EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-45256 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:49636481-49637453 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESR1MA0112.3chr4:49637420-49637437GAGGTCATGGAGACCTT-6.39
FOXF2MA0030.1chr4:49637165-49637179AATGTTTACGTTTC-6.34
LMX1BMA0703.2chr4:49637318-49637329ATTTTAATTAA+6.62
NR2C2MA0504.1chr4:49637412-49637427CTAGGTCAGAGGTCA+6.84
Nr2f6MA0677.1chr4:49637413-49637427TAGGTCAGAGGTCA+6.55
RXRBMA0855.1chr4:49637413-49637427TAGGTCAGAGGTCA+6
RXRGMA0856.1chr4:49637413-49637427TAGGTCAGAGGTCA+6.18
RxraMA0512.2chr4:49637413-49637427TAGGTCAGAGGTCA+6.03
Enhancer Sequence
ACGGTAAACT TTAGAGTTCT GTAAAGGTCT GCGCCTACCA CAACCGTAAA CCTTGCCTAC 60
TTGTAAATTA CTGTTGTAGA GCCCGGACAG CTCAGTCGGT AGAGCATCAG ACTTTTAATC 120
TGAGGGTCCA GGGTTCAAGT CCGTGTTCGG CTGTGTAATG CTCATTTTGT GGAGCCACAG 180
CTTTTGCCGT TGAGCTATCA CTTGATGAAA GTTTCATCTG GATGCACAAT ACGTGTACTA 240
GTCATGAAGA CATGGCATTT CTGACAATCT TGTAGTCGTG GCCGTGTGGT TAAGGCGATG 300
GACTTGAAAT CCATTGGGGT CTCCCCGCGC AGGTTCGAAT TCTGCCGACT ACGTCCTCTA 360
ACTTTTTAAA ATTGCAGCAG TCATCAAATG TTTGCATTTC CACTGTTTCT TGGGAAAAGC 420
GTTGTGCTGG TAGGAGGAGA AAAACAACAG CGTGTTCTCA CTGAACAGAA AGGGGGCATA 480
TCACAGGGAG GAACATGCCA CACAAGAGCT ACAACGGCTG TCCCGTAGCT CGCCGTGATC 540
GTATAGGGGT TAGTACTCTG CGTTGTGGCT GCAGCAACCC CTGTTTGAAT CTGGGTCACG 600
GCAGGTTTTT CAAGGTGACA TCGGTGTTGC CATCAATAAT CTCCAACCAC ATTTTAGTGC 660
AGGCTGTGCT AATGGCACGT CCTGAATGTT TACGTTTCCT AAAGTGTGGA AGACTAGGGA 720
TTCGATATGA GAAACAGGAT CTTTGATGCC AGCATGCTGT GTAGATAAGT ACTGATCAAG 780
TCACGCTTCT AAGGCATGGA AAAAATCTTT TCAATTGTTG ACTTGTGGCA ATTGTTGATT 840
TTAATTAATG AATAAGTTAA CACATTGCTT AATATAAGAA TGTTCAGTGC ATTTGCCTGT 900
CTCTTTATAC CTATTTTCAG GAGCCAGCAA ACTAGGTCAG AGGTCATGGA GACCTTGAGT 960
GGAACTGAGG GC 972