EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-45433 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:50771356-50772544 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr4:50771761-50771776TGAACTTTGCACCTC-6.44
NR2C2MA0504.1chr4:50771739-50771754GCAGGTCAGAGTTCA+6.16
RARAMA0729.1chr4:50771758-50771776GCATGAACTTTGCACCTC-6
TBX21MA0690.1chr4:50772528-50772538AAGGTGTGAA+6.02
Enhancer Sequence
CTTGTCCACA CAAACACAGG TATATTTAAA ACGGCAGCTT GTTCATGTAG TTTGTCTGTT 60
CATTCAAGTG AAGATTATTT ATAAACTACT TTCGAGAGGA TCACATGCTT ATGATTGTCA 120
ACGGCTGGTC CTGCTTTAGC TAAAACATGA TTCACCAATC AGATGATTCC TGACTCACTA 180
TAGATAACCA GAACACAAAG CTGCGGTCAC ACTGGACTTT GAGATTGTGA AATTCTGCCA 240
TACGGCGCTG TGGAAAGGGG CGGGATCAAA CAAGATTTTT AGAAATTAAA AAAGTGAGCA 300
ATTGCTCCAT GGTTTAAATT TCTGTCCAGA GAGGTCATGT TTTGATCCTC GATTGGTCTC 360
ACGCAGTCAA GTGATGCGAT TTCGCAGGTC AGAGTTCACC AAGCATGAAC TTTGCACCTC 420
AGCAACCGGT GAAACTTGAC GCATGACCCT GTTTCTAGTC TGACGCATTC GTGTGCGTAT 480
GAATGGAAGT CTATGGGAGG AAAAGCCCAG TGTGACCGTA GCTTAACTCA GTTATCCTTG 540
TCTTGAAGAA ACCCTCTCCC ACCCTTACTT CCCCCCCTTT CTAGATTGGG CAACACAGCA 600
GCCAATGATT AGACAGTGGT TAGCACAGTT GCCTCACAGT AAGAATATCG CAGGTTAAAG 660
TCGCTGCTAA CCAGTTGACT TTTTGTGCAG AGTTTGCTCA TTCTCCCTGT GCTCGCGTGG 720
ATTTCCCCTG GTTTTCTCCC ACAGTCCAAA AACACACAAC CTAAGTAAAC TGAACATTAA 780
ATTGGCACCA TAGTCGAGCT CTTAGTAAGC CTTATATCTC CCTTTAGCCG ATCTACCTGA 840
GCTCACACTC CCCTCTCGTC CTGCTAACGG GAGGGAGCCC AGGGCTTGAG GATCTTATGA 900
GCTTAGGTCT CTCCCGGGAC AGCATGCCAA ACAAGTGTGA ACTCTTGAAT GCATATAAAG 960
TTAATGATAA TGAAACCCTT TGAACACCTG AAAATTTAAA CTCAACTGAA GAGGGGTGAA 1020
GATTTTGCCA GCTGTTTTGT AGTGTAGATC AGGGGTCACA GCCCAGTACG AGGTTGTGAG 1080
AGTTGCTATC GGGCTGCAAG AAGGCAAAAT AACTCTATAT GTTGATAGAT TGTATTGGCT 1140
TGTTTCATAT GCAACAAGTA TCTGCTTCTG GTAAGGTGTG AACCAAAT 1188