EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-40164 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:48565503-48566537 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RUNX3MA0684.1chr3:48565889-48565899TTTGCGGTTT-6.02
ZNF384MA1125.1chr3:48566509-48566521ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr3:48566510-48566522TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
AAAAGGTTAT TTCACCATCA AAATGTAGCC TGTTATATGT ATCATTAACG TTTTATATAA 60
AACTGCTGTG CAGTGTAAAT GGGACCTTAA TACAGTTTAA AGCGAAGTTG TCTGTAAGGA 120
TGATGGGCAT GGCATGTCTA TTGTTGTGGC TCGCGTTGTG AATATTAGAA AATAACTGTC 180
GGGTGAAGGC TTTATGGTCG TGCGGAATTG TCTGCTGCTG TCATGGCTCA GCAGGCAACA 240
CCCTATTCAG CTAGGCTATG TTCGGTGTTT GTATGTACAA ATTCGTTTTG GCGAATGCTA 300
GAGCGTAATA GAGATATTTT AAATAACAAG TATAGTTCAG TCCAGAAGTT GCTGTGCATA 360
GAAACATTCA TTTTCATAAG GCCCCATTTG CGGTTTGGTT TTAAAACGCA TAGGTTTTGC 420
TACGGTTACG CCATCCGTCC TCGGGAGTTT TGGATTTTGT GTAACCATGT TTGTGGAAAA 480
CACTTGAGGG TGGAGACATA CCCCTTCCCC CGTCTCATAA CCAAAAGCTT GTCTTTCAGG 540
TGTTAATGGG CATCGAGACC GAAGTCATGT CGCATTTCCA CTGTCGGCCT ATAGCTCGCA 600
GCGCGTAACG CAAACCCAGC CCCCAGAACG TCCCCCGAGT GTTGGCATCG TGCATCCGTC 660
AATAACTCGG TAGAAAATGT ATTTTATAAC ATCCTCATTT AGACACAGTC AAACATTCAG 720
CCCAAATGCA CTGGGCTGCG TTTCCCGATA ACGATTGATC TTAGCACTTA AGAGCGTTTT 780
CTACGAGTCA TTTTGCGAAC GTTCGTTATT GTTTCACGTG CGTTTCCCAA AAATGCACTT 840
AACACAATTG CACGTAGCCC AGCTTTAAGT GCAACTTAGG AGTCGCTATC CGTTTGTTAA 900
GTGCTGAAAT GTCACGCTAT AGAATGGCTC GTTATTGTTG CACATGTTAT AGCAATCCAT 960
ATAATTCTTC TTCTACTTGT GTGAATGTAT ATTCAACTCG AATAACATAA AAAAAAAAAT 1020
ATTTTTGAGC CAGT 1034