EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-43729 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:40455050-40456255 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr4:40456027-40456038TGATTGGATTA-6.02
Foxd3MA0041.1chr4:40455661-40455673AAACAAACAAAC-6.32
GRHL2MA1105.1chr4:40456143-40456158TACAAACCAGTTTTA+6.7
Enhancer Sequence
TATTTAAACA ATAGACCTTA TTGTGAGTAA AATAGTACTT CGTTGTATAA AGGGTTAAAA 60
TAATATTGTC AATAGCAGGT ACAACTAGCA ATAAATGAAC AACCTGAAAT TTTAATCAGT 120
TGGTTTACAT CTGTGTAAAA GCTTCAAAAC AAACCTCTTC CAGTTGAATC ACAGCGCGGG 180
AGTGGCGCAG CTTTATTATA TCACACAACT TCTTACTTTT TTTCCACTTA CTCTTAGTGA 240
TGACTTATAG ATACATTGCT TCCTTGTTTT CCACTTTATA CTTTATTTGC TTACTGATTT 300
GTATTTGTAA GACCATCACT ATGTTAATTG AAAAAAAGGA TTTACCCCCC ACTGGATCTT 360
TGCCTTCAGG TAGGTTGGTA AGAGGTTGCA TTTTCTTTAA ACGATTGCAT TTCTTCATCC 420
ATAGCTTTAA CTCATTCACT TGCATTCACT GATGTTACCA CCTCTTAGTA TGTTTGAATG 480
GGGAAACATC AAATTCTCCA AAATTGCCTG CCAGGTTCCT ACCTATATAT AGAATGACAT 540
GAATAAGTGG AGGCTTATTT GGGCTACAGT CCATTTGTCA GTGGACTGTC AAGCATTATT 600
TATAACCAAA TAAACAAACA AACAAAAAAT AAATAAATAG TTGTAAAAAA TCTTTTAAAA 660
ATGACTGAAG AACGTAATAC AACGTTGAAC AATGCATCCA CGCATATTTA GATTTTACAT 720
TTTATAATGT TAGCATTCAG ATATTATTTG AGTGTAAATT CAGAATGTGC AACTTACCTT 780
TCCAGTCTTC AATAAAGAAG TGGGATGAAA AAATGACCTC AGTGGGTTTT TCTTTGTAGG 840
TTGTTGTTGG TAATAATCCC AATTGTAGTT TGTCCTCAAA CGTTGTTCTC TTTACTTAGC 900
AAAATAAGCC AATGAAGTTT CTGTTAGGAA CCCAGAATAT ATAGATACAA CCCTGTTGAG 960
CTACAGGATC TGGAACGTGA TTGGATTAGA CTCAATTGGC CCCCATTAAT TCTGGTATAA 1020
AGATGCAAAT GAGCAGTGGG GAGTAGTGAA GACTCAAGAC ACATACAGTG GGGGATGGGA 1080
AGTTCAGCAG CTTTACAAAC CAGTTTTACA GAGAAATAAT GATGTATTGG GAAAATAAGT 1140
TGACTTTAGC CATCATCATT TGTTTTGTTG CTGTTGTTTT ATAGGACTAT TGATGGAAGC 1200
TTTTT 1205