EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-42725 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:34996056-34996702 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESRRBMA0141.3chr4:34996411-34996422ATTGACCTTGA-6.02
Foxd3MA0041.1chr4:34996425-34996437GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:34996429-34996441GTTTGTTTGTTT+6.32
IKZF1MA1508.1chr4:34996339-34996351CAAACAGGAAGT+6.02
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr4:34996417-34996428CTTGAGTGGTT-6.32
PKNOX1MA0782.1chr4:34996290-34996302TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX1MA0782.1chr4:34996290-34996302TGACAGCTGTCA-6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:34996290-34996302TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:34996290-34996302TGACAGCTGTCA-6.92
TGIF1MA0796.1chr4:34996290-34996302TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF1MA0796.1chr4:34996290-34996302TGACAGCTGTCA-7.22
TGIF2MA0797.1chr4:34996290-34996302TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF2MA0797.1chr4:34996290-34996302TGACAGCTGTCA-7.22
Enhancer Sequence
GGATTCGAAC CCACGCCTCC AGGGGAGACT GCGACCTGAA CGCAGCACCT TTGACCGCTC 60
GGCCATCCTG ACATGCAAGT ATGGCAGGAG CTGTCTCCTG GGAGCCACAC CGCAGTACAT 120
GGAATCTGGT GCTTCACAGC TTGCCCAGCT CCGTCTGTTC TCACTCATTG GCGCTGCAGG 180
CAGCTAATCT GTGCTCGCCT CCTGGGGCTG CGCCTAGTTT CAATAGCCAA CACTTGACAG 240
CTGTCATTGC TTACGGCCAC ACCACCCTGA GGGGGCTATA GAGCAAACAG GAAGTGAGTT 300
GGCAGCAGTG AGGAGAGAAA GGCTCTCCCC ATTTTGCTTG TCTACCTTTT TGTTTATTGA 360
CCTTGAGTGG TTTGTTTGTT TGTTTTATTT TTGTCTTTAA AAACCACCTA ACAGCAGCAT 420
TTTGCTGACT GAAGGGTGGT TATGTTGTGA TTTTTATTTT TAATCATGGA CAGATTACCC 480
GGCAACGACA TGGGAATGGA GGGACTTGCA CGAAAGGATA AAGAAAATGG GCTGGATAAT 540
TGACGAAGAG ATTAAAAAAA TGGACTTGAC AGCAGACAAA GAGATAAATA AAATGAAGAG 600
CCCGGCCAAC GAAGAGGTGA AAAAGGTAAG GATAAGCAAG AGATAC 646