EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-42038 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:31394968-31396674 
TF binding sites/motifs
Number: 21             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF14MA0740.1chr4:31395764-31395778AGCCACGCCCCCCC+6.35
KLF16MA0741.1chr4:31395765-31395776GCCACGCCCCC+6.62
KLF16MA0741.1chr4:31395973-31395984GCCACGCCCCC+6.62
KLF16MA0741.1chr4:31396119-31396130GCCACGCCCCC+6.62
NR4A1MA1112.2chr4:31395863-31395873TAAAGGTCAC+6.02
Nkx3-2MA0122.3chr4:31395777-31395790CAAACCACTTAAA+6.24
RREB1MA0073.1chr4:31395002-31395022AGGGGTGGGTGGTTTTGGGG-6.1
RREB1MA0073.1chr4:31395033-31395053CCCCAAAACCACCCCCCAAA+6.34
RREB1MA0073.1chr4:31395034-31395054CCCAAAACCACCCCCCAAAA+6.74
SP1MA0079.4chr4:31395970-31395985CAAGCCACGCCCCCA+7.61
SP1MA0079.4chr4:31396116-31396131CAAGCCACGCCCCCA+7.61
SP1MA0079.4chr4:31395762-31395777CAAGCCACGCCCCCC+7.85
SP3MA0746.2chr4:31395972-31395985AGCCACGCCCCCA+6.34
SP3MA0746.2chr4:31396118-31396131AGCCACGCCCCCA+6.34
SP3MA0746.2chr4:31395764-31395777AGCCACGCCCCCC+6.74
SP4MA0685.1chr4:31395970-31395987CAAGCCACGCCCCCAAA+7.18
SP4MA0685.1chr4:31396116-31396133CAAGCCACGCCCCCAAA+7.18
SP4MA0685.1chr4:31395762-31395779CAAGCCACGCCCCCCCA+7.45
SP8MA0747.1chr4:31395973-31395985GCCACGCCCCCA+6.11
SP8MA0747.1chr4:31396119-31396131GCCACGCCCCCA+6.11
SP8MA0747.1chr4:31395765-31395777GCCACGCCCCCC+6.44
Enhancer Sequence
GCTTTATCGG GAATGGTGTG CTATGACTTT TATAAGGGGT GGGTGGTTTT GGGGCCCCGC 60
AGGGGCCCCA AAACCACCCC CCAAAACGCA TTGACTTAAC ATTACGCCCA ACTTTGACAG 120
AATATAGCGC CAAGTGTGAA ATTCATACAA ATATGGGATT CACAGCATCT GTAGGGGGCT 180
GCAGCCTAAG TGAGAACATA CCCCGCAAGG GGGTAAAAGT TGCACCCCTG GGGCTCTAGG 240
ACGTCCCAAA GTGGTCCCCA TTGACTTACA TGGGGCCCCA TTGACTCCCA TTCATTTTCT 300
AGACACTCGT AGATACTATT CCCGGAAATC GCCGTAGCGC CAACAGTGAA TATCGTAGAG 360
ACATGGGATT CGCGACATCT CGAGAGGGTT ATAGGAGGCT TCAAACCACA CCCCGAAAGG 420
CGGTAAATGT TGTACCCCTG GGGAGCTAGG ACGTCCCAAA GTCTCCATTG ACTTTACATG 480
GAGCCGAACT TTGACGAATC ACAGCGCCGA GTGTGAATTT CACAGAAATA TGGGATTCAC 540
AACATCTGTA GGGGGTTGCA GCCTAAGTGA GAACATACCC TGAAAGGGGG TATAGGTTGT 600
ACCCCTGGGG TGCTAGGACG TCCCAAAAGG GTTCCCATTG ACTTTACATT GCCCATTGAC 660
TCCCATTCAT TACATTGACT CCCATTATAA ATGTCATATG TCAATCAAAG TACATAGCAC 720
TGTCATACAG ACTTGGGGGT TGGCTTATTT GACTAGGGCA ACCAATCAGC ATCTCATTAT 780
GATTTTGAAG CTCACAAGCC ACGCCCCCCC AAACCACTTA AAGACCCTTA ATAAGTGCCC 840
CATTGACTTA ACATGGGGTG GGATGTCCCA TTGCAGATCC CATTGACTTC CATTATAAAG 900
GTCACACATC TATAACATTA CATAGGAGTG TCATAGAGAC ATGGGGGTGG GCTCATCTGA 960
CTCAGACAAC CAATCAGCAT CTCAATATGA TAATGAAGCT CACAAGCCAC GCCCCCAAAC 1020
TGGTCCCATA GACTGCCATT ATAACTGCCC TACATGCATA TCTTTGCTTA GCAGTGTCCT 1080
ATTGACTTGG GGGATGGCTC ATCTGACTCA GACAACCAAT GAGCATCTCA ATATGATAAT 1140
GAATCTCACA AGCCACGCCC CCAAACTGAT CCCATAGACT GCCATTATAA CTGCCCTACA 1200
TGCATATCTT TGCTTAGCAG TGTCCTATTG ACTTGGGGGT TGGCTCATTT GACTTGGACA 1260
GCCAACCACA TTCAAGTTCA CTCTGTAACC TCGCCCATAG CAACAAAAGA GAGTACCCTA 1320
GCAACCGTTC ATCAACAGCT ATATCTGAGC ATCGGAACAT CGTAGAGACT TGGGGATTGG 1380
CTCATTTGAC TCATGCTAGC AAACGGAACT TCCTATATGC TACACATGCT AGCAGTGACT 1440
AGCTACATGC TAATATTGAC TAGCCATGTA CTGTAACTTG CTAGAAATGC TTACTAAGTA 1500
TAAATATTTC ATCAGGCAAG TATGTAAGGC TTGCCTAGTA ACCACCCAGG GTACCCTAGC 1560
AACTGCCTAG CAACCACCCA AATTACCCTA GCAACCGCCT AGCAACCACC TAGCAACCGC 1620
CTAGTAACCA CTCAGGACAC CCTAGCAACC GCCTAGCAAC CACTCAGGAC ACCCTAGCAA 1680
CCGCCTAGCA ACCACTTAGA ATACCC 1706