EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-40729 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:61119570-61120728 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRTA2MA1478.1chr3:61119632-61119644ATTTGTTACATT+6.44
RREB1MA0073.1chr3:61119792-61119812GGGAGGGTGGTGGTTTGGTG-7.34
TBR1MA0802.1chr3:61119587-61119597TTTCACACCT-6.02
Enhancer Sequence
AGTGATCCTA AGGGTGCTTT CACACCTGTG AATCGATTCA GTTGTTCCGA AACAGGGATT 60
AAATTTGTTA CATTGTTGCT CTTTGCTCTT GGTGCGGTTT GCTTTCACAC GGCAAAGTTT 120
CTAAACGAAC CAAAAGAGCT AAAACAAGTC ACGTGTGAGT AAACTCTCCT CACATTGGTC 180
AGAGTGTCAT GTTTTGTTTT GCAGAGTCCC ACTCAGCTGT CAGGGAGGGT GGTGGTTTGG 240
TGTTTTGACA GGGTGCGTGC GACGTGTCTG AAGACCGAGG AGGGATTTCT CACTACAATC 300
GATCTGCTCC AGAGTTTGTA TTAATCGAGC CGAGACCACC TAATTCAAGC AATCTGGGAG 360
CGATTGTTTT GGCGCGGATC CGAGCACGAT TGGTGGATTC ACATATGCCA AACGAACCGC 420
GCTAACTGGG CAAATGAGAC AGGTTCCCAA ACAAAAGTCT AGGTGAGAAA GCACCCTAAG 480
AGCTATGTTG TTGGGTCTAC TGCTAAAAAG GTCTTAAGTG ACATGTCAGA CTTAAGCCTG 540
GTTTATACTT CTGCGTCAAG TGACCGGCGT AACCCACGGC GCATGCATCG CGCGTAGCTG 600
TGCATTTATA CTTCTGCGCT AGTGTCTCTG TCTGAATTAA CACTTCTGAA ATGCTAGTGG 660
GCAGTGAGGT GTTAATGTTT TTCTGTGTCG AGTTTCTTCT CTGCTGTTTT GCTTTTCCTA 720
AACACTTCCT GGATGTACAA GTGGCTCAAA CTCGCTCATT TTGAGGCAGG AACCGGCGGA 780
CGTGCAACAA CTTTAACTAT GAGGTAAACA CAAAACTTTC CATCAGGAGC TCCTTCACGG 840
GAGCTCCTTC GCGTCCATCT CGCGCGGCTC TCGGCACCGC CCAGACTCGT CAGCGCTACC 900
AAGCCAACCA ATCACAGAGC TTGCGCTACG CGTCGTTGCA ACGTGTAGTT ACAGTTTTTG 960
AGAGGTGCAC GTCAGCGACG GCCACGGCGA AGGGCTATGC GTCAGCGCCG TAGCATACGC 1020
CAGCGTTTGA CGCAGAAGTA TAAATCAGCC TTCTAGAATT AAAACAATTC GCATCCACAC 1080
TGGTATTTCA GCTAGCGTTT TCTGAACAGA TCCACACTAC ACCTCTAAAA ACGCACACGG 1140
ACACTCTGGC AAGCGCTG 1158