EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-45015 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:48421388-48422396 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr4:48422131-48422152AAAAGGAAAACGAAACTTAAT-6.77
IRF2MA0051.1chr4:48422135-48422153GGAAAACGAAACTTAATG+6.1
IRF3MA1418.1chr4:48422128-48422149GAGAAAAGGAAAACGAAACTT+7.77
IRF9MA0653.1chr4:48422133-48422148AAGGAAAACGAAACT+6.13
Enhancer Sequence
TTCACACCTC TACTTTGGAA AAAGTCAGAA AAGCGGGCGT GTCCAGCTCT GTTTAGGGGG 60
GAGTGTCGGA GGAACTAAAG TGGGATGGTG TGGGAGTGTC TATTTGGGCA CGCGCGAGTT 120
TCAGTCAAAA TACACACACG AGAAAGTGAT GGTGTATTTT TTACAGTCAT TGTGTTTAAC 180
CTACATGGAC ATCTGTAGTT GAATTATTTG CCAGATTATT AAATGTTGGA CTTTAACTGC 240
AGTTTGGCTC TTTCATTCAG GGAATTCATT CATGCCCCTC GCGACAAACG CGATATTTGA 300
TTCGAGGATC TGCTCTAAGC GTGTATTTTT CATGCAATGT TTTATACCGC ATGGCGAATG 360
AGAGAAAAAA AAGCTCCGCA ATTCCCGGAA ACTTAGATGC ACTCGGCAGG TAGCGTCAGA 420
AAGCCGCGTG TGTTATTCCG GTCACAAAAT GCGGTGCTAA CAAGTTTGCA CTCAGTGCAA 480
TAGTTAACTT AATTCGATAC GAACAAACTG AATAAACAAA GAGCACTGGT CGCTCACTTA 540
CCAAATCTGT AGAGACAGGA CAATCACCAG CAACTAGAGC CGCGTCTTTA TGAAGAGAAG 600
ACTACAAGCA AATCCGGATT TCAGCGTTTG CAGATGAGAA CAGCTCTCAG GTAAACAATA 660
ATCCTCCTTA GACACGTAAG TTATTGTTGT CGAGCGTCGC GTACACTGTT AATCCACACG 720
TGAGTCTGAG CTCTCACAGA GAGAAAAGGA AAACGAAACT TAATGGCAGC AAACTATAAA 780
AGCAACACTC CACGCTTGTT TTGCCAACAC AACGTGGCGT CTCTGGTGTA AACAGTGACA 840
CTAATGAATA TTAATGAAGT TGCAAAATAG AGCGCGCTGA TTGGTTTGAA CCAAGCCTTA 900
CTCATGCATT AATGCATCAC ACTGTAAGAC GTAATAAGGC ACACTCTGGC ACAGACGCCC 960
AGTCTGCACG CTGGAATAAA ACGCTATTAT GTCATGACCG TGACGCAG 1008