EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-46129 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:54524899-54525862 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESRRBMA0141.3chr4:54525472-54525483ATTGACCTTGA-6.02
Foxd3MA0041.1chr4:54525486-54525498GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:54525490-54525502GTTTGTTTGTTT+6.32
IKZF1MA1508.1chr4:54525400-54525412CAAACAGGAAGT+6.02
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr4:54525478-54525489CTTGAGTGGTT-6.32
PKNOX1MA0782.1chr4:54525351-54525363TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX1MA0782.1chr4:54525351-54525363TGACAGCTGTCA-6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:54525351-54525363TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:54525351-54525363TGACAGCTGTCA-6.92
TGIF1MA0796.1chr4:54525351-54525363TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF1MA0796.1chr4:54525351-54525363TGACAGCTGTCA-7.22
TGIF2MA0797.1chr4:54525351-54525363TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF2MA0797.1chr4:54525351-54525363TGACAGCTGTCA-7.22
Enhancer Sequence
ACGTTGTACG AGGATTTGAC GAAAAAATGC CCTGCAAACC TTAAAAATCA ACACCATCCC 60
AGGACAATTC TTTTGATCCC CTTTCGGTGC ACTTGCATTA AAGCCCGCGT GATGCAGCGC 120
TTTGTCAGTG TTACTGTATC ATTCGGACAT GGTGGCAGGG AGTTAAAGAC TTCAGCCAGA 180
GCGCTTCACC ACAGGCTCGG TTTGTCAGAA GTGGGATTCG AACCCACGCC TCCAGGGGAG 240
ACTGCGACCT GAACGCAGCG CCTTAGACCG CTCAGCCATC CTGACATGCA AGTTTGGCAG 300
GAGCTGTCTC CTGGGAGCCA CACCGCAGTA CCGTGACATG GAATCTGGTG TTTCACAGCT 360
TGCCCAGCTC CGGCTGTCCA CCTCATTGGC GCAGCAGGCA GCTAAGCTGT GCTCGGCTCC 420
TGGGGCTGCG CCTAGTTTCA ATAGCCAACA CTTGACAGCT GTCATTGCTT ACGACCACAC 480
CACCCTGAGG GCGCTATAGA GCAAACAGGA AGTGAGTAGG CAGCAGTGAG GAGAGAAAGG 540
CTCTCCCCAT TTTGCTTGTC TACCTTTTTG TTTATTGACC TTGAGTGGTT TGTTTGTTTG 600
TTTTATTTTT GTCTTTAAAA ACCACCTAAC AGCAGCATTT TGCTGACTGA AGGGTGGTTA 660
TGTTGTGTTT TTTATTTTTA ATCATGGACA GATTACCCGG CAACGACACG GAAATGGAGG 720
GACTTGCACG AAAGGATAAA GTAAATGGGC TGGATAATAG ACGAAGAGAT AAAAAAATGG 780
ACTTGACAGC AGACAAAGAG ATAAATAAAA TGAAGAGCCC GGCCAACGAA GAGGTGAAAA 840
AGGTAAGGAT AAGCAAGAGA TACAAAGAAG AGTGTGCACA AAGGAAGCAA CAGTAACTGT 900
AGAAGTAGAA AATGTAAAAG ATGCAAGAAG GTTTGATATA ATCAAAGCAG TCACGGAGCT 960
GAT 963