EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-44093 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:42887892-42889593 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxo1MA0480.1chr4:42889179-42889190TGTAAACAAGA-6.02
SOX10MA0442.2chr4:42889482-42889493AAAACAAAGGA+6.32
Sox3MA0514.1chr4:42889482-42889492AAAACAAAGG-6.02
Enhancer Sequence
ACCTTAATCA ACACATGAGG ATCCACACTG GAGAGAAACC ATTCACATGC ACCCAGTGTG 60
GGAAGAGTTT CAGCAACTCA GCAAACCTTA ATCAACACAT GAGGATTCAC ACTGGAGAGA 120
AACCATTCAC ATGTACTCAG TGTGGGAAGA GTTTCAGCCA ATCATCATAC CTTAATCAAC 180
ACATGAGGAT CCACACTGGA GAGAAACCAT TCACATGCAG TCAGTGTGGA AAGAGTTTCA 240
GCCAATCACC ATACCTTAAT CAACACATGA GGATCCACAC TGGAGAGAAA CCATTCACAT 300
GCAGTCAGTG TGGGAAGAGT TTCAGCCAAT CATCATCCCT TTATCTACAC ATGAGGATAC 360
ACACTGGAGA GAAACCATTC ACATGTACTC AGTGTGGTAA GAGTTTCAGC AAATCATCAA 420
ACCTTAATAT ACACATGAGG AACCACACTG GAGAGAAACC ATTCACATGC CTTCAGTGTG 480
GGAAGAGTTT TAGCCAATCA ACATCCCTTA ATCTACACAT GAGGATACAC ACTGGAGAGA 540
AACCATTCAC ATGTACTCAG TGTGGTAAGA GTTTCAGCCA ATCATCAAAC CCTAATATAC 600
ACATGAGGAA CCACATTGGA GAGAAACCAT TCACATGCAC TCAGTGTGAG AAGAGTTTTA 660
GCCAATCAAC ATCCCTTAAT CGACAAATGA TGATCCACAC TGGAGAGAAA GAGTTTATGT 720
GCTTGAAGTG TGAGAATACT TTTATTACAG CTGCAGAATT GAAACGCCAC CAGAGGGTTC 780
ACACTGGAGA AAAACCGTAC AAGTGTTCAC AGTGCAGTAA GAGGTTTGCT CACTCAGGAA 840
CCCTGAAAAC ACATGAGAGG ATTCACACTG GAGAGAAACT GTAGACATGA TCAGTGTGTA 900
CAAAGTTTCA CTTAATCAGG GCAGCTTAAG AAACACATGG GATGGTTTCT GGTAAGGCGC 960
CGACACATGT AGCAGCATAG AAAGAGCGCT TCCATACACA CTGGTATTAA TCCTCCTTTT 1020
TACATCATAT ATAATAACCT AAACCATATT TAAATGACAT GGAGGAGGGA CAAAAACAAA 1080
AAGGCTAGGA CAAAACAATC AGTTAATCCT GAAAAAAATG AGAAATCAAC AGATGAAAAA 1140
TCCAAGACGG ACGGGATAGC TGATAGCCTG TCACCTATCA TTGCAGCAAT ATTTACAGAC 1200
ATCAAAGCTT TCCAGAAGAA TATTAAATCT GATTTAACCG CCTTCCAAGA TTCTCTCGCA 1260
AAAGATGTGA AAATGGAATT AAGTAACTGT AAACAAGAAG TCAATCAACA ACTGGATGAC 1320
CTTATCACGG ACCTAAATGC AACGACAGAA AAGGTCAACG AAGTGGAGCA GCGAGTTGGA 1380
GAATTTTGGA GGAGAACATT GCAGAGATGA AAGAAATGCT CAATCAATCC ATTCAAATAC 1440
AAGAAAATTT AAAAGAGAAA CTGTGAGATA TAGAAAAACG CTCCCGTAGA AATAATAATC 1500
AGATTTTTGG AATCCCGGAA GGAAGCATTC TGAATGAAAA GGGAATTAAG TTCTAAACAC 1560
CACCGCCGGC AAGACTTAAA ATCTTTTTGG AAAACAAAGG ACCTGGTCCT CCGCTTTGCA 1620
TGGAGAAAAA AAGTAATACA CTGAAATAAA AAAAGAGTTT TCTTTGACCA AGACTACCCA 1680
CCTGAGATCC AACAGAAAAG A 1701