EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-45147 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:49169064-49172523 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F7MA0758.1chr4:49171373-49171387TTTTGGCGAGAAAA-6.64
E2F8MA0865.1chr4:49171374-49171386TTTGGCGAGAAA-6.27
ESRRBMA0141.3chr4:49170248-49170259ATTGACCTTGA-6.02
Foxd3MA0041.1chr4:49170267-49170279GTTTGTTTGTTT+6.32
IKZF1MA1508.1chr4:49170176-49170188CAAACAGGAAGT+6.02
IRF7MA0772.1chr4:49169293-49169307AGTTTCGTTTTCTT-6.09
IRF7MA0772.1chr4:49172033-49172047AGTTTCGTTTTCTT-6.09
IRF9MA0653.1chr4:49169293-49169308AGTTTCGTTTTCTTT-6.22
IRF9MA0653.1chr4:49172033-49172048AGTTTCGTTTTCTTT-6.22
PKNOX1MA0782.1chr4:49170127-49170139TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX1MA0782.1chr4:49170127-49170139TGACAGCTGTCA-6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:49170127-49170139TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:49170127-49170139TGACAGCTGTCA-6.92
TGIF1MA0796.1chr4:49170127-49170139TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF1MA0796.1chr4:49170127-49170139TGACAGCTGTCA-7.22
TGIF2MA0797.1chr4:49170127-49170139TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF2MA0797.1chr4:49170127-49170139TGACAGCTGTCA-7.22
Enhancer Sequence
GAAGCAGCAC TGGCCTATTG GTTTCCGTAG TGTAGTGTTT ATCATGTTTG CATTACATGC 60
TAAAGGTCTC CTGTTCGAAA CTGGGCGGAA GCATACAATT AGCGGACACT TTTGTCCAAA 120
GCGACATACA ATAGTGGAGG TATTCAACAA GACGAGGCAA TGCATACGAA AAAGGGCTAT 180
TTATTCCAAG TAATTTGTTT GTGCTCAGAG AATTTAGTGC TGGAGTAGGA GTTTCGTTTT 240
CTTTAGAGAG AGGGATATTC ACCGGGGTTC GGGTGTACTC TGAAGAGATG GGTGTTAGCT 300
GTCGTTTGAA GGACACCGGT GTATCCGTAA TCCGAGTGGG AATGGGAAGG TGATTCCACC 360
AGCGTAGAAC ATTGAATGAA AACATTGTGG AAAGTGACTT TCCGTCTCTC TGCGCTGGCA 420
CCACAAGAAA GTGCTCTCAC CCTAACCGGA GGCTCCTGTG GTTATCACGA TGGCTTTACA 480
AGCGGAGGGT CTCCTGTTAG CAACTGGGCG GAAACATTCA GATTTGCTTT TACGCGCATT 540
CTCAATTGGC TCTCTGCTCA CTGGATGATC CACGATACAA GGGCATGGAT CTGTCAAATG 600
TCATGACTTG ACGTTGTACG AGGATTTGAC GAAAAAAATG CCCTGCAAAC CTTAAAAAGC 660
AACACCATCC CAGGACAATT CTTTTGATCC CCTTTCAGTG CACTTGCATT AAAGCCCGCG 720
TGATGCGGCA CTTTGTCAGT GCTACTGTAT CATTCGGACA TGGGGGCAGA GAGTTAAAGA 780
ATTCAGTCTG AGCGCACTGC CGCAGGCTCG GTTTGTCACA AGTGGGATTC GAACCCACGC 840
CTCCAGGGGA GACTGCGACC TGAACGCAGC GCCTTAGACC GCTCAGCCAT CCTGACATGC 900
AAGCTTGGCA GGAGCTGTCT CCTCGGAGCC ACACCGCAGA ACCGTGACAT GGAATCTGGT 960
GCTTCACAGC TTGCCCAGCT CCGGCTGTCC AGCTCATTGG CGCTGCTGGC AGCTAATCTG 1020
TGCTCGCCTC CTGGGGCTGC GCCTAGTTTC AATAGCCAAC ACTTGACAGC TGTCATTGCT 1080
TACGGCCACA CCACCCTGAG GGGGCTATAG AGCAAACAGG AAGTGAGTTG GCAGCAGTAA 1140
GGAGAGAAAG GCTCTCCCCA GTTTGTTTGT CTACCTTTTT GTTTATTGAC CTTGAGTGTT 1200
TTTGTTTGTT TGTTTTCTTT TTGTCTTTAA AAACCACCTA ACAGCAGCAT TTTGCTGACT 1260
GAAGGGTGGT TATGTAGTGT GTTTTATTTT TAATCATGGA CAGATTCCCC GGCAACGACA 1320
TGGAAATGGA GGGACTTGCA AGAAAGGATA AAGAAAATGG GCTGGATAAT AGACGGAGAG 1380
GGAAAGAAAA TGGACTTGAC AACAGACAAA GAGATAAATA AAATGAAGAG CCCGGCCAAC 1440
GAAGAGGTGA GAAAGGTAAG GATAAGCAAG AGGTACAAAG AAGAGTATGC ACAAAGAAAG 1500
CAACAGTAAC TGTAGAAGTA GAAAATGTAA AAGATGCAAG AAGATTTGAT ATAACCAAAG 1560
CAGTCACGGA GCTGATTGGA GCAGGAAGAA TTCTGGCGGT GAGACCCAAA CAAACAAAGG 1620
GAGTATGAAG TAACAATGGA GACTGAAGAT GACACCGAAA TTTTAATAGA CAATGGATTG 1680
ACAATTAAAG GAGTGAAATC TGAAGTACGG AGTTTACAAA ACAGAGACTA TGTTGTTTCG 1740
TTCAAGCATC TGCCTGTTTA CCTAGCAAAT GAAGAAATTT TAAGCAAGCT AGAGAGATGG 1800
GGAGTTTTCC CCATATCTAA AATTAAAAGA AGATTGTATC CTGGCACAAA CATAGAAGAT 1860
GGAACAAGGT TTGTAAAAAA CAGATTTCCG GAAGAGATGG TCTCCTTACC ATACAGTACC 1920
AAAATCGAGA CGGCGGAAGC GCCACAGCAC TTTAGAGTCA TGCACACCAA TCAGGTAAAA 1980
ACCTGTCGAC TATGCATGAG CTCAGAAAAT GTGATGAAGG AACGCCCAGA ATTCAGGTGC 2040
TTCAAATGTG ACGAAAGGGG ACATTTCGCA AGGACCTGTA CAGCTGTGTC GGGCCCGGAT 2100
TGTAAATTGG CCCTAATACC TGCAGAGAGC TTGTCACGCC GAGTTGGCTT TGTCCGCTCG 2160
ATTGACCAAC GCGTACGCCT TGTTTTATCC TTGCAGGCCT AACTTCGCTG GTGAAAGCAC 2220
TTGTGGGGTT TCTGTAGTGT AGTGGTCATC ACGTTCGCCT AACACGCGAA AGGTCCTCGG 2280
TTCGAAACCG AGCAGAAACA GTGCTCTTCT TTTGGCGAGA AAATAATAGC ATCCACTGCC 2340
GCACCAGCAA TGATCGTCGA CAGGCACCCA ATCAAAAAGG GTTATCAGCT CGATCTGCCT 2400
GAAGGTTTCT GTAGTGTAGT GGTTATCACG TTCGCCTCAC ACGCGAAAGG TCCCCAGTTC 2460
GAAACTGGGC GGAAACAACC TCTGGCTTTT ATGACAATTG TCAAATCAGG CTTCTGTTGA 2520
GTACTGACGT TCACTGAAAA CATTCTTTCT GCAGAGCGGT GTGAGGCTAG AAGTTTGATT 2580
TCAGCTCAGT GTTTACCGCC CCTCGCGGTG TCGCAAACTT GCGTAGAATC TGATTTCTTT 2640
TAGCTTTGTG TTGTGCATGA GCAGGTGGCC AGTGCGTTTG CTGGCCCTTC ACGGTGCAGA 2700
CCGTACAAGA CAGCTCTATA AAAAAAGACT ATAAATACTT GAAGCAGCAC TGGCCTATTG 2760
GTTTCCGTAG TGTAGTGTTT ATCATGTTTG CATTACACGC TAAAGGTCTC CTGTTCGAAA 2820
CTGGGCGGAA GCATACAATT AGCGGACACT TTTGTCCAAA GCGACATACA ATAGTGGAGG 2880
TATTCAACAA GACGAGGCAA TGCATACGAA AAAGGGCTAT TTATTCCAAG TAATTTGTTT 2940
GTGCTCAGAG AATTTAGTGC TGGAGTAGGA GTTTCGTTTT CTTTAGAGAG AGGGATATTC 3000
ACCGGGGTTC GGGTGTACTC TGAAGAGATG GGTGTTCGCT GTCGTTTGAA GGACACCGGT 3060
GTATCCGTAA TCCGAGTGGG AATGGGAAGG TGATTCCACC AGCGTAGAAC ATTGAATGAA 3120
AACATTGTGG AAAGTGACTT TCCGTCTCTC TGCGCTGGCA CCACAAGACA GTGCTCTCAC 3180
CCTAACCGGA GGCTCCTGTG GTTATCACGA TGGCTTTACA AGCGGAGGGT CTCCTGTTAG 3240
CAACTGGGCG GAAACATTCA GATTTGCTTT TACGCACATT CTCAATTGGC TCTCTGCTCA 3300
CTGGATGATC CACGATACAA GGGCATGGAT CTGTCAAATG TCATGACTTG ACGTTGTACG 3360
AGGATTTGAC GAAAAAAATG CCCTGCAAAC CTTAAAAAGC AACACCATCC CAGGACAATT 3420
CTTTTGATCC CCTTTCAGTG CACTTGCATT AAAGCCCGC 3459