EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-45887 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:53274363-53275505 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr4:53274834-53274844GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr4:53274834-53274844GTCACGTGAC-6.02
Pou2f3MA0627.1chr4:53274744-53274760TCAAATTTGCATACGA-7.46
Sox3MA0514.1chr4:53275320-53275330CCTTTGTTTT+6.02
USF1MA0093.2chr4:53274834-53274845GTCACGTGACC+6.14
USF2MA0526.2chr4:53274832-53274848TCGTCACGTGACCCGC-6.62
Enhancer Sequence
CCTGCCCAAA TACGCTCACA CACGCACACA CACACCCACG AGGCTGTTCC GACAGAAAGA 60
AAATGAACTC ATCAAATCCA GAACCAGCAC AAAACCAATG TGTTATGTTT TGTAAACTTT 120
GTATCTAATT TCTGACTTTT CTTACCTGTG TAACCTCTCT TATAACCTGT ATGCATGTTC 180
CATTTAGGCC TTTGTAAAGC ATAAATATTG TAAGGATATG AAAAATTATG TCGATGTACT 240
TTTAAAACCC CCATGTTTGG TACCGATGGG TTTCTGCTGA CATTTTACAG CACATGATGC 300
ATAGAGAAAA ACCATAACTA GCATTGCCTT ATTCTTTAAT CCCCTGTATT AAATGCCTGT 360
CCGCATGCTT TGGGCGGACA CTCAAATTTG CATACGAGGG ACCTTGAGAC AAAGAAAGGG 420
TTCGCGCGCA AACTTTCCCC TGAAATCATT GGTCTTAATG CTGTACGGGT CGTCACGTGA 480
CCCGCAGGTA TAACTCATTC TGCCCTCCCA AACATCTGGG CAGAAAGAGA ACGTCCCAAA 540
AAGGAACATC ATTGACGGTG GCCCTCGGGC CACACGTGGC TTTCTAAGCC GCATGGACTT 600
TTCCCGCCAC GCTTTCTTTA TTTTCCGGCA AAGTAAATTC AGTTTAAAGT TTGCGATCGT 660
GTTCGTCCGA ACTGCATTAC AAACTCCACG CATCAAAGGA CATCAAGAGT AGTTTCATCA 720
CGACGGAAGA GAGACGCATA AGAGAGACCG CCAGACATGA AAGACCAGGT GATTTTAGTT 780
ATGCGATTAA GCTGTGCCCC TTATCAAAAA GGTGTTTTTT ATAACCTTGG TGGTCCGTAA 840
TGGTGCGTGT GGAACTGAAA GTTTTGTCAC TCTTTAATCT GAAATCTATA TTTTCTAGCT 900
TTACTATTTC TCTTTGCTGT TACACGTTCT ATAGACCCGA TATCTCCACG TGGTTTACCT 960
TTGTTTTGTG TTAAATGTAT GTTTGTGCGT TTGTTTGTTC GTTACGTCTG ACTAGTCAAT 1020
AAATTCCATT ATAATCAAAT GAATTGTATT GTTTGCCTCA CGAGAAAATG TCACTGAAAT 1080
ACAGATTCCT CTGCCTAGCT ATTATAAGTT GTTTAAAACT TTTGAATGAT TAATCTACTT 1140
CA 1142