EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-42209 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:32251503-32253811 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESRRBMA0141.3chr4:32253032-32253043ATTGACCTTGA-6.02
Foxd3MA0041.1chr4:32253051-32253063GTTTGTTTGTTT+6.32
IKZF1MA1508.1chr4:32252960-32252972CAAACAGGAAGT+6.02
IRF7MA0772.1chr4:32252095-32252109AGTTTCGTTTTCTT-6.09
IRF9MA0653.1chr4:32252095-32252110AGTTTCGTTTTCTTT-6.22
PKNOX1MA0782.1chr4:32252911-32252923TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX1MA0782.1chr4:32252911-32252923TGACAGCTGTCA-6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:32252911-32252923TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:32252911-32252923TGACAGCTGTCA-6.92
TGIF1MA0796.1chr4:32252911-32252923TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF1MA0796.1chr4:32252911-32252923TGACAGCTGTCA-7.22
TGIF2MA0797.1chr4:32252911-32252923TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF2MA0797.1chr4:32252911-32252923TGACAGCTGTCA-7.22
Enhancer Sequence
CACCAGCAAT GATCGTCGAC AGGCACCCAA TCAAAAAGGG TTATCAGCAC GATTTGCCTG 60
AAGGTTTCAG TAGTGTAGTG GTTAACACGT TCGCCTCACA TGCGAAAGGT CCCCAGTTCG 120
AAACTGGGCG AAAACAATCT CTGGCTTTTA TGACAATTGT CAAATCAGGC TTCTGTTGAG 180
TACTGACGTT CACTGAAAAC ATTCTTTCTG CAGAGCGGTG TGAGGCTAGA AGTTTGAATT 240
CAGCTCAGTG TTTACCGCCC CTCGCGGTGT CGCAAACTTG CGTAGAATCT GATTTCTTTT 300
AGCTTTGTGT TGTGCATTAG CAGGTGGCCA GTGCGTTTGC TGGCCCTTCA CGGTGCAGAC 360
CGTACAAGAC AGCTCTATAA AAAAAGACTA TAAATACTTG AAGCAGCACT GGCCTATTGG 420
TTTCCGTAGT GTAGTGTTTA TCATGTTTGT ATTACACGCT AAAGGTCTCC TGTTCGAAAC 480
TGGGCGACAT ACAATAGTGG AGGTATTCAA CAAGACGAGG CAATGCATAC GAAAAAGGGC 540
TATTTATTCC AAGTAATTTG TTTGTGCTCA GAGAATTTAG TGCTGGAGTA GGAGTTTCGT 600
TTTCTTTAGA GAGAGGGATA TTCACCGGGG TTCGGGTGTA CTCTGAAGAG ATGGGTGTTA 660
GCTGTCGTTT GAAGGACACC GGTGTATCCG TAATCCGAGT GGGAATGGGA AGGTGATTCC 720
ACCAGCGTAG AACATTGAAT GACTTTCCGT CTCTCTGCGC TGGCACCACA AGACAGTGCT 780
CTCACCCTAA CCGGAGGCTC CTGTGGTTAT CACGATGGCT TTACAAGCGG AGGGTCTCCT 840
GTTAGCAACT GGGCGGAAAC ATTCAGATTT GCTTTTACGC ACATTCTCAA TTGGCTCTCT 900
GCTCACTGGA TGATCCACGA TACAAGGGCA TGGATCTGTC AAATGTCATG ACTTGACGTT 960
GTACGAGGAT TTGACGAAAA AAATGCCCTG CAAACCTTAA AAAGCAACAC CATCCCAGGA 1020
CAATTCTTTT GATCCCCTTT CAGTGCACTT GCATTAAAGC CCGCGTGATG CGGCACTTTG 1080
TCAGTGTTAC TGTATCGTTC GGACATGGGG GCGGAGAGTT AAAGAATTCA GCCTGAGCGC 1140
AATGCCGCAG GCTCGGTTTG TCAGAAGTGG GATTCGAACC CACGCCTCCA GGGGAGACTG 1200
CGACCTGAAC GCAGCGCCTT AGACCGCTCG GCCATCCTGA CATGCAAGCT TGGCAGGAGC 1260
TGTCTCCTGG GAGCCACACC GCAGTACCGT GACATGGAAT CTGGTGCTTC ACAGCTTGCC 1320
CAGCTCCGGC TGTCCAGCTC ATTGGCGCTG CAGGCAGCTA ATCTGTGCTC GCCTCCTGGG 1380
GCTGCGCCTA GTTTCAATAG CCAACACTTG ACAGCTGTCA TTGCTTACGG CCACACCACC 1440
CTGAGGGGGC TATAGAGCAA ACAGGAAGTG AGTTGGCAGC AGTAAGGAGA GAAAGGCTCT 1500
CCCCATTTTG TTTGTCTACC TTTTTGTTTA TTGACCTTGA GTGTTTTTGT TTGTTTGTTT 1560
TCTTTTTGTC TTTAAAAACC ACCTAACAGC AGCATTTTGC TGACTGAAGG GTGGTTATGT 1620
AGTGTGTTTT ATTTTTAATC ATGGACAGAT TCCCCGGCAA CGACATGGAA ATGGAGGGAC 1680
TTGCAAGAAA GGATAAAGAA AATGGGCTGG ATAATAGACG GAGAGGGAAA GAAAATGGAC 1740
TTGACAACAG ACAAAGAGAT AAATAAAATG AAGAGCCCGG CCAACGAAGA GGTGAGAAAG 1800
GTAAGGATAA GCAAGAGGTA CAAAGAAGAG TATGCACAAA GAAAGCAACA GTAACTGTAG 1860
AAGTAGAAAA TGTAAAAGAT GCAAGAAGAT TTGATATAAC CAAAGCAGTC ACGGAGCTGA 1920
TTGGAGAAGG AAGAATGCTG GCGGTGAGAC CCAAACAAAC AAAGGGAGTA TGAAGTAACA 1980
ATGGAGACTG AAGATGACAC CGAAATTTTA ATAGACAATG GATTGACAAT TAAAGGAGTG 2040
AAATCTGAAG TACGGAGTTT ACAAAACAGA GACTATGTTG TTTCGTTCAA GCATCTGCCT 2100
GTTTACCTAG CAAATGAAGA AATTTTAAGC AAGCTAGAGA GATGGGGAGT TTTCCCCATA 2160
TCTAAAATTA AAAGAAGATT GTATCCTGGC ACAAACATAG AAGATGGAAC AAGGTTTGTA 2220
AAAAACAGAT TTCCGGAAGA GATGGTCTCC TTACCATACA GTACCAAAAT CGAGACGGCG 2280
GAAGCGCCAC AGCACTTTAG AGTCATGC 2308