EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-41735 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:28755980-28757644 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr4:28756764-28756775TAATTTAATCA+6.62
DUXAMA0884.1chr4:28756763-28756776GTAATTTAATCAA+6.74
Sox1MA0870.1chr4:28756037-28756052TACAATTACATTGTC+6.6
Enhancer Sequence
AATTTAGGGG ATATCCTAAT GTTTTTTCAC ATCATTCCAA ACCAGTAATG TATTATTTAC 60
AATTACATTG TCAGTAAGAC AGATTACATG ATTTATACTT TTAATAAACC CCAGGGAATT 120
TTGTCTTCTT GGATGGTGTA AGAAATGAGT CTGCCTCGAC CCAACTTCCA CTCTAAATGG 180
TGAATTGATG CTCATTTCCC AAAAGGGCTG ACTTATGAGA GAAAAGTGAA ATCAACAGGG 240
TCTTGTCTCT GCATCGTTTG AGGTGACTAC ATCTTGACCA AATGGTAACA ATTGTAGAAT 300
GGGGATGGGT GTGGTGCACA GAGAACCATC TCATCAATGG TGTTGAAACT GCATTAACAT 360
GATAGCATAG AGAGAACAGC TGGATCAACA GCCAAGGAGC AACTTCATTA ACATCTAAAG 420
GCAACATCAA TAACAGTATA AAGGTCCCAA TGTACTGCCA TGTATTTTGA GACTGCTATG 480
CTGAATAAAC ATCTTCAATG AGATTTTCTT CGTCATCATT TTTCTTACAA TGGAAAAATA 540
AAGATTCAAA GTCAATCCAC AGAGCGTCCT GCCTATTTGC AACCCAGCTT GTTATGCTTT 600
GGAGTTGGGC AGCCCAATAA TAAAGCTGGA GATTAGGTAA GGAGAGACCC CAATATCTTT 660
TGGTTTACAA AGTTTAGAAA GACTGACTCT CTGTTGCCTA TTATTCCAAA TATACATATA 720
TATGCAAGAA TTCAATATTT TTAAAAATAA TGAAGCTAAA TAGCATGGAA GATTTTGAAA 780
AAGGTAATTT AATCAAGGAA GTATGTTCAT TTTTATGACA TTAACTCTTC TGAGAAGGGA 840
AGTTGGCAAA GGAGTACCCT TCTTGAAGTC TTTTTCATTT TATTTAAATA AGGGAAAAAA 900
AATTCTTCAA ACAAATTATT CAAATCAGGA GTGAGAAAAA TGTATTTAAA GGCTTTTTAG 960
AGACCTCAAA GGGAAATTGC ACAGGAGGGT TCTGGAAATA GTTAAAGGAC ATAAAAAACA 1020
GACTTTTCGA TGTTAACTTT ATAACCTGAC ACAGTGCTGA ACAAAGCTAA TGAAAACAAG 1080
ACCTGCAGGA GTAGAGGTAT GTAAATTCTC TAAATATAAG AGGATGTCAT CTGCATACAG 1140
GGAGATGATA TGTTTTTTTT CCCTTTAATC ACAATTCTAG ATATATCAGC ATTGGTCCCG 1200
ATAGACTCTG CTAGAGGTTC AATAAATAAT GTGAACTACA AGGGTGATAG GGGACAACCC 1260
TGTCTGCAAC CTATGCGTAC TGGAAATCCT TAAGAAGTCA AACCATTTGT ATTGACCGAG 1320
GCAACAGAAT CTGCATAGAG ATACTTAATA ACATTAATAA AATTAGAACT TAGTCCAAAT 1380
TTTTTCAAAG CTAAAAACAA GAAAGGCCAC TCTACACAGT AAAAATCCTT TTTGGCTTCC 1440
AGAGATAATA TCATTAATGT CTTTTTCTGT GTATGAAAAT AATGTGGAGA CGTACATTAT 1500
CCAATCCATG CCTGGATTTC ACAAAGTCTG CTATTTATAA CCTTAGGAAG GATAGATTCC 1560
AATCTGCGAG CCAAAACTTT TGCCATTATC TTATTGTCTA CATTAAGGAG ACTGATGGGC 1620
CTATATGATG AGCAATCTAT AGGGTTTTTA TCTTTTTTAA GAAG 1664