EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-43238 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:37775420-37777595 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr4:37776720-37776731TTTTATTGCTT-6.32
FOXE1MA1487.1chr4:37776225-37776240TTTGTTTGTTTTACG-6.49
Foxd3MA0041.1chr4:37776224-37776236GTTTGTTTGTTT+6.32
HOXD9MA0913.2chr4:37776719-37776729GTTTTATTGC-6.02
RFX5MA0510.2chr4:37777324-37777340CGTTGCCATAGCAGCA-6.14
RFX5MA0510.2chr4:37777324-37777340CGTTGCCATAGCAGCA+6.1
Sox1MA0870.1chr4:37776695-37776710CACAATTTCATTGTG+6.61
Enhancer Sequence
TATGAAAAGT GTTGACGTTA TAAGACTTTA TTTTAACCAC TATGCTATCA AAGCAGCACC 60
CACACCAGGT GTCAACCCGG CCTCCTAGAG GGCAGAATTG GGGTGTGACT CCACCCCGCA 120
CCTTCTCTGA TTGGACAAGT ATTGTGTAGA CCCAGCCTCT ACCAAAGCCT ATAAAACTTT 180
GAACAAAAGA ATTTCATCGT CGGCTTTTGC CGGTCATCTT TGCCAGTCGT CACCGCCGTC 240
GCTGCCCGGA CGTCGCTCTT CTCGTGCTGT GGCCGTTACA TCGCCTCGCC GGAAGCCTCG 300
TTACATCACG GAGCAGACCG CGACCTTCAC TTGCTGCCGG CTCGACCCCC GATCTGCTTG 360
TGCAACCGCT TCAACAACAA GCCATCGGGT CAACACATCC AAACTCTGAA ACTCATCCTA 420
ACTACAGGAA CCCAGGAAGG ACTTCGAACG CCGCTTTGTC CAACATCTAT ATCCCTAGCA 480
ACCGACTAAG GAAACCCCTC TTCACCGACA AGGGAATTCC ATCACGTCAC TGAAGTTGCT 540
ACGCTGACCA ATCAGCTTCG CCGGGATTTC CCTTTGGACC AGTAGAGGAA ACCAAATTAC 600
ATCAGAACGC AAGTAGCACA AACAAGGTTT CTATCCATTG CTGACTCTGG TGTGAATTAT 660
GTTTAAGTAG TAAAGAATAG CGAAATTCTC TGCTTTTATG GTTTCTCTCA GGTTGCAATG 720
CTAAGAACTT AGCAAAGGCT AGAAGTTAAA TCCACTCAGT CAAAACTCTC CTCAAACTGC 780
TTGTGCGTGT GTGTATGTAT GTGCGTTTGT TTGTTTTACG TAGATTAGTA CTTTGTGTTA 840
TAGAGTAGCA ATAAACTTTT GTTTCGTTTT AAGATCCGTG TTGGTGTGTT GTGTGCTTTA 900
TAAGTTAATG CCTCAGCTTC AGATACTGCT ACCTTGCTTA TTAAATAATT AGATACTGTT 960
TTTATATTGT TATTGTTGGC CACGTAATAA TATAATACAG AACTGCTTTA CACTAAACGT 1020
TCTATTTGCT GGACAAATAC TAAAGTTAAG TGTAAGCTTT AAATAATTCT ATGTGAATCA 1080
TGTTCGAATC TTTGATTCGA ATCCCCAAAG TTTAAACATG ATTTAAACCA AAGAGCTGAT 1140
TCTTACATAG TGGTGGAGAA TAATTCGGGC AAGCAGATCT AACTTTTAAA GCACAAAACC 1200
CAGAAATCAC GTTGTTAATC TTTTCTATTT TTGTCCGGAA AGAATAGATT AGAAAGAACA 1260
AAAGTTTTGC TACTGCACAA TTTCATTGTG GTACCATTTG TTTTATTGCT TGACTACATT 1320
TAGTGTTGTT AAGAAAGTAA AACTTCATTT AAGTTGTCCG CCGAGACACA CTGTAAGCCG 1380
CTCTAAAGCG CATGTAGAGA AAGACAAAGC GTATTCCTTT GTGCTTATCT CATAACGTTA 1440
TATAAGGCCT TCACAGTATG ATTTCGTACG CCGCGATTCC CGGATGGAAA CTCAGCTGTG 1500
TTTTCTCCTG GTAACTGATT TAGCATAGCT AACTAAATTC TTGTTGCCCT GTAATTTGCT 1560
AATACTTAGT AAATTATTTA AAACGCGGAG CTCAGAGAAA GCTGCCTGGC GTAGTTTATA 1620
GGAGAAGTTT TGAAATTGAT CAATTGAAAT TGTGGTTTGA TTCCACGGAT GTGTTTGCAG 1680
TCTACACAGA CTTAACACAG AGTGCTGAGA TCCCCCATAT CTCTGTCACG ATTTGTATTA 1740
ATCTCAGAAA TCCTGTTGAT TAATTTTGTC TCACTTTCAT AAGTTGAGAA TCGTTCTGTA 1800
CTGTTAAGAT ATAAAATCTA ACTAGTGCTT TTTGCTTGAA CAGTGTGAGA TGCGCCGTCA 1860
TCTCAAGTGA TACTGTGAAA TTTGCTATTA TTCCACTTTG TGGTCGTTGC CATAGCAGCA 1920
ACCCTGGTCC GGAAGTACAG AGAGACTTGC CGGAATTACA TTCAAGCGTG CATGTGCAGT 1980
CCGCCAGCGC CAGCTTGAAT TGTAAACAAA GAGCATAGCG TGAAGCTAAG CTAAACTAAC 2040
GCTAACGCGT TTGCATTGAA GTCTATGCAT TTCCAGTAGC AGCGAAGGCT AATAGATAGC 2100
ACGTAGCATA TAGTGGTCTT AAATGCATTG TATGGCTAAT GTTTGAAATA ACTCTTGCAT 2160
CTCAGTTGTT TCTCT 2175