EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-45388 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:50511123-50512683 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr4:50512306-50512323AGCATTAATTAATGTAA-6.84
ArxMA0874.1chr4:50512305-50512322GAGCATTAATTAATGTA+6.97
GATA5MA0766.2chr4:50511765-50511775CAGATAAGGA+6.02
IRF4MA1419.1chr4:50512613-50512628CCGAAACTGAAAGCA+6.77
IRF5MA1420.1chr4:50512613-50512627CCGAAACTGAAAGC+6.01
IRF8MA0652.1chr4:50512613-50512627CCGAAACTGAAAGC+6.55
LEF1MA0768.1chr4:50511932-50511947ATTCCTTTGATGTCC-6.08
ONECUT2MA0756.1chr4:50511252-50511266TAATAATCAATAAT+6.02
ONECUT3MA0757.1chr4:50511252-50511266TAATAATCAATAAT+6.36
POU6F1MA0628.1chr4:50512309-50512319ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:50512309-50512319ATTAATTAAT-6.02
TCF7L2MA0523.1chr4:50511933-50511947TTCCTTTGATGTCC-6.93
Enhancer Sequence
CTGTCATGGC TTTGCAATAA AAAAGTGTTA TAATAGAGGC CAATACAGAA AAAAACGGCC 60
ATGAATATAA CAAAAAGGGA GTAAATTTGC CCAGAGTGTT GTAGCGAAAT TAGCTCAGTT 120
TATGAAAATT AATAATCAAT AATAATGAGT TATTAATATT CCGGCTTAAT CTTCTGTCAT 180
TTGTTTAAAC AAATATATAA TTGTATATGA TTCCGCCCGC TCGGCCGAGC AGACTCTCAG 240
ATTATAAATA ATAATTATCA ACATCAACGA ATTATTATTG ACATTCTGGA TTAACTTATT 300
GTTAATTTGA CCAAATAAAT ATAATTAGAC CTCGCCTGAG CGGACTCTGT AATGATATAT 360
TTATTTAGAG AGGGAATTAT TGCTACTCCT TGTGAAGTAG ATTAATCATT CAGAAGTTTT 420
GATCAACTTT ATAGCAGCTG TAGGGAATAT CATTTCAGTG ACTTTTTCTG TGAGGCAAAC 480
AATACAATCC ATTTGATTAT AATAGGGTTT ATTGACTAGT CTGACATATA ACGAACAAAC 540
GCACCAACAT AACATAAAAT ATAGAACAAA TGTATACTGC ATGTAGGTAT ATACGGGTCT 600
ATAAAACATA TAACAAACAG AAAAGTGAGG AAATAGAGAT TTCAGATAAG GAGTGGCAAA 660
TCTACCTCAG TTTCACACAC TATTAAGGAT CACCAAGATT ATAAAAACAC CTTTTTGATA 720
AAGGGGCACA GCTTATTCGC ATTACTAAAG TACCTGGAGT TTAGGATTTC TCGGTCTCTC 780
TCTCTGCAAG TTTCTTCCGG TGTGCTGGAA TTCCTTTGAT GTCCTTTCTT GATGCGTGGA 840
GTTTGCAATG CAGTTCGGAG GATACGCGAT CACAACTTAA ACTGAGTTTT ACTTTGCCGG 900
AAAAATAAGA AAACGTGGGC TCGGATGAGC CACGCGGTCA GAGAAAAATG TGGTCTGCCC 960
CCATTAAAAG AGGGTGCACC TCTCGAAAGA CTGTTTTCAG GACTTCTGCT CTGAGTTGTG 1020
CATGCAGCTT GGTTTTTAAC TTTGGTCTGG CCACAACCCC TTTTCCCAAC AACTGACCAA 1080
CAGTCTCCTG GCAAAGTTTG AGCGGGAGTT TTTCTTTGTC TCTGGCCCGT TAATATGCAA 1140
AATAAGAGTC CGCCCGAAAG CATGTGGAGA GACATTACGT CAGAGCATTA ATTAATGTAA 1200
GCCGTGGTGA TTATGATCAT GCGCTACGCA TCATGTGTTG TAAAATGGCA GGAGGAACAT 1260
TTTGATACTA AACACTAAAG TGTTAAGAAG TGCATCAACA GACTTTGGGT GTACTTACAC 1320
TATACTATCC GAACCGTGCC CAGGCCCATT TCTCAGATCG TTTGAGAAGT GCGAGTGTGC 1380
TGAATCGGGC TCAGGAACGG TTCACTTTGC CGGCCCTGGC CCGGTTGGAA GAGGTGGGCA 1440
TGAGCGTGGT TTACTTGGGC TTGTAGTGTG AGTGCAAAAC GCGCCAAAGC CCGAAACTGA 1500
AAGCAGGACG TGAGTTTTAA GGGAGTGTTT CATATGGATC TATTAATCAA TCTTACTGTT 1560