EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-42752 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:35057470-35059639 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESRRBMA0141.3chr4:35059342-35059353ATTGACCTTGA-6.02
Foxd3MA0041.1chr4:35059356-35059368GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:35059360-35059372GTTTGTTTGTTT+6.32
IKZF1MA1508.1chr4:35059270-35059282CAAACAGGAAGT+6.02
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr4:35059348-35059359CTTGAGTGGTT-6.32
PKNOX1MA0782.1chr4:35059221-35059233TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX1MA0782.1chr4:35059221-35059233TGACAGCTGTCA-6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:35059221-35059233TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:35059221-35059233TGACAGCTGTCA-6.92
TGIF1MA0796.1chr4:35059221-35059233TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF1MA0796.1chr4:35059221-35059233TGACAGCTGTCA-7.22
TGIF2MA0797.1chr4:35059221-35059233TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF2MA0797.1chr4:35059221-35059233TGACAGCTGTCA-7.22
Enhancer Sequence
CATTTCGCTA GGACCTGTAG AGCTGTGATG GGCCCGGATT GTAAATTGGC CCTAATACCT 60
GCAGGGAGCT TGTCACGCTG AGTTGGCTTT GTCCGATTGA TTGACAAACG CGTACACCTT 120
GTTTAATCCT TGCACGCCTA ACTTCGCTGG GGAAAGCACT TGTGGGGTTT CTGTAGTGTA 180
GTGGTCATCA TGTTTGCCTA ACACGCGAAA GGTCCTCGGT TCAAAACCGA GCAGAAACAG 240
TGCTCTTCTT TTGGTGAGAA AATAATAGCA TCCACTGCGT CACCAGCAAT GATCGTCAAC 300
AGGCACCCAA TCAAAAAGGG TTATCTGCTA GTTGTACTTC TGAAGGTTTC CATAGTGTAG 360
TGGTTATCAC GTTCGCCTTA CACGCGAAAG GTCCCCAGTT CGAAACTGGG TGGAAACAAC 420
CTCTGGCTTT TACGACGATT GTCAAATCAG GCTTCTGTTG AGTACTGATG TTCACTGAAA 480
ACATTCTTTC TGCAGAGCGT TGTGAGGCTA GAAGTTTGAA TTCAACTCAG TGTTTACCTC 540
CCCTCGCGGT GTCGCAAACT TGCGTAGAAT CTGATTTCTT TTAGCTTTGT GTTGTGCATG 600
AGCAGGTGGC CAGTGCGTTT GCTGGCCCTC CACGATGCGG ACCGTACAAG ACAGCTCTAT 660
TAAAAAAGAC TATAAATACT TAAAGCACCA CTGGCCTATT GGTTTCCGTA GTGTAGTGTT 720
TATCATGTTT GCATTACACG CTAAAGGTCT CCTGTTCGAA ACTGGGCCGA AGCATACAAT 780
TAGTGGACAC TTTTGTTCAA AGCGACATAC AATAGTGGAG GTATTTAGCG ATTCAACAAG 840
ACGAGGCAAT GCATACGAAA AAGGGCTATA TATTCCAAGT AATTTGTTTG TGCTCAGGGA 900
ATTTAGTGCT GGAGTAGGAG TGTCGTTTTC TTTAGAGAAA GGGATATTCA CCGGGGTTCG 960
GGTGTACTCT GAAGAGATGG GTGTTAGCTG TCGTTTGAAG GAGACCAGTG TATCCATAAT 1020
CCGAGTGGGA ATGGCAAAGT GATTCCACCA GCGTAGAACA TTGAATGAAA ACATTGTGGA 1080
AAGTGACTTT CAGTCTCTCT GCGATGGCAC CACAAGACAG TGCTCTCACC CTAACCGGAG 1140
GCTCCTGTGG TTATCACGAT GGCTTTACAA GCGGAGGGTC TCCTGTTAGA AACTGAGCGG 1200
AAACATTCAG ATTTGCTTTT ACGCGCATTC TCAATTGGCT CTCTGCTCAC TGGATGATGC 1260
ACGATACAAG GTTGTGGATC TGTCAAATGT CATGACTTGA CGTTGTACAA GGATTTGACG 1320
AAAAAATGCC CTGCAAACCT TAAAAATCAA CACCATCCCA GGACAATTCT TTTGATCCCC 1380
TTTCGGTGCA CTTGCATTAA AGCCCGCGTG ATGCGGCGCT TTGTCAGTGT TACTGTATCA 1440
TTCGGACATG GTGGCAGGGA GTTAAAGACT TCAGCCAGAG CGCATCGCCA CAGGCTCGGG 1500
TTGTCAGAAG TGGGATTCGA ACCCACGCCT CCAGGGGAGA CTGCGACCTG AACGCAGCGC 1560
CTTAGACCGC TCGGCCATCC TGACATGCAA GTTTGGCAGG AGCTGTCTCC TGGGAGCCAC 1620
ACCGCAGTAC CGTGACATGG AATCTGGTGT TTCACAGCTT GCCCAGCTCC GTCTGTCCAC 1680
TTTATTGGCG CAGCAGGCAG CTAAGCTGTG CTCGGCTCCT GGGGCTGCGC CTAGTTTCAA 1740
TAGCCAACAC TTGACAGCTG TCATTGCTTA CGGCCACACC ACCCTGAGGG CGCTATAGAG 1800
CAAACAGGAA GTGAGTTGGC AGCAGTGAGG AGAGAAAGGC TCTCCCCATT TTGCTTGTCT 1860
ACCTTTTTGT TTATTGACCT TGAGTGGTTT GTTTGTTTGT TTTATTTTTG TCTTTAAAAA 1920
CCACCCAACA GCAGCATTTT GCTGACTGAA GGGTGGTTAT GTTGTGATTT TTATTTTTAA 1980
TCATGGACAG ATTACCCGGC AACGACATGG GAATGGAGGG ACTTGCACGA AAGGATAAAG 2040
AAAATGGGCT GGATAATTGA CGAAGAGATT AAAAAAATGG ACTTGACAGC AGACAAAGAG 2100
ATAAATAAAA TGAAGAGCCC GGCCAACGAA GAGGTGAAAA AGGTAAGGAT AAGCAAGAGA 2160
TACAAAGAA 2169