EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-44383 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:44583505-44584767 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GBX2MA0890.1chr4:44584246-44584256ACCAATTAGC+6.02
LMX1BMA0703.2chr4:44583831-44583842TTAATTAAATT-6.32
LMX1BMA0703.2chr4:44583828-44583839ATTTTAATTAA+6.62
Enhancer Sequence
ACACATTTCT GATTCTATTT ATATGTAGTC AATGACAGAG TGAAAGAATA TGTGTATTGC 60
ATAATCATCT CAATTGTTTC ATGTATATAA TTATTATTAT TATGATTAAT TAGGCTGGCT 120
TGAGAAACAA GCCAGACTAC TGAAATCCTA TTTAAACTTA TTATTTTTAT TTATTATTCT 180
TCTTCTTCTG AGACTAAAAT TCAAAATATA TCTCCTCCTA GAGCCTTCGA GCTATGACCA 240
CTAGAGATGC GCGGTTGGCG GTTATAGCCG CGGACTTCGC GGATAAACCG CGGATCGGGC 300
GGATGACGTT ACGAAAAAAT AATATTTTAA TTAAATTCGG GCGGTTGACG GGCGGTTGTA 360
CTGTTTTTAT AGGCATAGCT GGCGCACCAA CGAAAAAGCC TAGGACTGAT TTCACAGAAT 420
GTGAGGAGGA ATCAGATACA CTAATTCTGG ATGAAGTACA GAAGTATTCC TCTACAAACT 480
TCCGTATAGA CGGATCAGCA GAGGAAAATC TACTTTCCTT TTGGGAGAAA TAAGGCCAGT 540
CATTCCCACG ACTACAGCAC CTTTCCAAGA GAATTCTATG CATTTCAGCA ACAAGTGCTG 600
CGAGCGAGCG CTCCTTCAGT GCAGCAGGGC GCATTATAGT GGCTATGCAG GCGCTCCCGT 660
CTGAATCCTG ACACAGATGC TGTTTTATTC CTGCATTGTG CCAAGAAAAA ATCAAACTAG 720
ACCTAAGGTC AGGCATATTA AACCAATTAG CCTATGTTAT TTAGGCTACA CATATGTTCA 780
ATATAAACTT TTGAGTTCGG TCAGCTGATA ATTTTACGTT CATATTGGTT TAGCCTATTC 840
TATTCTAGAC ATGTTGGCCT CGCTTTTACG TTTCGAGGCT AAGGTTATTT TGCCAGAATT 900
TCTTTGTCGC AACTTTAATG GCGTAGTATT TCGTTATGTT CGAAGTATCT CGCAGGTTTG 960
AGGGGAATGG GGATGATCCT TAGTCCATGG GTTATTGGGG CACTTGTCAT ACATGCACTT 1020
TAGCCTGGTC AGACTTTATG TTCGCTTAAA GAGGGATGGC ATATCTATTT TTCTAATTTA 1080
ATTTCTAATT GTGACGTTTT TATTAAAAAA AATTTCAACT GTTTGCCAAA GCATGCGACT 1140
ATAGCCTATG CCTACATTAA GATATTTATG TTAATATTTT TTTTACTGCC TGTTGTTTCT 1200
TTTGGCAAAT AAAATAGGTA TTGTCTGATA GAGATATCAA TAAAGGTTCA TCTGTGTCGC 1260
AG 1262