EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-42950 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:36416246-36418987 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F7MA0758.1chr4:36418492-36418506TTTTCTCGCCAAAA+6.64
E2F8MA0865.1chr4:36418493-36418505TTTCTCGCCAAA+6.27
ESRRBMA0141.3chr4:36416878-36416889TCAAGGTCAAT+6.02
Foxd3MA0041.1chr4:36416858-36416870AAACAAACAAAC-6.32
IKZF1MA1508.1chr4:36416949-36416961ACTTCCTGTTTG-6.02
IRF7MA0772.1chr4:36417830-36417844AAGAAAACGAAACT+6.09
IRF9MA0653.1chr4:36417829-36417844AAAGAAAACGAAACT+6.22
PKNOX1MA0782.1chr4:36416998-36417010TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX1MA0782.1chr4:36416998-36417010TGACAGCTGTCA-6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:36416998-36417010TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:36416998-36417010TGACAGCTGTCA-6.92
TGIF1MA0796.1chr4:36416998-36417010TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF1MA0796.1chr4:36416998-36417010TGACAGCTGTCA-7.22
TGIF2MA0797.1chr4:36416998-36417010TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF2MA0797.1chr4:36416998-36417010TGACAGCTGTCA-7.22
Enhancer Sequence
TTTAATTTTA GATATGGGGA AAACTCCCCG TCTCTCTAGC TTGCTTAAAA TTTCTTCATT 60
TGCTAGGTAA ACAGGCAGAT GCTTGAACGA AACAACATAG TCTCTGTTTT GTAACCTCCG 120
TACTTCAGAT TTCACTCCTT TAATTGTCAA TCCATTGTCT ATTAAAATTT CGGTGTCATC 180
TTCAGTCTCC ATTGTTACTT CATACTCCCT TTGTTTGTTT GGGTCTCACC GCCAGCATTC 240
TTCCTTCTCC AATCAGCTCC GTGACTGCTT TGGTTATATC AAATCTTCTT GCATCTTTTA 300
CATTTTCTAC TTCTACAGTT ACTGTTGCTT CCTTTGTGCA TACTCTTCTT TGTACCTCTT 360
GCTTATCCTT ACCTTTCTCA CCTCTTCGTT GGCCGGGCTC TTCATTTTAT TTATCTCTTT 420
GTCTGTTGTC AAGTCCATTT TCTTTACCTC TCCGTCTATT ATCCAGCCCA TTTTCTTTAT 480
CCTTTCTTGC AAGTCCCTCC ATTTCCATGT CGTTGCCGGG GATTCTGTCC ATGATTAAAA 540
ATAAAACACA CTACATAACC ACCCTTCAGT CAGCAAAATG CTGCTGTTAG GTGGTTTTTA 600
AAGACAAAAA GAAAACAAAC AAACAAAAAC ACTCAAGGTC AATAAACAAA AAGGTAGACA 660
AACAAAATGG GGAGAGCCTT TCTCTCCTTA CTGCTGCCAA CTCACTTCCT GTTTGCTCTA 720
TAGCCCCCTC AGGGTGGTGT GGCCGTAAGC AATGACAGCT GTCAAGTGTT GGCTATTGAA 780
ACTAGGCGCA GCCCCAGGAG GCGAGCACAG ATTAGCTGCC TGCAGCGCCA ATGAGCTGGA 840
CAGCCGGAGC TGGGCAAGCT GTGAAGCACC AGATTCCATG TCACGGTACT GCGGTGTGGC 900
TCCCAGGAGA CAGCTCCTGC CAAGCTTGCA TGTCAGGATG GCCGAGCGGT CTAAGGCGCT 960
GCGTTCAGGT CGCAGTCTCC CCTGGAGGCG TGGGTTCGAA TCCCACTTCT GACAAACCGA 1020
GCCTGCGGCA GTGCGCTCAG GCAGAATTCT TTAACTCTCT GCCCCAATGT CCGAATGATA 1080
CAGTAGCACT GACAAAGTGC CGCATCACGC GGGCTTTAAT GCAAGTGCAC TGAAAGGGGA 1140
TCAAAAGAAT TGTCCTGGGA TGGTGTTGCT TTTTAAGGTT TGCAGGGCAT TTTTTTCGTC 1200
AAATCCTCGT ACAACGTCAA GTCATGACAT TTGACAGATC CATGCCCTTG TATCGTGGAT 1260
CATCCAGTGA GCAGAGAGCC AATTGAGAAT GTGCGTAAAA GCAAATCTGA ATGTTTCCGC 1320
CCAGTGGCTA ACAGGAGACC CTCTGCTTGT AAAGCCATCG TGATAACCAC AGGAGCCTCC 1380
GGTTAGGGTG AGAGCACTGT CTTGTGGTGC CAGCGCAGAG AGACGGAAAG TCACTTTCCA 1440
CAATGTTTTC ATTCAATGTT CTACGCTGGT GGAATCACCT TCCCATTCCC ACTCGGATTA 1500
CGGATACACC GGTGTCCTTC AAACGACAGC TAACACCCAT CTCTTCAGAG TACACCCGAA 1560
CCCCGGTGAA TTTCCCTCTC CCTAAAGAAA ACGAAACTCC TACTCCAGCA CTAAATTCTC 1620
TGAGCACAAA ACAAATTACT TGGAATAAAT AGCCCTTTTT CGTATGCATT GCCTCGTCTT 1680
GTTGAATACC TCCACTATTG TATGTCGCTT TGGACAAAAG TGTCCGCTAA TTGTATGCTT 1740
CCGCCCAGTT TCGAACAGGA GACCTTTAGC GTGTAATGCA AACATGATAA ACACTACACT 1800
ACGGAAACCA ATAGGCCAGT GCTGCTTCAA GTATTTATAG TCTTTTTTTA TAGAGCTGTC 1860
TTGTACGGTC TGCACCGTGA AGGGCCAGCA AACGCACTGG CCACCTGCTC ATGCACAACA 1920
CAAAGCTAAA AGAAATCAGA TTCTACGCAA GTTTGCGACA CCGCGAGGGG CGGTAAACAC 1980
TGAGCTGAAT TCAAACTTCT AGCCTCACAC CGCTCTGCAG AAAGAATGTT TTCAGTGAAC 2040
CTCAGTACTC AACAGAAGCC TGATTTGACA ATTGTCATAA AAGCCAGAGG TTGTTTCCGC 2100
CCAGTTTCGA ACTGGGGACC TTTCGCGTGT GAGGCGAACG TGATAACCAC TACACTACGG 2160
AAACCTTCAG GCAAATCGAG CTGATAACCC TTTTTGATTG GGTGCCTGTC GACGATCATT 2220
GCTGGTGCGG GCAGTGGATG CTATTATTTT CTCGCCAAAA GAAGAGCACT GTTTCTGCTC 2280
GGTTTCGAAC CGAGGACCTT TCGCGTGTTA GGCGAGCGTG ATGACCACTA CACTACAGAA 2340
ACCCCACAAG TGCTTTCACC AGCGAAGTTA GGCCTGCAAG GATAAAACAA GGCGTACGCG 2400
TTGGTCAATC GAGCGGACAA AGCCAACTCA GCGTGACAAG CTCCCTGCAG GTATTAGGGC 2460
CAATTTACAA TCCGGGCCCG ACACAGCTGT ACAGGTCCTT GCGAAATGTC CCCTTTCGTC 2520
ACATTTGAAG CACCTGAATT CTGGGCGTTC CTTCATCACA TTTTCTGAGC TCATGCATAG 2580
TCGACAGGTT TTTACCTGAT TGGTGTGCAT GACTCTAAAG TGCTGTGGCC CTTCCGCCGT 2640
CTTGATCACA TGTTTTTGGA TTTGTCAGGG AAACCAGAGC ACCCAGAGGA AACCCACACG 2700
AACATGGGGA GAACATGCAA ACTCCACACA GAAACACCAA C 2741