EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-42110 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:31834253-31835683 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GSX1MA0892.1chr4:31834854-31834864CCTAATTAAA+6.02
RORA(var.2)MA0072.1chr4:31834850-31834864CTGACCTAATTAAA-6.28
RORCMA1151.1chr4:31834851-31834863TGACCTAATTAA-6.14
Enhancer Sequence
CTCTGTCCTT TCTCTCTCTG GATCCGTGAG ATCTAATCCT CCTTCGGGAG CGTCAGAAGC 60
ACGCTCTGCG GTTTTTTCCG CCGCAGCAAC AAATACAAAG AGGGTCGGGG AATCTGCCGC 120
CCCAGTCATT GGAATATGAG GGGTTAGTGG AGGTGATTTC ACGTGCTGCT GACAGGTTTG 180
AAGTAATAGA TTGGCAGCCA GCACGTGAGC AGCAGCAGCT GCGTCTGACA GGAATGCTGG 240
ATGAGAGAGA ATTACCCAGC AGAGTAGATC CTCCACTAAG GGACCTCCCC TTTTGTCCCG 300
AGCTACATGA TGCGGTTTCT AAATCATGGA AAAATCCGTA TTCAGCACGG TTAATGACAC 360
CAAAAACAGC TATTTATTCA GCAGTTCGTG GGCTAGGGGG AAAGGCATGT ACAGTAATGC 420
CAATGATAGA AGAGGACTTA GCACGTCATC GTCGTCCAGA TATAAAATCT GCAAGGGTCC 480
CTCCTTTGTT GTCGAGACCA TTAAGAGTAA CATCGGGTCT AGTCGGCAAA GCATATATGA 540
CGGCTGGTCA GTCTGTTGGA TGCCTGCACA CCATGTCAGT GCTGCAGGCA TATCAGGCTG 600
ACCTAATTAA AGAGTGCCTA GATGGTGGGG GAGCAACACC CGAACAGCTT CGAGAAGCTC 660
TTCGGGTGTC AGATCTAGCT TTAAGAGCTA CTAAAGAGGC AGCCTCTAGT TTGGGGCGAT 720
CTATGGCTAC CCTGGTGGCT ACTGAGCGGC ACCTCTGGCT GACACAAGCA GAAGTGTCAG 780
AAACCGATAG AGCTATTTTT ATGGACGCTC CAATATCAAG CTCAGGGCTC TTCGGTGACG 840
CCGTCGATCG CGTCGCCGAA TCCTTCGACA GAGTTAAAAA ATGCTCTAGC TCCCTCTGGA 900
CTTTCCCCCC CAAGATCAAA AAGTCAGGGG GCTGTTAAAA GACAGCCCCA GCCGTCAACC 960
AGCTCCTCAT ATCATGAAGT ACAAAGGATA AAACGAAGTC CTGACGTGTT GGGAGTCAGG 1020
CTTCCCAGGG CCCCCCCTGG ACACCGAGAG CACCATTCAG CGCTCTCACT GAACCAGGGT 1080
CCGTGGAGAA AGGGAGAGGC CACCTCACCA CTTATGTTGG TGGGGGGCTC TGTGTCTCCC 1140
GGGCTGGGCG TTCCTCAGTG TCTGAGGGCA TTGGGGGCCC CACCCCCTCT GCGGGGGGGG 1200
TCAAAGAACA ACCAGAGGCC AGTCTCGAGA GGCTGGTACC CCTAGCACAT TTTTTGGCAG 1260
GGTGGAAACA CCTGCCGATG GTGTCCCAGT GGGTCCTGTT CACAGTAGAA CATGGCTACA 1320
AAATACAGTT TTGTGCATGC CCACCTCGCT TCAACGGTAT TGCACCCACC ATAGTGAAGC 1380
CAGAACAGGC TCTGGTTATG TAACAGGAAG TACTGGCCTT ATTAATAAAA 1430