EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-42777 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:35308954-35310150 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr4:35309747-35309762TGAACTTTGCACCTC-6.44
NR2C2MA0504.1chr4:35309725-35309740GCAGGTCAGAGTTCA+6.16
RARAMA0729.1chr4:35309744-35309762GCATGAACTTTGCACCTC-6
Enhancer Sequence
TTACATCCAC ATGAGGATTC ACACTGGAGA GAAACCTTAC ACATGCACAG AGTGTGGTAA 60
AGGTTTCTCA CATATAAGCA CACTCAAACA CCACATGAGA ACTCACACTG GAGAGAAGCC 120
GTTTGCATGT GCTCAGTGTG GAAAGAGCTT CACAACCAAA CCTAGCCTCA AGAACCACAT 180
GAATGGTCAC ACTGGAACCA TAGTGTTCAC ATGTGATCAG TGTGGAAAGA GTCTCACACG 240
CAAAGACACC ATTAAGAAAC ACATGAAGAT TCACTCAAGA GAGGATCGTT TTAGATGCTG 300
TGAGTGTGGA AAGGGCTTTA AAAGTAAAAG AAGCCTCAAC ACTCACATGA AGATTCACAA 360
TGGAGAGCTG AGTCCTTAAC ATTGAGGCCT TGTCCACACA AACACGGGTA TATTCAAAAC 420
GGCAGCTTTT TCACGTAGTT TGGCTGTTCA TTCAAGTGAA GTTTATTTAT AAACTACTTT 480
TGAGAGGATC ACATGCTTAT GATTGTCCAC GGCTGGTTCT GCATTAGCTA AAACATGATT 540
CACCAATCAG ATGATTCCTG ACTCACTATA GATAACCAGA ACACAAAGCT GCGGTCACAC 600
TAGACTTTGA GATTGTGAAA TTCTGTCGTA CGGTGCTGTT AAAAGGGGCG GGATCAAACA 660
AGATTTTTAG AAATTAAAAA AGTGAGCAAT TGCTCCATGG TTTAAATTTC TGTCCAGAGA 720
GGTCATGTTT TGATCCTCGA TTGGTCTCAC GCAGTCAAGT GATGCGATTT CGCAGGTCAG 780
AGTTCACCAA GCATGAACTT TGCACCTCAG CAACCGGCGA AACTTGACGC ATGACCCTGT 840
TTCTAGTCTG ACGCATTCGC GTGCGTATGA ATGGAAGTCT ATGGGAGGAA AAGCCCAGTG 900
TGACCGTAGC TTAACTCAGT TATCCTTGTC TTGAAGAATC CCTCTCCCAC CCTTACTCCC 960
CCTCCTTTCT AGATTGGGCA ACACGGCAGT CAATGATTAG CCAGTGGTTA GCACTGTTGC 1020
CTCACAGTAA GAATGTCGCA GGTTTAAGTC GCTGCTAACC AGTTGACTTT TTGTGCAGAG 1080
TTTGCTCATT CTCCCTGTGC TCGCGTGGAT TTCCCCTGGT TTTCTCCCAC AGTCCAAAAA 1140
CACACAACCT AAGTAAACTG AACATTAAAT TGGCACCATA GTCGAGCTCT TAGTAA 1196