EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-40049 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:45995494-45997636 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF14MA0740.1chr3:45995592-45995606AGCCACGCCCCCCC+6.35
KLF16MA0741.1chr3:45995593-45995604GCCACGCCCCC+6.62
KLF16MA0741.1chr3:45995801-45995812GCCACGCCCCC+6.62
KLF16MA0741.1chr3:45995947-45995958GCCACGCCCCC+6.62
NR4A1MA1112.2chr3:45995691-45995701TAAAGGTCAC+6.02
Nkx3-2MA0122.3chr3:45995605-45995618CAAACCACTTAAA+6.24
SP1MA0079.4chr3:45995798-45995813CAAGCCACGCCCCCA+7.61
SP1MA0079.4chr3:45995944-45995959CAAGCCACGCCCCCA+7.61
SP1MA0079.4chr3:45995590-45995605CAAGCCACGCCCCCC+7.85
SP3MA0746.2chr3:45995800-45995813AGCCACGCCCCCA+6.34
SP3MA0746.2chr3:45995946-45995959AGCCACGCCCCCA+6.34
SP3MA0746.2chr3:45995592-45995605AGCCACGCCCCCC+6.74
SP4MA0685.1chr3:45995798-45995815CAAGCCACGCCCCCAAA+7.18
SP4MA0685.1chr3:45995944-45995961CAAGCCACGCCCCCAAA+7.18
SP4MA0685.1chr3:45995590-45995607CAAGCCACGCCCCCCCA+7.45
SP8MA0747.1chr3:45995801-45995813GCCACGCCCCCA+6.11
SP8MA0747.1chr3:45995947-45995959GCCACGCCCCCA+6.11
SP8MA0747.1chr3:45995593-45995605GCCACGCCCCCC+6.44
Enhancer Sequence
TGTCAATCAC AGTACATAGC AGTGTCATAC TGACTTGGGG GTGGGCTCAT TTGACTCAGG 60
CAACCAATCA GCATCTCACT ATGATTTTGA AGCTCACAAG CCACGCCCCC CCAAACCACT 120
TAAAGACCCC TAATAAGTGC CCCATTGACT TAACATGGGG TGGGATGTCC CATTGCAGAT 180
CCCATTGACT TCCATTATAA AGGTCACACA TCTATAACAT TACATAGGAG TGTCATAGAG 240
ACATGGGGGT GGGCTCATCT GACTCAGACA ACCAATCAGC ATCGCAATAT GATAATGAAG 300
CTCACAAGCC ACGCCCCCAA ACTGGTCCCA TAGACTGCCA TTATAACTGC CCTACATGCA 360
TATCTTTGCT TAGCAGTGTC CTATTGGCTT GGGGGATGGC TCATCTGACT CAGACAACCA 420
ATGAGCATCT CAATATGATA ATGAATCTCA CAAGCCACGC CCCCAAACTG GTCCCATAGA 480
CTGCCATTAT AACTGCTCTA CATGCATATC TTTGCTTAGC AGTGTCCTAT TGACTTGGGG 540
GTTGGCTCAT TTGACTTGGA CAGCCAACCA CATTCAAGTT CACTCTGTAA CCTCGCCCAT 600
AGCAACAAAA CAGAGTACCC TAGCAACCGT TCATCAACAG CTATATCTCA GCATCGGAAC 660
ATCGTAGAGA CTTGGGGATT GGCTCGTTTG ACTCATGCTA GCAAACGGAA CTTCCTATAT 720
GCTACACATG CTAGCAGTGA CTAGCTACAT GCTAATATTG ACTAGCCATG TACTGTAACT 780
TGCTAGAAAT GCTTACTAAG TATAAATATT TCATCAGGCA TGTATGTGAG GCTTGCCTAG 840
TAACCACCCA GGGTACCCTA GCAACTGCCT AGCAACCACC CAAATTACCC TAGCAACCGC 900
CTAGCAACCA CCTAGCAACC GCCTAGTAAC GCCTTAGTAA GGGCCTAGCG ACCACTCAGG 960
ACACCCTAGC AACTGCCTAG CAACGCCTTA GCAACCACTC AGAATACCCT AGCAACCACC 1020
TAGCAACACC TTAGCAACCA CCTATCAACC ACTTAGGACA CCTTAGCAAC CGCCTAGCAA 1080
CACCTTAGCA ACCACCTAGC AACCACTCAG AACACCCTAG CAACCGCCTA GCAACCACTC 1140
AGAACACCCT AGCAACCACC TAGCAACACC TTAGCAACCA CCTAGCAACC ACTCAGGACA 1200
CCCTAGCAAC CACCTAGCAA CACCTTAGCA ACCACCTAGC AACCACTCAG GACACCCTAG 1260
CAACCGCCTA GCAACCACTT AGAATACCCT AGCAACCACC TAGCAACACC TTAGCAACCA 1320
CCTAGCAACC ACTCAGAACA CCCTAGCAAC CGCCTAGCAA CCACTCAGAA CACCCTAGCA 1380
ACCACCTAGC AACACCTTAG CAACCACCTA GCAACCACTC AGGACACCCT AGCAACCACC 1440
TAGCAACACC TTAGCAACCA CCTAGCAACC ACTCAGGACA CCCTAGCAAC CGCCTAGCAA 1500
CCACTTAGAA TACCCTAGCA ACCACCTAGC AACACCTTAG CAACCACTTA GGACACCTTA 1560
GCAACCGCCT AGCAACACCT TAGCAACCAC TTAGAATACC CTAGCAACCA CCTAGCAACA 1620
CCTTCGCAAC CACCTAACAC CACTCAGGAC ACCTTAGCAA CCGCCTAGCA ACACCTTAGC 1680
AACCACCTAG CAACCACTCA GAACACCCTA GCAACCGCCT AGCAACCACT CAGAACACCC 1740
TAGCAACCAC CTAGCAACAC CTTAGCAACC ACCTAGCAAC CACTCAGGAC ACCCTAGCAA 1800
CCACCTAGCA ACACCTTAGC AACCACCTAG CAACCACTCA GGACACCCTA GCAACCGCCT 1860
AGCAACCACT TAGAATACCC TAGCAACCAC CTAGCAACAC CTTAGCAACC ACCTAGCAAC 1920
CACTCAGAAC ACCCTAGCAA CCGCCTAGCA ACCACTCAGA ACACCCTAGC AACCACCTAG 1980
CAACACCTTA GCAACCACCT AGCAACCACT CAGGACACCC TAGCAACCAC CTAGCAACAC 2040
CTTAGCAACC ACCTAGCAAC CACTCAGGAC ACCCTAGCAA CCGCCTAGCA ACCACTTAGA 2100
ATACCCTAGC AACCACCTAG CAACACCTTA GCAACCACTT AT 2142