EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-42814 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:35462601-35465052 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F7MA0758.1chr4:35463081-35463095TTTTGGCGAGAAAA-6.64
E2F8MA0865.1chr4:35463082-35463094TTTGGCGAGAAA-6.27
ESRRBMA0141.3chr4:35464695-35464706ATTGACCTTGA-6.02
IKZF1MA1508.1chr4:35464623-35464635CAAACAGGAAGT+6.02
IRF7MA0772.1chr4:35463741-35463755AGTTTCGTTTTCTT-6.09
IRF9MA0653.1chr4:35463741-35463756AGTTTCGTTTTCTTT-6.22
PKNOX1MA0782.1chr4:35464574-35464586TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX1MA0782.1chr4:35464574-35464586TGACAGCTGTCA-6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:35464574-35464586TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:35464574-35464586TGACAGCTGTCA-6.92
TGIF1MA0796.1chr4:35464574-35464586TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF1MA0796.1chr4:35464574-35464586TGACAGCTGTCA-7.22
TGIF2MA0797.1chr4:35464574-35464586TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF2MA0797.1chr4:35464574-35464586TGACAGCTGTCA-7.22
Enhancer Sequence
AAGATTGTAT CCTGGCACAA ACATAGAAGA TGGAACAAGG TTTGTAAAAA ACTGATTTCC 60
GGAAGAGATG GTCTCCTTAC CATACAGTAC CAAAATCGAG ACGGCGGAAG GGCCACAGCA 120
CTTTAGAGTC ATGCACACCA ATCAGGTAAA AACCTGTCGA CTATGCATGA GCTCAGAAAA 180
TGTGATGAAG GAACCCCCAG AATTCAGGTG CTTCAAATGT GACGAAAGGG GACATTTCGC 240
AAGGACCTGT ACAGCTGTGT CGGGCCCGGA TTGTAAATTG GCCCTAATAC CTGCAGGGAG 300
CTTGTCACGC TGAGTTGGCT TTGTCCGCTC GATTGACCAA CGCGTACGCC TTGTTTTATC 360
CTTGCAGGCC TAACTTCGCT GGTGAAAGCA CTTGTGGGGT TTCTGTAGTG TAGTGGTCAT 420
CACGTTCGCC TAACACGCGA AAGGTCCTCG GTTCGAAACC GAGCAGAAAC AGTGCTCTTC 480
TTTTGGCGAG AAAATAATAG CATCCACTGC CGCATCAGCA ATGATCGTCG ACAGGCACCC 540
AATCAAAAAG GGTTATCTGC TTGATTTTCC TGAAGGTTTC CGTAGTGTAG TGGTTATCAC 600
GTTCGCCTCA CACGCGAAAG GTCCCCAGTT CGAAACTGGG CGGAAACAAC CTCTGGCTTT 660
TATGACAATT GTCAAATCAG GCTTCTGTTG AGTACTGACG TTCACTGAAA ACATTCTTTC 720
TGCACAGCGG TGTGAGGCTA GAAGTTTGAA TTCAGCTCAG TGTTTACCGC CCCTCGCTGT 780
GTCGCCAACT TGCGTAGAAT CTGATTTCTT TTAGCTTTGT GTTGTGCATG AGCAGGTGGC 840
CAGTGCGTTT GCTGGCCCTT CACGGTGCAG ACCGTACAAG ACAGCTCTAT AAAAAAAGAC 900
TATAAATACT TGAAGCAGCA CTGGCCTATT GGTTTCCGTA GTGTAGTGTT TATCATGTTT 960
GCATTACACG CTAAAGGTCT CCTGTTCGAA ACTGGGCGGA AGCATACAAT TAGCGGACAC 1020
TTTTGTCCAA AGCGACATAC AATAGTGGAG GTATTCAACA AGACGAGGCA ATGCATACGA 1080
AAAAGGGCTA TTTATTCCAA GTAATTTGTT TGTGCTCAGA GAATTTAGTG CTGGAGTAGG 1140
AGTTTCGTTT TCTTTAGAGA GAGGGATATT CACCGGGGTT CGGGTGTACT CTGAAGAGAT 1200
GGGTGTTAGC TGTCGTTTGA AGGACACCAG TGTATCCGTA ATCCGAGTGG GAATGGGAAG 1260
GTGATTCCAC CAGCGTAGAA CATTGAATGA AAACATTGTG GAAAGTGACT ATCCATCTCT 1320
CTGCGCTGGC ACCACAACAC AGTGCTCTCA CCCTAACCGG AGGCTCCTGT GGTTATCACG 1380
ATGGCTTTAC AAGCGGTGGG TCTCCTGTTA GACACTGGGC GGAAACATTC AGATTTGCTT 1440
TTACGCACAT TCTCTATTGG CTCTCTGCTT ACTGGATGAT CCACGATACA AGGGCATGGA 1500
TCTGTCAAAT GTCATGACTT GACGTTGTAC GAGGATTTGA CGAAAAAAAT GCCCTGCAAA 1560
CTTAAAAAGC AACACCATCC CAGGACAATT CTTTTGATCC CCTTTCAGTG CACTTGCATT 1620
AAAGCCCGCG TGATGCGGCA CTTTGTCAGT GTTACTGTAT CATTCGGACA TGGGGGCAGA 1680
GAGTTAAAGA ATTCAGCCTG AGTGCACTGC CACAGGCTCG GTTTGTCAGA AGTGGGATTC 1740
GAACCCACGC CTCCAGGGGA AACTGCAACC TGAACGCAGC GCCTTAGACC GCTCGGCCAT 1800
CCTGACATGC AAGCTTGGCA GGAGCTGTCT CCTGGGAGCC ACACCACAGT ACCGTGACAT 1860
GGAATCTGGT GCTTCACAGC TTGCCCAGCT CCGGCTGTCC AGCTCATTGG CGCTGCAGGC 1920
AGCTAATCTG TGCTCGCCTC CTGGGGCTGC GCCTAGTTTC AATAGCCAAC ACTTGACAGC 1980
TGTCATTGCT TACAGCCACA CCACCCTGAG GGGGCTATAG AGCAAACAGG AAGTGAGTTG 2040
GCAGCAGTAA GGAGAGAAAG GCTCTCCCCA TTTTGTTTGT CTACCTTTTT GTTTATTGAC 2100
CTTGAGTGTT TTTGTTTGTT TTCTTTTTGT CTTTAAAAAC CACCTAACAG CAGCATTTTG 2160
CTGACTGAAG GGTGGTTATG TAGTGTGTTT TATTTTTAAT CATGGACAGA TTCCCCGGCA 2220
ACGACATGGA AATGCAGGGA CTTGCAAGAA AGGATAAAGA AAATGGGCTG GATAATAGAC 2280
GAAGAGATAA AGAAAATGGA CTTGACAACA GACAAAGAGA TAAATAAAAT GAAGAGCCCG 2340
GCCAACGAAG AGGTGAGAAA GGTAAGGATA AGCAAGAGGT ACAAAGAAGA GTATGCACAA 2400
AGGAAGCAAC AGTAACTGTA GAAGTAGAAA ATGTAAAAGA TGCAAGAAGA T 2451