EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-43012 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:36729732-36731176 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr4:36729753-36729774AACCTGAAAGTAAAACCAACT-6.13
NKX2-5MA0063.2chr4:36730810-36730820CTCAAGTGGT-6.02
RBPJMA1116.1chr4:36730503-36730513CCTGGGAAAG+6.02
Enhancer Sequence
TTTAGTCGTC TTGGGGATTT TAACCTGAAA GTAAAACCAA CTAAGTGTTC TCTGTTTCAG 60
AGCAAAGTGC ATTATTTGGG CCATGTGATT TCAGAAGGAG GGGTGTCACC AGACCCAGGG 120
AAGTTGCAAG CCGTGGAGAC ATGGGCGGCT CCTCAGAACA TTACCCAGCT TCGGGCCTTT 180
TTGGGCCTAG TGGGTTATTA TAGACGTTTT ATAAAAGACT TTGCAAAGAT TGCAGCACCA 240
CTGAATTCAA TGTTATGGGG GACATCGAAA CGACGAACTC AACCAGCTGC AGGTAAAGCA 300
GAGCGTTGGG CATGGGGGGA GATGCAAGAA AGCGCCTTCA AGAAATTAAA GGAGAGCCTC 360
CTGCAAGCAC CCCTATTAGC ATATGCTGAT TTCCAGCTGC CATTTGTGCT GTATACGGAT 420
GCCTGTCAGA CGGGTTTGGG AGCAGTACTT GCTCAGGTTC AAGAAGGGAA GGAGAGAGTA 480
ATTGCTTATG CAAGCAGAAG CCTACGCCCT ACGGAGAGGA ACGATAAAAA CTATAGCTCA 540
TTTAAATTAG AACTGCTGGC TTTAAAATGG GCTATAGCGG AAAAGTTCAG GGACTATCTT 600
GCTGTGTCTC CCTTTACTGT GTTCACAGAT AATAATCCGC TGGCTCACCT GAATACGGCT 660
ACGCTGGGGG CAGTGGAGCA ACGATGGATG GCCCAATTGG CTGGATTTCA GTTTGATGTG 720
CGCTATAGAC CAGGACGGAC AAATGGAAAC GCTGATGCCC TCTCGAGATG GCCTGGGAAA 780
GAGACAGATG GCCAGTCTAT AGAGGATGAA GCAGTGCCAT GTGGTGAGCC GGGATATGTA 840
CCATCTGAAG TGGTTCATGC TTGTGTCCAT GCCTTTGTTC CAGTAGTTAA GGACCAGGAG 900
AAGGAGCCAA GCAAAGAACG AGAGCCACAG TTGACCCAGG AGGAGTGTGT CGGACCTAGT 960
TTGTTGGATG ACTGGGTGAG GGCACAGCGG GCGGATCCAG TGCTGTCACG ATTGTGGATG 1020
TATATGGACA GAGGAAGAGG CCCTGGACCA AGAGAACGTG CAGCAGAGGA TCGACCTACT 1080
CAAGTGGTGC TGCGACAGTG GGGTCGTCTG GGCACCGATC GAGGATTGTT GTGCCGTGAG 1140
GTATGTGATC CAAAGACATT TGACAAACTG AAACAAGTTT TGGTGCCTCA GAGTTTGCAG 1200
AACCAAGTCC TAGAATGGGT GCACGATCGT GCCGGACACC TTGGAGTGGA AAAAACTCTC 1260
GGCTTGGCCC GTCGCCGTTT CTTTTGGCCG GGGATGACAC AAGGAGTGGA GAAGTGGTGT 1320
CTTAAATGTG TTCGATGTAA TCTGCATAAG ACCCCAGCTA ATAAAGTGAG TGCCCCGCTT 1380
GTATCCATAG ATTCAGATTA TCCATTACAG ATTGTGTCTG TGGACTTCCT GTCACTGGAG 1440
CCTG 1444