EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-42122 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:31880128-31881296 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr4:31880687-31880706CTGTCACCAGGTGGCGCTA+6.75
CTCFMA0139.1chr4:31880951-31880970CTGCCAGCAGGTGGCGCTT+7.12
CTCFMA0139.1chr4:31881215-31881234CTACCAGCAGGTGGCGCTA+7.99
CTCFMA0139.1chr4:31880820-31880839CTGCCAGCAGGTGGCGCTA+8.36
CTCFMA0139.1chr4:31881082-31881101TTGCCAGCAGGTGGCGCTA+8.79
KLF13MA0657.1chr4:31880398-31880416TTGCCACGCCCACTTCAG+6.79
KLF14MA0740.1chr4:31880399-31880413TGCCACGCCCACTT+7.73
MTF1MA0863.1chr4:31880450-31880464GAGGCGTGTGCAAA-6
SP1MA0079.4chr4:31880397-31880412TTTGCCACGCCCACT+6.18
SP3MA0746.2chr4:31880399-31880412TGCCACGCCCACT+6.71
SP4MA0685.1chr4:31880397-31880414TTTGCCACGCCCACTTC+6.99
SP8MA0747.1chr4:31880400-31880412GCCACGCCCACT+7.22
Enhancer Sequence
AGATGACAAA ACCCAATTTT GGTGTCGATC GGATAAAATC CCTAGGAGGA GTTCGTTAAA 60
ATACGACGCC TGGAAATGGC AAAAACGCCA CTTTTTCGTC GCAGGAAGTC AAAAATATCC 120
AACTTCCTGT TGGGTTTGAG ATATGGCTCC AAGAGACTTT TTTGTATGTT TTGGCATGTT 180
TGAGGTGTGT GCCAATTTTT GTGCATGTGC GTGATTCGTG GATCGGGGGC TTGTCCGTTT 240
AATTTTTCTA GGTGGCGCTG TCGAGTCATT TTGCCACGCC CACTTCAGAA GACCATAAAA 300
AAGGTAAATT TTCGCCACTT CTGAGGCGTG TGCAAAGTTG CGTGAGTTTT CGGGCTTGTT 360
TAGCCCCTCA AAATCGCGAT TCATTGGAGA GAAGAATAAT AATAATAATT AAAGCTGCAA 420
GCAGCGATGA TAGGGACCTC GCACCCGGGC TCACCGCCGT CTGGTGGCCT CAGGATGACA 480
GAGAACAGCA AACAATATTA ATTTAAGCCG ATGTATATAA AGAACCTGAG AAAATCACAC 540
ATTTATGCCA AACTTCCTCC TGTCACCAGG TGGCGCTATG ACTGTGACTC AAGATTGGCA 600
TGTAGATGTC TTCAGGAGAG AATTCTTATC AACCATGTGA ATTTTCAGGC AGATCAGTCA 660
TTTTGTGGCT GAGTTATAAG CCAAACTACC TTCTGCCAGC AGGTGGCGCT ATGAATGATT 720
TAATTTTGTT ATGTGGATGT GTTCAGGAGG AGACTTTTAT CAACCATGTG AAGTTTCAGG 780
CTGATCACAT TTTGTGTGGT TGAGTTATAA TGCAAACTAC ATTCTGCCAG CAGGTGGCGC 840
TTTAACTGTG ACTCAAGATT GGCATGTAGA TGCCTTCAGT AGAGGAATCT TATCCACCAT 900
GTGAATTTTC AGCCAGATCA GACATTGTTT GGCTGAGTTA TATTTAATTT CCTGTTGCCA 960
GCAGGTGGCG CTATGACTGT GACTCCATAT TGGCATGTAG ATGTCTTCAG GAGAGGAATT 1020
GAATCAACCA TGTGAAGTTT CAGGCAGATC AGACATTGTG TGGCTGAGTT ATAAGCCAAA 1080
CTACCTTCTA CCAGCAGGTG GCGCTATGAG AGACTCAATA TAATTATGTA GATGTGCACG 1140
GGAGAGTACT TACATCAACC ATGTGAAG 1168