EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-40556 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:57903162-57904774 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr3:57903723-57903733GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr3:57903754-57903764GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr3:57903723-57903733GTCACGTGAC-6.02
BHLHE41MA0636.1chr3:57903754-57903764GTCACGTGAC-6.02
Foxq1MA0040.1chr3:57904235-57904246AATTGTTTATT+6.02
MITFMA0620.2chr3:57903719-57903737CCAAGTCACGTGACTAAA+6.84
MITFMA0620.2chr3:57903719-57903737CCAAGTCACGTGACTAAA-6.84
MITFMA0620.2chr3:57903750-57903768CTTGGTCACGTGACTAAA+6.97
MITFMA0620.2chr3:57903750-57903768CTTGGTCACGTGACTAAA-6.97
MyogMA0500.1chr3:57904454-57904465CTGCAGCTGTT-6.02
Tcf12MA0521.1chr3:57904454-57904465CTGCAGCTGTT-6.62
USF1MA0093.2chr3:57903753-57903764GGTCACGTGAC-6.14
USF2MA0526.2chr3:57903719-57903735CCAAGTCACGTGACTA+6.01
USF2MA0526.2chr3:57903752-57903768TGGTCACGTGACTAAA-6.02
USF2MA0526.2chr3:57903750-57903766CTTGGTCACGTGACTA+6.65
Enhancer Sequence
ACAAAAACAC AAGAACTATT GACAAACTAA AAAGAGAAAT AAAATTAGTT TTAACTTACT 60
GATAATAAAC TGGAAGAATC AAAACCAATT AAAAAAAGGA ACTAAACACT TATAGCTACT 120
AAATAAGATG GGGATAATAC TGAAAGCCAA CTGAAAAACA CAAACAAACA TTAGACAAAG 180
ACAACTCTCA CACAAACAAC AGCACAGGTA AACGAGCACG GTCAGGCAAC AACAGGTAGC 240
AGGTAACAGG TAGTAAGTAA CAGGTAGCAA GTAACAGGTA GCAAGTAACA GGTAGCAAGT 300
AACAGGTAGC AAGTAACAGG TAGCAAGTAA CAGGTAGCAA GTAACAGGTA GCAAGTAACA 360
GGTAGCAAGT AACTGGTAGC AAGTAACTGG TAGCAAGTAG CAGGTAGCAA GTAGCAGGTA 420
GCAAGTAGCA GGTAACAGGT AGCAGGTAAC AGGTAGCAGG TAGGGATGGC TGACGTGAAA 480
CTGACGTTTC GACACAGTGT CGAGATCCCG AAGCGCAAGT GTTTCGAAAC ACTGCACCGA 540
AGCATGATCC GAAGCACCCA AGTCACGTGA CTAAAGTGTT TCGAAACACT TGGTCACGTG 600
ACTAAAGCGA TTCAAAACAT TGCTCACCTC AGAAGCGTTT TGAGACCTGG CGAATCTCCA 660
TTTGGCTGCC AAGGTCAGGA AAAATTTCAT TTTATATGGC CTAGTGGACT GTGCATGTGC 720
ACGATGTTGC TATTCATTAA TTGACTTCTT GGGTTCGAAT CCCGACTTCT ACAAATACTC 780
CAAAAACATT TTTGTGGTTT TATGAGTTTT TATCATGTTT CTGTATTTAG CCTAAATATG 840
ATACAGCTGC AGTTACGCCA TCAATTTAGC ATCATTTTTG TAACACTGTA AAACAATAAT 900
AATTATTTTA CAGTACTGTG ATAGTTTGGT TTAGGGTTTG GGTAGACATT AATAAAATAC 960
AATAAATGGG AAATTTTATG AATAATATAA ATAATTCTTG ATAACTTCAG GCCACAGTTT 1020
CTGATCTAGC AACAACCCTG TTTTAAGACC AAAACAAGAC ATATTTATTA ACAAATTGTT 1080
TATTCGGATA TCAGACAAAT GTTGAAACAA AACGATTCAA GAGCAAAGCA TTACCAACTG 1140
GTATTAAAGC ATTTCAAAAT AGCTGATATT GCCCGGCTTC GAACCCACTA TCCCCAATTG 1200
CTAATCAGAC ACTTTAACCG CTCCGCTACA TTGAATGAAG TGTACACCAA CAAAGTAGGC 1260
TTCAATACCT CAATTTGCTC AACTGCTATG TGCTGCAGCT GTTTCAGTGC AATACATAAA 1320
AAAATGACCG CTAGGTGTCA CTGTAGAGTG GTGTTTCGAA ACGTTTCGAA GCTTCGACAC 1380
ATTTGCTTCG ACTGTTTCAG TGTTTCATGA AGCCTCACTT TGCCCACCAC TAGTAGCAGG 1440
TAACAGGTAG CAGGTAGCAA GTAGCAAGTA GCAAGTAGCA GGTAGCAGGT AGCAAATAGC 1500
AGGTAGCAAG AAGCAACAAT GAACCGACAA AGACATCAGG GGAGGGAAAA CATTATAATG 1560
GGAGGAAAGA ACAAGAGGAC CAGGTGTAAA CACTGAGACA AACGAGGACT AG 1612