EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-40108 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:47818990-47819766 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr3:47819102-47819113TATTGTTTATA+6.32
LMX1BMA0703.2chr3:47819382-47819393TTAATTAAAAT-6.62
POU4F1MA0790.1chr3:47819391-47819405ATGAATAATAAATG+6.62
POU4F3MA0791.1chr3:47819391-47819407ATGAATAATAAATGCT+6.22
RARA(var.2)MA0730.1chr3:47819085-47819102TGGTCAATAAAAGGTCA+6.08
Rarb(var.2)MA0858.1chr3:47819085-47819102TGGTCAATAAAAGGTCA+6.21
Enhancer Sequence
TACTTTATGC CATATTGTGA ATTAGGACTA CTTTTTTATA ACATGACAGG CACTGATTTA 60
GCTCCATATT TATATCTGGA CATCTTTTGT AATTTTGGTC AATAAAAGGT CATATTGTTT 120
ATAATTCTGT TGGCGGTGAT AAAGTAAAGT CTCCTCTCAG GAGACAGTAA TCGCCTGTAA 180
GACAGCTTTT GCTCCACAAT AAAGAACCTT TTGTGCAATA GAAAGGGTTC TATGGATGTG 240
GAAGTTTATT CATGGAACTG TGCCAATACA CAACCTTTCA TTCTTTCATT TGAAGTGTGT 300
AACGAGAACT ATTACAAATG TTATAAAATT GACAAAAGAG AATAACAAAA GCACTGAAAC 360
TTGAAATCAA AAGAAAAACG AAAATTTAAA AGTTAATTAA AATGAATAAT AAATGCTATG 420
ATTGGAACTG TTGTGGAGCC ACAGAATGTC AGACCGTTTT TGATAAGAAA TCCATTTGCT 480
GAGGTGTTTT TGGCTTTACT TTTTAGGCTT TTTCCAAATA ACAAAGTTAT TTATTCACAT 540
TGGTCGATAC TAAGCACATT TCAAGATTGT GAGTTGGGTG CTGGTACAGA GAGATTGGTT 600
TATTGGATAG GCTAATATGG ACCAGCACAA CAGAACATGC CGTCCATGCA GTCTTAAAAA 660
AAGAAAAGTA AAGAAAAGAT ACAGCCTGGC AAAACCAAGA ACTGTTTTTC CAGCTGTGAC 720
AGTCCAGCTT GGGAAAAATA TGTAGGCTAA GTGTAGTTTG AATGACTATT AATGAA 776