EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-42119 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:31875934-31877370 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr4:31876069-31876088TTGTCAGCAGGTGGCGCTA+6.75
CTCFMA0139.1chr4:31876333-31876352CTGCCAGCAGGTGGCGTTA+6.79
CTCFMA0139.1chr4:31876200-31876219CTGCCAGCAGGTGGCGCTA+8.36
CTCFMA0139.1chr4:31876639-31876658TGGCCAGCAGGTGGCGCTA+9.81
IKZF1MA1508.1chr4:31876453-31876465GCTTCCTGTTCC-6.27
IKZF1MA1508.1chr4:31877240-31877252ACTTCCTGTTCC-6.44
KLF13MA0657.1chr4:31877133-31877151TTGCCACGCCCACTTCAA+6.21
KLF14MA0740.1chr4:31877285-31877299GGACACGCCCCTCT+6.17
KLF14MA0740.1chr4:31877134-31877148TGCCACGCCCACTT+7.73
SP1MA0079.4chr4:31877132-31877147TTTGCCACGCCCACT+6.18
SP3MA0746.2chr4:31877134-31877147TGCCACGCCCACT+6.71
SP4MA0685.1chr4:31877132-31877149TTTGCCACGCCCACTTC+6.99
SP8MA0747.1chr4:31877135-31877147GCCACGCCCACT+7.22
Enhancer Sequence
TCCTCTCAGC AGGTGGCGCT ATGACTGTGA CTTAAGATTG GCATGTAGAT GTCACCAGGA 60
GAGGAATCTT ATCAACCATG TGAAGTTTCA GGCAGATCGA ACATTGTTTA GCTGAGTTAT 120
AAGCCAAACT GCCTTTTGTC AGCAGGTGGC GCTACGACAG ACTCAATTAT GTTATGGGGA 180
TGTGTTCAGG AGAGGAATTT AATCAACCAT TTGAAGTTTC AGGCAGATTG GACTTTGTGT 240
GGTTGATTTA TAATGCAAAC TACCATCTGC CAGCAGGTGG CGCTATAACT GTGACTTAAG 300
ATTGGCATGT AGATGCCTTC AGTAATGGAA TTTAATCAAC CATGTGAAGT TTCAGGCAGA 360
TCAGATGTTG TTTGGCTGAG TTATAAGCCT ATCTACCTTC TGCCAGCAGG TGGCGTTATG 420
ACTGACTCAT TACTGTTTTG GGGATGTGTT CAGAAGAGGA CTTTTATGAG CCATGTGAAG 480
TTTCAGGCTG ATCTGACTTT GTGTGGTTGA GATATAAGGG CTTCCTGTTC CAGGGCGAAG 540
TGTTGAGGTT TGTCATGCCG CCACGGACAC ACCCCTCTGC AAAAACTCTA GATCTTGACA 600
ATATATCATC ACTTAAGCTT TCAGATAACA ACCCACCAAA CTTGGTGCTG ATACAAAAAA 660
AATAGTGGGA GGAGTTTATT ACTCTGTAAA TCATGACATT TCCTTTGGCC AGCAGGTGGC 720
GCTATAACTG TATCTGGATA TTGGCATGTA AACGTGTTCT GGTCTGGACT CTTATTAAAC 780
ATGTGAATTT TGAGGCAGAT CGGATAATGC ATGCCTAAGT TATAATGACT TCCGGTTTGT 840
GGCGAATCGT CAAAGTTTGC GGGGCCGCCA CGGACACGCC CATCGACAAA AACTATAAAG 900
CTCCGCAATT TAACATCGCC AAGGCCTTTA GATGACAAAA CCCAATTTTG GTGTCGATAG 960
CATAAAATCC CTAGGAGGAG TTCGTTAAGA TACAACGCCT GGAAATGGCA AAAATGCCAC 1020
TTATTTGCAG CAGGAGGTTA AAAATATCCG ACTTCCTGTT GGGTTTGAGA TATGGCTCCA 1080
AGAGACTTTT TCGTATGTTT TGGCGTGTTA GAGGTGTGTG CCAATTTTCG CGCATTTGCA 1140
TGATTCGTAG ATCAGGGGCT CGACCGTTTA ATTTTTCTAG GTGGCGCTGT CGAGTCATTT 1200
TGCCACGCCC ACTTCAATAT TGTTATGTGG ATGTGTTCAA GAGATGACGT ATATCAACCA 1260
TATGAAGTTT CAGGCTGATC AGACTTTGTG TGGTTGAGTT ATGAGGACTT CCTGTTCCAT 1320
GGCGAAGCGT TGAGGTTTGT CATGCCGCCA CGGACACGCC CCTCTGCAAA AACTCAAGAT 1380
CTTTACAATA TATCACCGAT AGAGCTTTCA GATGACACCA CTCAAATTTG GTGCTG 1436