EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-40335 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:52465901-52467267 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr3:52466911-52466927CATAAAGTAAACATAC+6.35
FOXC2MA0846.1chr3:52466914-52466926AAAGTAAACATA+6.11
FOXD2MA0847.2chr3:52466912-52466925ATAAAGTAAACAT+6.15
FOXE1MA1487.1chr3:52465909-52465924CGTAAAACAAACAAA+6.49
GRHL1MA0647.1chr3:52467059-52467071AAAACCGGTTTG-6.62
GRHL1MA0647.1chr3:52467059-52467071AAAACCGGTTTG+6.74
SIX1MA1118.1chr3:52466013-52466024GTAACCTGAGA+6.02
TFCP2MA0145.3chr3:52467060-52467070AAACCGGTTT+6.02
TFCP2MA0145.3chr3:52467060-52467070AAACCGGTTT-6.02
Enhancer Sequence
CTAATCTACG TAAAACAAAC AAATGCACAT ACATACACAC ACGCACAAGC AGTTTGAGGA 60
GAGTTATGAC TGAGTGGATT CAACTTCTAG CCTTTGCTAA GTTCTTAGCA TTGTAACCTG 120
AGAGAAACCG TAAAAGCAGA GAATTTTGCT ATTCTTTACT ACTTAAACAT AATTCACACC 180
AGATTCAGTA ATGGGTAGAA ACCTTGTTTG TGCTACTTGC GTTCTGATGT AATTTTTGGT 240
TTCCTTGACT GGTCCAAAGG GAAATCCCGG CGAAGCTGAT TGGTCAGCGT AGCAACTTCA 300
GTGACGTGAT GGAATTCCCT TGTCGGTGAA GAGGGGTTTC CTTAGTCGGT TGCTAGGGAT 360
ACGGATGTTG GACAAAGCGG CGTTCGAAGT CCTTCCTGGG TTCCTGTAGT TATGATGAGT 420
TTCAGAGTTT GGATGTGTTG ACCCGATGGC TTGTTGTTGA AGCCGTTGCA CAAGCAGATC 480
GGGGGTCGAG CCGGCAGCAA GTGAAGGTCG CGGTCTGCTC CGTAATGTAA CGAGGCTTCC 540
GGCGAGGCGA TGTAACGGCC ACAGCAAGAG AAGAGCGACG TCCGGGCAGC GACGGCGGTG 600
ACGACTGGCA AAGATGACCG GCAAAAGACG ACGATGAAAT TTCTTTGTTC AAAGTTTTAT 660
AGGCTTTGGT AGAGGCTGGG TCTACACAAT GCTTGTCCAA TCAGATAAGG TGCGGGGTGG 720
AGTCACACCC CAATTCTGCC CTCTAGGAGG CCGGGTTGAC ACCTGGTGTG GGTGCTGCTT 780
TGATAGCATA GTGGTTAAAA TAAAGTCTTA TAACGTCAAC ACTTTTCATA GTATGGTTTC 840
TTCATATAAA CCAATGCATT TAAAATGTTC CTAGCTTTCA ATCGATACCA AACAAAGTAT 900
TTCACAAACA TTCTGTAGAT TTCATTTGTC ACTGAGGGCT ATTACTCAAG AACTATCTAT 960
AACAGTTTTG TTAAACACAT GGAACATGTA CACACAAAAA CCTACAGAAA CATAAAGTAA 1020
ACATACATTA CTCAAATAAA CTGTTTTACT TAAATGTCCA TTAAACTTTG GAAGCGTTTC 1080
TGATCGCTTC TGTGTCTGCC TGAGAATGTG TATTCCTTGC AGACGCCAAA GGACAAGCGA 1140
ACCAAAAGGT ACTTCTCAAA AACCGGTTTG GTGGGTTTTT GATTGTAGAG CCTCTTATTG 1200
TTTTAGGGTG TAAAGTTAAT TAACACGCAA CTGTGATGTT GACTGGCTAG GTATCCTGTG 1260
GATTTGCCTT TTGCTGGGTG CCTGTGGATT GCTTTGAAAA TGAAATCAAT CTCAGACTCG 1320
TAGGCACCAA CCAATCTTTT AAGGATAACA TGGTCTGTGG CTTGTT 1366