EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-43135 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:37248123-37249157 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATF2MA1465.1chr4:37248411-37248425GAATGACATCATTA+6.65
EVX1MA0887.1chr4:37248430-37248440GCTAATTACC-6.02
EVX2MA0888.1chr4:37248430-37248440GCTAATTACC-6.02
FOXC1MA0032.2chr4:37248583-37248594ATATTTACTTA-6.14
FOXE1MA1487.1chr4:37248192-37248207TATAAAATAAACAAA+6.15
Foxj3MA0851.1chr4:37248193-37248210ATAAAATAAACAAAAAC+6.62
IRF1MA0050.2chr4:37248290-37248311GTTGACTTTTACTTTTCATTT+6.2
JUNMA0488.1chr4:37248413-37248426ATGACATCATTAT-6.98
JUND(var.2)MA0492.1chr4:37248412-37248427AATGACATCATTATA-6.75
POU1F1MA0784.1chr4:37248304-37248318TTCATTTGCATATG-6.16
POU2F2MA0507.1chr4:37248304-37248317TTCATTTGCATAT+7.82
POU3F1MA0786.1chr4:37248305-37248317TCATTTGCATAT-6.18
POU3F2MA0787.1chr4:37248305-37248317TCATTTGCATAT-6.37
POU5F1MA1115.1chr4:37248306-37248317CATTTGCATAT-6.32
Pou2f3MA0627.1chr4:37248303-37248319TTTCATTTGCATATGT-6.18
SOX13MA1120.1chr4:37248973-37248984AAACAATGGAA+6.32
Enhancer Sequence
TTCCTTTTTA AGGTTATTGT TTTTCTTGTT CTCCTGCTGT TGGTAAAGCG TCCTTGAGCA 60
CTGGCGCTAT ATAAAATAAA CAAAAACAAT AAATTAAAGT TCAAATGAGC TGACGATATT 120
TGACCTACAG TATTCTCATA GAAGATATCT GCTATTACGG TGATAGTGTT GACTTTTACT 180
TTTCATTTGC ATATGTCACG TTGATCACAA TTTTTTCATC AACTTCTTTA TGGGTTTAAA 240
CTTGTTTCTA GTAGTTGTTA CTAGTTCTCA CAGATAGTAT CTGAGTTAGA ATGACATCAT 300
TATAATAGCT AATTACCGGG GCTATTGCTT TTAAACAGGG TTTCTGCGGT GCCTTAAATT 360
CCAAAATCTA AATTTTCAAT CTACAATCAC CAACAACCCA TCTCAATAAA ACTTTTCATT 420
CAAAAAGGTC TTTTTAACTC TATTTATCAT AATGGTTTAA ATATTTACTT ACAATAACAT 480
TTGTTTAAAC GTGCTCCATT ACTGCTGAGG ACATCGACCT AGACAGATTG TTGTGCATAT 540
ATTTTGTTTA TTATAGGTTT TAAAACGTTT AAAGCATTTG TTCATTTATT TATTTATTAA 600
TTTTAAAGAA AGTTTACTTA GGAAAAAAAG TGTATGGATA CAAGTAAAGC TTACTTGTTG 660
CTACACAGAA TTCGAACCGG GGTTGCTGCG GCCACAACGC AGAGTACTAA CCACTATACG 720
ATCACGGCGA GCTATGAAAC AGCCGTTGTG ACCTATGTGT GGTATGTACC TCCCTGTGAT 780
AAGCCCCTTT CTCTTCAGTG AGAACACTCT GTTGTTTTTC TCCTCCTACC AGCACAACGC 840
TTTTCCCAAG AAACAATGGA AATGCAAACA ATTGACGACT GCTGCAATTT TAAAAAGGGG 900
GAGGACGTAG TCGGCAGGAT TCGAACCTGC GCGGGGAGAC CCCAATGGAT TTCAAGTCCA 960
TCGCCTTAAC CACTCGGCCA CGACTACAAA ACTTTCTGTG CCGCCATTTC TTTATGCCTA 1020
GTACACATAT TGTG 1034