EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-45917 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:53522183-53523521 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr4:53523200-53523210GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr4:53523200-53523210GTCACGTGAC-6.02
CDX1MA0878.2chr4:53522475-53522486GTTTTATTGCC-6.32
CDX4MA1473.1chr4:53522475-53522486GTTTTATTGCC-6.62
Foxj3MA0851.1chr4:53522743-53522760TATTTTGTTTATTTTTT-6.38
HOXD9MA0913.2chr4:53522475-53522485GTTTTATTGC-6.02
MITFMA0620.2chr4:53523196-53523214GTACGTCACGTGACCTGC+6.47
MITFMA0620.2chr4:53523196-53523214GTACGTCACGTGACCTGC-6.47
NFYAMA0060.3chr4:53522826-53522837TCTGATTGGCT-6.32
SOX10MA0442.2chr4:53522469-53522480GTCTTTGTTTT-6.14
Sox3MA0514.1chr4:53523130-53523140CCTTTGTTTT+6.02
USF1MA0093.2chr4:53523200-53523211GTCACGTGACC+6.14
USF2MA0526.2chr4:53523198-53523214ACGTCACGTGACCTGC-6.32
Enhancer Sequence
ATAATTGACG CTAATATTTT TGAGTTTGCA TTATTGTACA TAACTTACGC AAATGTTCCA 60
AGTACTGGGT TGCAGTTGGA AGGGCATGCA CTGTTTAAAG CATATGCTGG ATAAGTTGGT 120
GGTTTATTCC ACTGTGGCGA CCCCTGATAA ATAAAGGGAC TGAGCCGAAA GAAAATGAAC 180
AAATGAACTT ACGCAAATGC TTAATGCAAC GTTTGCTTTA ACTGGAATGA TGAGGAGATG 240
GCGAGATGAC ATACTTTGTT ACTTGTTTTC ATTCATTTGT ATTTTTGTCT TTGTTTTATT 300
GCCTTTGTGC ATGTCCTGAG GCTTAGCTGA AGACCTACAT GATGACATTT TATATACCTG 360
ACAAAATGTA GAAATGCTAT CAAAAAGGTT TCCTGCTGTT TGTCCAATCA GGGACAGTGG 420
CAACGTAAAT ATACAAATAA TAATGGTAAC TCGGGGTTCG CAAATGTGAA ACGTCTGTTA 480
ATGAACACCA CGGTTTATAT TTTAACCCCA GGTAAAGCAT GAGCAGTATG GAACATGTTA 540
CATGCCAGCA CTTATTTGAT TATTTTGTTT ATTTTTTGTG TCTCATCATG TGTTTCTGTT 600
TGTCACCCAG TCCACTTCTG TGCTTGCTCC GCCTACACTC ATCTCTGATT GGCTGTTTCA 660
CTTGTTCTTG CTGCAACCAA TCCCATCTCT CCTGCTACCT GATTGGTCAC CACTCTGCCC 720
AAGCTCCAGC CAATCCCTGC ATGCTACCTG GCCTTTAAAA GGCCTTCAGT TTGTTTGTTC 780
TAGAGCAGAC TCTCTGACTT TATGTTTGAC ACTTTGCTCG TCTGCTTGAT TGTTGTATTT 840
TGGCTTGTTG GTTTGATTTG TTGTGTTTGA TTGTTTGCTA TCCCCATTTA TTAGTATTGC 900
TCGTCTTTAT GTGATTTACA CTTTGTTGAA GTTACTGTCT GTTCTTACCT TTGTTTTGCC 960
ATATCTCCCC TAACCTCATG TTTCCCTGTG AGTTTAGATA GACTGGAAGG TAAGTACGTC 1020
ACGTGACCTG CATATCAGCG TGTAGATTAA CATTTTGTCT AGATACACCA GGTAAGAGGA 1080
TGTGTGCGCC AACCTGTGTG TTTTTGGTTT AATTGTTAGT CAGTGTAGAT TAGATGGGAC 1140
ATCATTGACG TTGAAAATTT CTTTTTCATA TCTTTTGTTT ATTAGAATAG ATTAGAGGGG 1200
ATTTGTTGTG AATATTAGTA AGACTGTTTG GTTCTTTTAT TTAGCGCCAC CCATAGCCAG 1260
TCTTTCGAAC ATTTGTTTAT TGTCTTTAAC CTTGTATATA TTGTAAATAC CTCACTCGCT 1320
GATTCAACCT CACCTTGT 1338