EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-40114 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:47843779-47844867 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXD2MA0847.2chr3:47844580-47844593ATGTTTATTTAGC-6
FOXE1MA1487.1chr3:47844579-47844594AATGTTTATTTAGCA-6.24
FOXP2MA0593.1chr3:47843951-47843962AAGTAAACAAA+6.62
Foxj3MA0851.1chr3:47843948-47843965AGCAAGTAAACAAATCA+6.23
HOXA13MA0650.2chr3:47844297-47844308GTTTTATTGGT-6.32
HOXB13MA0901.2chr3:47844297-47844308GTTTTATTGGT-6.32
NFYAMA0060.3chr3:47843903-47843914TCTGATTGGTT-6.62
ZNF384MA1125.1chr3:47844503-47844515TTTTTTTTTTAT-6.27
Enhancer Sequence
CAGGACACCA AGCCAACAAT CGGCTATTGG GCTTATTTGT TCTGTCCATC AGGCTAGTTT 60
GTTTCGGCTC TCATCGAGTT AACATCAGAG CAATTTTGTG TGTAGAATCA GCTGAAGAGC 120
GCGCTCTGAT TGGTTACTAC AAATTGAGCG TGATGTAGTG AGGTGACATA GCAAGTAAAC 180
AAATCAAGCC AAGAAGGATC ACAAACAGGT CGGCTCTAAT TTTGGGCGTA ATATGGATTT 240
TTAGATTACC AGCCACATTT GCATGAGCAA ATCCCTGCGT TAGGAACAAT ACTGTGATGA 300
TAATGGTACT AAACGCTACA CTTTGTCCGG GCATGCCAGA AATTGGGGTT CCTGAATGAG 360
AAACAAGAAA AACGACTACT GACCACGTGG ACCAAAAAGA CATAGTTCTT CACATTTGCA 420
GAGCATGTGC ATTTAAATCA GTTAGCTATT TTTGTTGGTG TGTTTACATT CAGCTTTTTG 480
GTCCAGACAC AATTAACGCA AAACGACAAA ACAGTTGGGT TTTATTGGTG CTAGTTGTTT 540
TAGGCATTGG CTAGGTGCGT CCCATCCCTA CGAGAGAGAA CTGAAGTACA CGCAAATGAA 600
AATGCAACTC TGATTTTAGT CTATCTGTGT GTTTTCGTTA AAGGTCTGAA TACCTTATTT 660
TGGTGCACTT TCTCACATTA TGTCTCATAA TGGTCACATG TTCCGTCAAT AGCAGGTAGC 720
AGGGTTTTTT TTTTATGGCT GTTTGAACAT TTGACCACAT GAACGCCTGC TCTATTAAAG 780
CAATCCACAG GAAGTGGTCA AATGTTTATT TAGCACAATC CACTACTAAA CAAATGCGAT 840
ATATACACAC TGACTGGACA GACTTTTAAT TTCAGCCAGC CAGCCTTAGC GCTTCAGTGA 900
ACTTTCAGTC TTTTCATTAT AAAGTTGCCA TGTTTAAGGT CTTATTTCCT TAAAAAAACA 960
TATACATTTG AAAATGATCA CATTAAGCTA TAACTAGAAG TTTATCATTG GCTGAAAACA 1020
CTAGCTGTGC ATTTACCCCA TTGACAGGAC ATCTTAATAC CAGGTGTAAT CTGGGTGAGC 1080
CTACTATG 1088