCAC 60
ATTACTTCAT AAACTCATTC AGCAGTTGAC CAAGTTGAGG CAGTTGCTTT CAGTGAGCAA 120
AATGAGTTCA CTTGAGTATT GTGTAAATCA ATGTAGTCCA TGTATTTTTA CAGCAACATA 180
CTGTAAAATA ACAGTACATT GCTGGCAACT GCAGCTGGCA GTATTTTACT GTTTTTTAAC 240
GGGACAATTT TTAACAGTGT AGTATTCAAC GTTACTGTAA TGGTTATTCA TTTAAACCAA 300
CTTGTTATAA AAATACTTAG TTTGCAATTG TTGTCCGAAT TAATCTGCAA CGAAATCTGT 360
TATAACAGTA CAAATCTTGA ATGGTATAAG GGCTCTGATT GGCCATAGCG TTCATTGTAA 420
CTCGGAACAC GATTGGCTGC CGTAACAAAG AATAGGGTGA ATCTTGGTTC CAGCTCGGGA 480
CGTGATTGGC CAGCATGACC AAGAATTAAA AAAAAATCTT GGTTCCAACT CAGAACGTGA 540
TTGGCCGGTG TAACCAAGAA TAACCACAAC TTACAGGTGA CAGTATGCGC CACTGGCCCA 600
GTCTGCACTG TGTGGCATAT TTGCCGACAT ATAACAGAGA CTGAAACATT GCTCACACTT 660
GTCTGAGGTG GTCATTTTGA CTGCAATCTT GTTTTAGGTT GGCACTTTGT TTTTGAATAT 720
TGTCTGCTTT TCGAATGCGT ATCTGTGCTG CAGTAGAACG CCTTAGCCTC ACAGCAAACA 780
TTTTGGTCTA CAAGCTGTCA CTGCCATCTT CCCAGGAGAG TGGCTTTACT GGTTTCTTCT 840
GGAAGTCCTG AGGGATGTAC GGGACCAAGA CATTAGAGCA GTTGGGGCAG CCTTTGAACC 900
CAGGAGAGCA CCCCACAGGC TCTGTGCTGG CGGCCCCAGA AACTCGATTC ACTCCAGAGT 960
AGAACCGAAC AACTCCGGCA GGGGCAAACC GCGACCGCAC TGCACTGAGA GAAACACAAA 1020
AAAATCCTGA ACGAGCCAGC CAGGGGTCGA ACCTAGAATC TTCTGATCCG TAGTCAGACG 1080
CGTTATCCAT TGCGCCACTG GCCCAGTCCG CATCAGCTGT GCTCATTAGC ATGGTCCTTG 1140
GAAAGAGGAC ACGGCTCGGT GAACATGGAG TTCCTAAAAC GCATGCTG 1188