EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-43375 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:38405874-38407216 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr4:38407200-38407211TTTTATTGCTT-6.32
GATA6MA1104.1chr4:38407042-38407055TACAGATAAGAGA+6.27
IRF1MA0050.2chr4:38406182-38406203TTTTTGTTTCGTTTTCTTTTC+6.76
IRF3MA1418.1chr4:38406185-38406206TTGTTTCGTTTTCTTTTCCAC-6.02
NFKB2MA0778.1chr4:38406775-38406788GGGGGAATTCCCT-6.28
NFKB2MA0778.1chr4:38406775-38406788GGGGGAATTCCCT+6
ZNF384MA1125.1chr4:38407125-38407137AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:38407126-38407138AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:38407127-38407139AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:38407128-38407140AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:38407129-38407141AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:38407124-38407136TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr4:38407123-38407135TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr4:38407122-38407134TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
TCCATTTCTT GTATACTTTG AATGGAATGA CATTATGCTA TTTAATAAAT TAAAACACTT 60
ATTACACACA TTTCTGTTAA CTTATTCAAA CAATAGCCCA GTACTCTGAA TAAAATAGCA 120
CTACGTTGTA TAAAGAGTTA AATAATATTG TCAACAACAG GTTCATAATT TATCATCGGG 180
TAAAAAAGCC TGAAACTTTA ATCAATCGCT TTATTTTCAT GTAAAACACA AACCTTTCTC 240
CAGCTGAATC CTAGCGCTGG GGTGGCGCAG CCTTATGACG TCACACGTCA CGCCAAAATA 300
AAAGTCTTTT TTTGTTTCGT TTTCTTTTCC ACAATGTAGC AGTTATATTA ATACATTTCA 360
CCCTCGTTTT ACACTTTCAA CTATAACTGC TCTCTCTCTC TCTCTCACAC ACACACACAC 420
GCACACACAC ACACACACAC ACACATACAG GCACAGATAA ACAGTATTTG AAGTTGATCA 480
AAACCTTTAA TCTAAACATT TTAGAAACAT TTTAAAAAAC TTTTTTAATC CACTTGACTC 540
TTAAGCACAT TACTAATAAT ATCCAAATCT CATCCTCGTA ATTATGACAT CTACTTTCCT 600
ATTTCTACAA CTTTATAGAC TTTATCTAGG GTTTTAGTGC AGTCTAGGGT GTACATTAGG 660
CACTCAGGCA TTGTCCACAA CCTGTTGTTT CAATCCCCTG AGAACTTGCT AATCTTCAGA 720
ACATGAATGA AGACACTTTA GATGAAATCT GAGAGTCCCG AGATGCCAAA AAGGGGGCCC 780
AGTCCAGAAT AGGAACCAAA AACATTGTCA AAACAGTCAA TGTGACTTTA GTGTTTTAAT 840
AATTCGGTAC ATTTACATTT ATATAGCACT TTTCTGGGCA CTCAAAGCTC TTTACACATA 900
GGGGGGAATT CCCTAATCCA CCAAATAATT GTAATCAAGT CTCAAGAACA CTTTGTGCCG 960
TTGAACCATA TAGTGGCTGT TTTTTGCCGC TGTATTCTTC AGTATATCTT TATTTGCATT 1020
CAACAAAACA GGTTTGGATC AAGTAGAGGA TGAGTAAATG ACAGAATTGT ATTTTTTGTG 1080
TGAACTACCC TTTTAATAGT TCTGTAAGTG AAGGTAAATT AAATATTATT ACTGAAGATA 1140
TTGCTAAAGA ATGGCAAGAA ACATAGAATA CAGATAAGAG ACGACAATTC ATATGAAACA 1200
GGTGCCATTT CCACATTGCC ATTTTCTAAA TTCTCAATAA GTACAAACTT TAAAAAAAAA 1260
AAAAAAACTT GAAATATATC TTAACCCTCC AAAACAGCTA TTTTCCCACC TCAAAATCCT 1320
TATTAATTTT ATTGCTTTTC TT 1342