EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-40802 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:62262948-62263892 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr3:62263579-62263596GGCTATTAATTAGTTCA-6.07
IRF1MA0050.2chr3:62263289-62263310AATAGGTTTCGTTTTCTTTTT+6.19
IRF9MA0653.1chr3:62263293-62263308GGTTTCGTTTTCTTT-6.02
MEF2AMA0052.3chr3:62263499-62263511GCTAAAAATAGC+6.44
MEF2BMA0660.1chr3:62263499-62263511GCTAAAAATAGC+6.92
MEF2CMA0497.1chr3:62263497-62263512CAGCTAAAAATAGCT+6.56
MEF2DMA0773.1chr3:62263499-62263511GCTAAAAATAGC+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:62263202-62263214AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:62263201-62263213TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr3:62263200-62263212TTAAAAAAAAAA+6.44
Enhancer Sequence
TACAGTGACA CGAATCGTAA TCGCATCGAA ATCCTAAATT ACCTACGACA CTCACGGGTC 60
CATTTTGAGC TGAAACTGCT TTATAATGTT CTAAAAGCCT CGGCGGGTTA AAACTGCTGC 120
TGCCCCGGCG ATCATGGAGA AAAAAACGAC TGGTCTGGTC ATGAGCCGCT CGCTGACGCC 180
GGTGTTACAC CGGACCGAAT CACAGCTGAT CTCCTCACCT GCTTCCTGCA GGTGATCTCA 240
TAAAAGTAAA TCTTAAAAAA AAAAAACACG CATATTTTCG TCACAACAAG CGCCACTAAA 300
GTTCAGCGAT AACTAACGTT ACTGTATTTG TAATGCGGAT AAATAGGTTT CGTTTTCTTT 360
TTTAAAAATG TAGACCTACA GCTACAGTTT GTGTTAACTT TACATCTATT TGAACGGATC 420
ATTGCGCGCG CTCTTGCTCT CTCAGTGCAT CATTTAATAT GGCGCGGCCC GCTCTTTTAG 480
AGCATAACGC CCACTTTACA AATTACTACT AACTTTACAA ATTATTAATA GTTATTAAAA 540
AGGACTAAGC AGCTAAAAAT AGCTTATCTA GTAAAGTAGA CAGTATTGCA AATAACGTGC 600
AGTGGTCAAA ACGTTTAGTC ACAACATCAT GGGCTATTAA TTAGTTCACA AAACAGCAAA 660
CAATTTCACA AAGTGCAGGA AATAAACAGA TTACTGATAC TATACAAATA AAATCAAAGT 720
AGTAATTAAA ACGAAAAGTT TACCTTGATT TTACAGCAGT ACATCTTCTC AATATGAAAT 780
CCTGTCCTTC AATGGCGGTG CTGGGTGGCG GTTGGTTGTG ACTCGGGATG GGGGATGGGA 840
AATCACCACC CAGTACGCAT GCGTACCAGC ATGGCTTAGC TCTTATAAGC AATTTTACTC 900
CAATTACATT AGTTATGGGA ACTTTATACC TTACTATGTC AGCA 944