EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-46149 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:54787040-54789812 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr4:54789669-54789684TTTGTTTGTTTTGTC-6.05
Lhx3MA0135.1chr4:54789740-54789753TAATAATTAATTA-6.18
Lhx3MA0135.1chr4:54789743-54789756TAATTAATTATTT+6.71
SPIBMA0081.2chr4:54787360-54787372GATGCGGAAGTA+6.14
TP63MA0525.2chr4:54788717-54788735CACATGTCAGAACTTGAT-6.1
ZNF384MA1125.1chr4:54788662-54788674AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:54788663-54788675AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:54788664-54788676AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:54787657-54787669TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
CTTATATATG ATTAATTCTA GCTTTGCTAT TGCTAGAAAA GATTTCGTTA TCATGCATCT 60
CTCTGTAAGC CAACACTGGC CTCACTATGA ACCTGCTCGG TTCTTCTCAC AATAGAGTTA 120
AATTACACTT CTCTGACTGC TGTTCTGTCT GCATGGTCTG TTCAAAGGCT TATAATTGTA 180
TGGCTGTGGT CTGTCGTTTG TGTGAGTCTC TCAGAATATC TTATCTCAGC ATCCAAACGC 240
GCACCGCGAT CCGTTGTCTT CATAGTGTTA TTTGCGCAAA CTCCCTTATC CGACGTCACT 300
TCAGGCCGGA CGATTTTTCA GATGCGGAAG TAAATTTCCG TGACTAAAAA CGACTCCAAA 360
CAACTTAATA ATAAACTTTA ACGTATATTT TAAAGAAAAT CTAGTTCCTA CTTTACTCTT 420
ACACACATTG TCTCACTGGG GTGTCTAACC TACAATATGC TCTTTAAAGA ATGATTATCC 480
GAGGATTCCC GTTTTATATA CTCTTCCCAA AATCCATAAA TCATTACAGG ACCCTCCTAT 540
GCGACCTATA GTTTTAGGGA ATGAATCATT AACAGAACCT ATATCAAAAT TTATTGATTC 600
ATTAATTCAA CCAATAGTAA AAAAAAAAAT TGCCATCATA TTTAAAGGAT ACCACTGAAT 660
TTTTAAATAG ATTGAATCAA ATTTCTAAAA TAGATACTAC AGATTGGCTT GTAACACTTG 720
ATGTGACTTC TTTGTACACG AATATACCAC ATAAAGCAGG TTTGGACGCA TTAAAATTCT 780
ATTGTATTAA CAATGATGAA AGATTACCAA CACAATATAT ACTAGACCTC ACAAAAATTA 840
TTTTAACCTA GAATTATTTT CTATTTGAGA AAGACTTTTA TCTGCAAGTG CAAGGTACTG 900
CCATGGGCAC CCTATTGGCA CCAAATTATG CAAACTTATT TATGGGCAAA TTCAAACACG 960
ACTACATTTA CAATGATAAT CCATTTCAAT CAAACATCAA AGTTTGGATG CGATATATAG 1020
ACGATTGTTT CATGATATGG TCGGGCACAG AACAAGAATT AGATTCATTC ACCACATTTA 1080
TAAATTCACA ATAGAAAAAA GTATAGACTC GATACATTTT TTGGATGTAA AAGTGAGTAA 1140
AGTAAATGAG ATACTACAAA CAACAATATA TCGAAAACCA ACAGATAAAA ACACAGTTTT 1200
ATCTATGGTC AGTTACCATC TGGTCCATAT AAAACAGAGC TTACCAGTGA GTCAGTTACA 1260
TAGACTGAAA CGTAACTGTA GTACTGCAGA AGAGTTTGAT AAACAGAAAA ACATATTATT 1320
TCAAAGATTT CGCTCGAGAG TATATCCACA AAAGTGGTTA AATGATGCGT TAGGTAAGGT 1380
AAATGAATTG CATCGACAAG ATATTTTAAA AACAGTAACG CCGACTAAGA AATCAAAAGA 1440
GTTTTCAGTA AATTGCACCT TAACATACAA CGAACACAGC AATTTTATTA AATCAACGAT 1500
CCATAAACAT TGGCATATAT TATCCACTGA CGATTCCTTA AATAATACAT TTCAATACAA 1560
TCCATTATTC ACTTTAAAGA GATCAAAAAA TTTATCAGAT ATGATTATTA TTCTGATACA 1620
GCAAAAAAAA AAAAAATCTA CTTACATACA AGGCTGTTTT CCATGCAGAA ATTGTGCCAC 1680
ATGTCAGAAC TTGATAAAGT GCAAAGAATT TTTTAATTCA ATAACAGGTA AGAATAATAA 1740
AATAAAAATA TGTATTACCT GTTCTACACG TAATATAATT TACATGTTAA AATGTCCCTG 1800
CCAAAAAATA TACATAGGTA AGTCTTTACG ACCGTTGAAG TTGCAAATTA TCGAACATAA 1860
ATCAAGTATA CGACGACAAG ACATAACCTC GGCAGTTACA AGACACTTTA TGGAATGCAA 1920
ACATGACGTT AAACAACTAG AGTGCTTAGG GATTGAAGAG GTGTTTGAGT CACGTAGAGG 1980
AGGTAATTTA AATAAAAGAT TATTACAAAG AGAAGCGTTC TGGATTCATG AATTAAAGTC 2040
ACTTGCACCA AAAGGAATGA ATGAGGAGCT GGATCTGTCT GCGTTTCTTT AAAAACTCTG 2100
TTATTTAATC GATATTAGGA ATTGTAAATC TTGACCTTTA AAGTTATTGA CAAAAATAAA 2160
AAATGAAATT TTTTTTTGAA CTTCGGAATA AAGTAGATAA AAATGGGAGA ATAATTTTAA 2220
TTGATAGGTT TCTTGTGAAA TAATATTTTA GGAGGTAAGG GTATTTTTCT TGTGCTTGAT 2280
CATGATATAT TGAAGTGAAA CAGAAGCTGT TGGTTAACAC TGTGATAATT GATATTCAAA 2340
CTGCATTATA CTTTGAAAAT GGTTATTGTC CCATGCCTCA GCAGCACAAC ACTGTTTTTA 2400
GGATCTAAAA ATTTATTCTT TAAAAAAAAG TCTCAAGCAA AAAGATTCCA ATGGCTCCGT 2460
CTACTGGTAC ATGAAGAATA TGTTCAATAT TCTGACGAAC TTTACACTTA AATGTTTGCA 2520
TATCATCAGC ATGCTGTAAT CCATTTCTTA AACAAAAAAA GTCATTTTTA GACTAGTTTG 2580
TTGGCCAGTT GTAGTCAGTG CACTGCTAAA CGTTATTGTT CCACTATAAT TTGTTTGTTT 2640
TGTCTCACGT CGTCCCACAA CAACAACATA TAGTTTAGAA TACTGTACAA TGTTTTATAA 2700
TAATAATTAA TTATTTTAGT ATCCATTTCA TTCAGCATAT TTCAAATTAA GGGCATCCAC 2760
ATTTTCGGAC AT 2772