EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-40119 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:47851963-47853413 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NR2C2MA0504.1chr3:47853352-47853367GCAGGTCAGAGGTTA+6.05
RORA(var.2)MA0072.1chr3:47853195-47853209TTGACCTAAATTTT-6.25
Sox3MA0514.1chr3:47852659-47852669AAAACAAAGG-6.02
Enhancer Sequence
GTTTTTAATG TAGTCAACTG TTTACAAATA CAAGTTCAGC CATTTAGAGC TCATTTCTGG 60
TTAATGATGT CAGAATTTAC CAGTATTGTG GAATGGATGT GTGAACGGTC TTTTCCTAAA 120
ATATTGCGTA ACGTCCTTGC CTGTGTGAAC AGCGCTTTTT TGAATTTACC AGTAAAGTTG 180
TTCTGGAAAT TTTCCAGATA TTTAACGTTA TCACTGTGTG AAACCACAAC CCATTTGCTC 240
ATGCACATTG GGCAAGCTCA TACACAACAC ACAAAAAAAG TGAAATGAAT GAGGAGGCAT 300
GTGGATATAA CACAAAATTT AAATCAAGCA AGTTTAGCAT GTCAAATTTA TGCATATAAA 360
ATATATTTTC CCAGCAACAA AAGTGTGGCT AGTGAACTCC TACATCACAT TGCGGTGGGC 420
CTCAAAATAG AAGGGATTTG GATGTGAAAA TGAAAAAAAA AACCAAGGCA CTTACCACTA 480
TTTCAATTTA AATCACCCCA ATATGACTGT GGACACACTA CACCTACACA CCTTCTGTTC 540
AAACAGCTTT CACGATAGAC GATTTTCACG ATAGGTGCCC ATAAATACAA TTTTTGGTTT 600
TGGTATTTTT GTTCTTTTTG TTTGTTTCAT TTTTGTTTAA AACTTAAAAC TTATTTTTTA 660
TATACAAGAG ATGAACCAAA GTAATGAACA AAGGAGAAAA CAAAGGCAGA GACGCTACAT 720
GCAGCTGAAA CATGTTTACA CATATGACTA CGTAGAGGTC TGTGTGACTG GCATGCATAC 780
ATGAAAAAAC AGTTTTGAAC TCCAACGTAG AGGAAGGAAG ACTTAAACAT GTCATGGGTT 840
ACGTTTGATT ATGTGCTACG GCTTTTGAGA CCCTTTTTGA AACTACTGCT GCAGACTACT 900
TGTGTTGTAC CTAAATCTTA TCCGACTCCC CAGTTTCCAA AAAGCACTTA CCATACACAT 960
TCATGCGTGT CACAGGTAAA CTCGCAGCAG TTTATTAGAA ACTATTTATT GATTAGTTTT 1020
TTTTTCCGCA GTTAATAAAA TGGCAGCAAA ATGTATTTGG ACAGAGGATT TAAAGACTTA 1080
ATTCCATGTT TCTTCAAAAC ATCTTCTTTT GTGTTCAACG ATGACAGAAT GTTAATTTGG 1140
GGTGAACTAG CCCTTTAAGA AGCTTGTGCT TTGTATGCAA TTTGCAACGA TTTTAAAAGC 1200
ACTCCTGTTC TCTTTGCTCT TAGGATCTGC ACTTGACCTA AATTTTAGTG ACATCAATGT 1260
TGCCTCTCTC GACAAAGAGC TAGAGGACCA AGACAACAAT GGCCTTGCTT TAACAAGTAA 1320
GTGTTCTTTG TCAATGTTTG TAGTTTGGTC CTTGGTTTAG GTTGATCTTC ACTGGACTCC 1380
TTTTGCTCTG CAGGTCAGAG GTTATTAGGA GGCTCTGCTC CAGTTAATAT TCCTGGCTCT 1440
CTGGCTCGGT 1450