EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-40483 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:56562768-56563882 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArntlMA0603.1chr3:56563820-56563830GGTCACGTGC+6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:56563282-56563300GCTTCCCTCCCTCCCTCC-6.16
Foxa2MA0047.2chr3:56563810-56563822TGTTTACATTGG+6.62
IRF4MA1419.1chr3:56563689-56563704TGGTTTCGGTTTTGG-6.78
IRF5MA1420.1chr3:56563690-56563704GGTTTCGGTTTTGG-6.2
IRF9MA0653.1chr3:56563690-56563705GGTTTCGGTTTTGGT-6.66
Enhancer Sequence
GACGTCTCGC CCTGCCGGCG CCACCCAGAC GTCTCGCCCA GCTAGCCCCA GCTCGGCGCC 60
CTGCCCTGCC GGCCCCATCC AGACGTCTCG TCCTGCCGGT CCCAGCCCGA CGCCTTGCCC 120
TGCCGGCTCC CCTCTGGTCT CCAGCCCTGC CGGCTCCCCT CTGGTCTCCA GCCCTGCCGG 180
CTCCCCTCTG GTCTCCAGCC CTGCCGGCTC CCCTCTGGTC TCCAGCCCTG CCGGCTCCCC 240
TCTGGTCTCC AGCCCTGCCG GCTCCCCTCT GGTCTCCAGC CCAGCCGGCT CCCCACCGAC 300
CTCCTGCCTT GTCTCCCCTG ATAGACTCTC CCTGGGTCGT CCCTCCTGCT CCTCCCTGGT 360
GTTCCCTCCC TGCACCCTGG ACGGACCCTC CGGCTCCACC TTGGCTCCCT GCCGGGGCCC 420
CCGACCCACT GAATCCACCC TGGACTGTCC CTCCTGATCC TCCCTGGTCT TGCCCTCCCA 480
TCCCTCCCTT GTTTGTCTTG TTGGGTCTGG CTTGGCTTCC CTCCCTCCCT CCCTTCATGT 540
CGTCTTGCCT GTTCACCCCC CTGTCTTGTG TCTGTTGATG TTGCCTGTTT TGTTTTCTTG 600
TCTGTCTTGT ACCTTGTTGG ATGTTCCCTT TAGGGACGCC AGGTGGCGTC CCTTTTGGGG 660
GGGGCTAGTG TCAGGGTTCT GCCACTCTGG TCTTTGTAAA TTCTTGTTTT GGTGGCAGAG 720
CTCTGACACT ACCCATGTCC GGTCCTGTTT CTGTCTCTGT GTGCGCGCGC GCCGTCGTGG 780
GTGTACGCAG AGTGTGCGCG CTTCTGCTTG ACACGGCCGC GCGCGCGCTC TGCGTCCCTC 840
AGACGCGTGC GCTCTTGTAC TCGTGTTTGT GTTTTCGTCT GTCAGCAGCA TGGTGTTTCA 900
TTCCCAGCGT CTCAGTCTTG TTGGTTTCGG TTTTGGTCGG CGCTGGGATG AAGCATGCAT 960
GCTGCATATG TGAGCGCATG GTGAGTGTTT TCATTCATCG TGTGCTCGTG TCTTGCGTCT 1020
TTTGTCAAAG CACATGGCTC GGTGTTTACA TTGGTCACGT GCTTTTGTCG TGTGCTTCAG 1080
TGTTGTGTTA TGTGAGCGCA TGGCTTGTAT TGTC 1114