EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-46144 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:54701943-54703361 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr4:54702193-54702208TGAACTTTGCACCTC-6.44
NR2C2MA0504.1chr4:54702171-54702186GCAGGTCAGAGTTCA+6.16
RARAMA0729.1chr4:54702190-54702208GCATGAACTTTGCACCTC-6
TBX21MA0690.1chr4:54702959-54702969AAGGTGTGAA+6.02
Enhancer Sequence
CAAACAGATG ATTCCTGACT CACTATAGAT AACCAGAACA CAAAGCTGCG GTCACACTAG 60
ACTTTGAGAT TGTGAAATTC TGCCATACGG CGCTGTGGAA AGGGGCGGGA TCAAACAAGA 120
TTTTTAGAAA TTAAAAAAGT GAGCAATTGC TCCATGGTTT AAATTTCTGT CCAGAGAGGT 180
CATGTTTTGA TCCTCGATTG GTCTCACGCA GTCAAGTGAT GCGATTTCGC AGGTCAGAGT 240
TCACCAAGCA TGAACTTTGC ACCTCAGCAA CCAGTGAAAC TTGACGCATG ACCCTGTTTC 300
TAGTCTGACG CATTCGTGTG CGTATGAATG GAAGTCTATG GGAGGAAAAG CCCAGTGTGA 360
CCGTAGCTTA ACTCAGTTAT CCTTGTCTTG AAGAATCCCT CTCCCACCCT TACTTCCCCC 420
CTTTTTAGAT TGGGCAACAC AGCAGCCAAT GATTAGCCAG TGGTTAGCAA TGTTGCCTCA 480
CAGTAAGAAT GTCGCAGGTT AAAGTCGCTG CTAACCAGTT GACTTTTTGT GCAGAGTTTG 540
CTCATTCTCC CTGTGCTCGC GTGGATTTCC CCTGGTTTTC TCCCACAGTC CAAAAACACA 600
CAACCTAAGT AAACTGAACA TTAAATTGGC ACCATAGTCG AGCTCTTAGT AAGCCTTATA 660
TCTCCCTTTA GCCGATCTAC CTGAGCTCAC ACTCCCCTCT CGTCCTGCTA ACGGGAGGGA 720
GCCCAGGGCT TGAGGATCTT ATAAGCTTAG GTCTCTCCCG GGACAGCATG CCAAACAAGT 780
GTGAACTCTT GAATGCATAT CAAGTTACTG ATAATGAAAC CCTTTGAACA CCTGAAAATT 840
TAAACTCAAC TGAAGAGGGG TGAAGATTTT GCCAGCTGTT TTGTAGTGTA GATCAGGGGT 900
CACAGCCCAG TACCAGGTTG TGAGAGTTGC TATCGGGCTG CAAGAAGGCA AAATAACTCA 960
ATATGTTGAT ATATTGTATT GGCTTGTTTC ATATGCAACA AGTATCTGCT TCTGATAAGG 1020
TGTGAACCAA ATAACCTACA GGAACTCAAG AGATGTGACC CAACCAAAGC AGTTGGGTAA 1080
TCTCCAGGGG GGTTTCATCA GTGTCTCACA GACTGTACTT TGGTTTAAGT TACTTGAAGA 1140
TGGACAAGTT AACATCAACT AACATTGTTA ACATTGTCTT CAATAAAGTC TTCTCCCTTT 1200
AAGAACTTTG GTCAGCTTAC TTATTTTATG CATTAGTCAT CTATACATTG GCGAGCCACC 1260
CAAGAACGGT TAAGCCAAAT ACAGTAAAAG CTGACAATGT GCTTCAACTT ATTATGAACC 1320
GATCACCATA TTTGTGCAGG GTTCCACACA ATTCTTTCAT GTTGTCACAA CACAAATTAA 1380
GTTAACTTAA CACTTTTAAA AAATGTATGT CGACTGAA 1418