EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-45716 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:52251445-52252573 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CrxMA0467.1chr4:52252006-52252017CTAATCCTCTT-6.62
Foxq1MA0040.1chr4:52252112-52252123TATTGTTTATT+6.62
ZEB1MA0103.3chr4:52251695-52251706GGGCAGGTGGG-6.14
Enhancer Sequence
TGAACTACAC AGATAAGACC CTTACAGATC CCACCTAAAA CCCATCTGGG CATCATGGCT 60
GGCCCCTATG TGAATCCCAA GTGCAAGCCC ATTTAAAACC CTTTAAGCAG GTGGGGTCCA 120
ATTGGGTCTT TCATGAATTG CCCGGTTAAG ACACTCATAA GATTCTCATA GATCCCACTT 180
AAAACCCATC TAGGCATCCA CGGCTGGCCA CCATGTAGAT CCCGGGTGGA AACCCACTTA 240
AAACCCCTTT GGGCAGGTGG GGCCCAAATG GGTTTGGCAT GAATTGCCCA GTTAGGACTC 300
ATGCAGTACC ATTACAGGTC CCACTTTTAG TACGTCTGGG CTTCCCCCGG CTGGCCCCAA 360
TGTGGTTCCC AGGTGCAAGC CCATAATGGG GCCCACATTT GACGCCCATG AAGCCCTCAT 420
TTGGGCCCCA CATGTCATTG CTGGCTGGGA CAGAGACAGA GATCAAGGCT GTCGTCATAG 480
AGGCCATGAA GGAGTTGTCC GAATTTTGTC ACAGAGGACG TTTCTGGGAG TTTGGAAAAA 540
TTTGTGACAT ATTGGACTCT ACTAATCCTC TTGCCAAGTT TGTAACTCTG TTATGCTTCT 600
CTGATTTGAT GAATCTGGCT TCAAATTAAA CATCTGCACA TATTTAGACA TAAATATAAA 660
TTATTGCTAT TGTTTATTTG ACCCTATTTA TGATCCTTGT TTTAGGATGA TTGCGGAGAT 720
GCAGTCAAGG GGGTTGATGA TTAATAACTT ACCTTCAGTC CTCCCAGAAT CAGCTCTATC 780
GACTACATCT TCTGTGCCTC AAAGCTCTGG AGAAGGTGCA GAAAGTCCAT TGGAGCCTCC 840
AAATGAGCCC TTATCTGACA AGAGCTCTGG AGAGTACTAC CAGAGGTACA GTTTCAAATC 900
GGCATTCCCA GAAATTAAAT GTACACTGTG GAAATGATTT CTCTTTAATA TACAAAGTCA 960
TTTTGCTCAC CTGCTTTTCT ATTTCAGCAC TGGTGGACTG ATGTTTACCT CTTCCGTGAG 1020
GGTGGAAGTG GTCAAAAAAG GCTTTTACAA TAAGCACTCC ATTGACCACT CCCTTCTAAC 1080
AGGATTTAAT AAGTACCTTT ACATTGATCT AGGATATAAA AACAGCAA 1128