EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-40945 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:2423396-2424358 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr4:2423645-2423662ATAAAATAAACAAAATA+6.02
NR2C2MA0504.1chr4:2424040-2424055TGACCTTTGACCTAT-6.74
NR2F1MA0017.2chr4:2424036-2424049CACATGACCTTTG-6
Nr2f6MA0677.1chr4:2424040-2424054TGACCTTTGACCTA-7.64
RXRBMA0855.1chr4:2424040-2424054TGACCTTTGACCTA-7.19
RXRGMA0856.1chr4:2424040-2424054TGACCTTTGACCTA-7.25
RxraMA0512.2chr4:2424040-2424054TGACCTTTGACCTA-7.25
Enhancer Sequence
TCGTTACACA TTTTATTCAT ATTTTATTTT CCACCTATAA GAAATAAATT GATGCCATCT 60
TTTTAGTTAA TGTCAGCATT AAGGTTTCAT TCAGTATTTG TCAGAATGTG GCTCTGATGT 120
GACAGTCTGT GAGTTAAAGG GTTTTCCTTT GCTAACTTGT CAGATGAGTT CCTCTAGTGA 180
ACAAAAAAAG GAACTTTGAT GAAATTAAAG ATCAATAATA AAATCCAAGG ATAGATGTAC 240
AAAACAATAA TAAAATAAAC AAAATAATTG TTTAATTAAT AAAATAAAAC TATTTAATTA 300
ATAAAAATAC ATAAAATAGT TGCATATTGT TATTCAACAT TAGTAAAAGC ACTCTGCAAG 360
TTGGGTCTGA ACGTTTCAAA GTTTGTCCAC AACAGGGCAG CACGTCTTTT GTTATATTGT 420
GTAAAATAAA AAAAGATAAA GTCTTATTTG TTTTATTTTG GCAGTAATAA AATCAGTTTT 480
AAATAAAATT AAAAAATAAT TTTAAGGTCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT 540
CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTGT CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT 600
CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTATCT ATCACACACA CACATGACCT TTGACCTATA 660
ACCTAAACAA CAAATAAATG TCAATCATGT CGTTACACAT ATTATTAATG TTTTATTTCC 720
CACCTATAAG AAATAAATTG ATGCCATCTA CCTGTAGATA CGTAGATGAA GAGGCGCCCT 780
CTAGTGTATC TAGGGTGATA AATGTCTGTG TTCGAACTGG CTAAAATGTG CAATGACGTT 840
AGCCGCTTCG AACAAACAGG GGGCGCTAAA CTGCGGTTTT CTCTGTGTTA GTATTTATGA 900
TGTTTAACAG AGTAAATGAA TGTACAGAGT ATGTCTGATA ATGTTTTTTT CTTCTGGATA 960
AA 962