EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-42811 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:35438858-35440169 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr4:35439194-35439208AATGTTTACGTTTC-6.34
HNF4GMA0484.1chr4:35439652-35439667AGGGTCCAGAGTTCA+6.02
SOX13MA1120.1chr4:35438896-35438907TTCCATTGTTT-6.32
SOX13MA1120.1chr4:35439927-35439938TTCCATTGTTT-6.32
Enhancer Sequence
CCCTTTTTAA AATTGCAGCA GTCGTCAATT GTTTGCATTT CCATTGTTTC TTGGGAAAAG 60
CGTTGTGCTG GTAGGAGGAG AAAAACAACA GAGTGTTCTC ACTGAAGAGA AAGGGGCTTA 120
TCACAGGGAG GAACATACCA CACATAAGTC TCAACGGCTG TTTCATAGCT CGCCGTGATC 180
GTATAGTGGT TAGTACTCTG CGTTGTGGCC GCAGCAACCC CGGTTCGAAT CCGGGTCACG 240
GCAGGTTTTT CAAGGTGACA TTGGTGTCGC ACTCTGTGTT GCCATCCGTT ATCTCCAGCC 300
TTCTTTTAGT GCAGGCTGTG CTAATGGCAC GTCCTGAATG TTTACGTTTC CTAAAGTGTG 360
GAAGACTAGA GATATGATAT AAGAGAAATA GGATCTTTGA TGCCAGCATG CTGTGTAGAT 420
AAGTACTGAT CAAGTCACGC TTCTAAGGCA TGGAAGGAAT CTTTTCAATT GTTGAGTGTC 480
CATTCATTGC CACAACAGCA GAAAGACTAT CTGCAGTTAT CATTGATCTA TTTAATGTCT 540
CCTACATGAC ATGAAGTCCA AACTATTGTG TTGTACTGAT GTCTACACCT ACAAAAACCA 600
TAAACCCAAC CTCAAAGTAA CCTGTCGTGT TTTAGCAACA TCCACACCAA CCATAAGCTT 660
AAAACCCCAT CTCACGGTAA ACTTTAGTGT ACTGTAAAGG TCTGCGCCGA CCACAACCCA 720
AACCTTGCCT ACTTGCAAAT TACTGTTGTG GAGCCCGGAT AGCTCAGTCG GTAGAGCATC 780
AGACTTTTAA TCTGAGGGTC CAGAGTTCAA GTCCCTGTTC GGGCGTGTGA CACTCCTTTT 840
GTGGAGCCAC AGCTTTTGCC GTTGAGCTAT CGCTTGATGA AATTTTCATC TGGATGCACA 900
ATATGTGTAC TAGGCATAAA GAAATGGCAG TACAGGTAGT CTTGTAGTCG TGGCCGAGTG 960
GTTAAGGCGA TGGACTAGAA ATCCATTGGG GTCTCCCCGC GCAGGTTCGA ATCCTGCCGA 1020
CTACGTCCTC CCCCTTTTTT AAATTGCAGC AGTCGTCAAT TGTTTGCATT TCCATTGTTT 1080
CTTGGGAAAA GCGTTGTGCT GGTAGGAGGA GAAAAACAAC AGAGTGTTCT CACTGAAGAG 1140
AAAGGGGCTT ATCACAGGGA GGAACATACT ACACATAGGT CACAACGGCT GTTTCATAGC 1200
TCGCCGTGAT CGTATAGTGG TTAGTACTCT GCGTTGTGGC CGCAGCAACC CCGGTTCGAA 1260
TTCTGTGTAG CAACAAGTAA GCTTTACTTG TATCCATACA CTTTTTTTCC T 1311