EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-40020 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr3:45581894-45583117 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr3:45583006-45583025TAACGCCACCTGCTGGCAG-6.79
CTCFMA0139.1chr3:45582876-45582895TAGCGCCACCTGCTGGCAG-8.36
CTCFMA0139.1chr3:45582570-45582589TAGTGCCACCTGCTGGCCA-9.36
IKZF1MA1508.1chr3:45581975-45581987GGAACAGGAAGT+6.44
IKZF1MA1508.1chr3:45582455-45582467AAAACAGGAAGT+6.74
KLF13MA0657.1chr3:45582076-45582094TTGAAGTGGGCGTGGCAA-6.21
KLF14MA0740.1chr3:45582079-45582093AAGTGGGCGTGGCA-7.73
SP1MA0079.4chr3:45582080-45582095AGTGGGCGTGGCAAA-6.18
SP3MA0746.2chr3:45582080-45582093AGTGGGCGTGGCA-6.71
SP4MA0685.1chr3:45582078-45582095GAAGTGGGCGTGGCAAA-6.99
SP8MA0747.1chr3:45582080-45582092AGTGGGCGTGGC-7.22
SPICMA0687.1chr3:45582454-45582468CAAAACAGGAAGTC+6.22
Enhancer Sequence
GCGATGATAT ATTGTAAAGA TCTAGAGTTT TCGCAGAGGG GTGTGTCCAT GGCGGTATGA 60
CAAACCTCAA CGCTTCGCCA TGGAACAGGA AGTCCTTATA ACACAACCAC ACAATGTCCG 120
ATCTGCCTGA AACTTTACAT GGTTGATAAA CGTCATCTCT TGAACACATC CACATAACAA 180
TATTGAAGTG GGCGTGGCAA AATGACTCGA CAGCGCCACC TAGAAAAATT AAACGGACGA 240
GCCCCCGATC TACGAATCAC GCACATGCAC AAAAATTGGC ACACACCTCA AACATGGCAA 300
AACATACGAA AAAGTCTCTT GGAGCCATAT CTCAAACCCA ACAGGAAGTC GGATATTTTT 360
AACTTCCTGT GGCGAAAAAG TGGCACTTTT GCCATTTTCA GGCGTTGTAT TTTAACGAAC 420
TCCTCCTAGG GATTTTATCT GATAAACACC AAAATTGGGT TTTGTCATCT TAAAGCCTTG 480
GTGATGTTAA ATTGCGAAGC TTTAGACTTT TCATCGATGG GCGTGTCCGT GGCGGCCTCG 540
CAAACTTTGA TGATTCGCCA CAAAACAGGA AGTCGTTATA ACTCTGGCAT GCAATATTCG 600
ATCTGCCTCA AAATTCACAC ATTTAATAAC AGTCCTGACC TGAACAGGTT TACGTGCCGA 660
TATCCAGTTA CAGTTATAGT GCCACCTGCT GGCCACAGGA AATGACATGT TTGACACTGT 720
AACAAACTCC TCCCACAAAC TTTCCCGTAT CAGCACCAAA ATAGAGTGGT GTCATCTGAA 780
AGCTCTAGCG ATGATATATT GTAAAGATCT AGAGTTTTTG CAGAGGGGCT GTCTGTGGTG 840
GCATGACAAA CCTCAACGCT TCGCCATGGA ACAGGAATTT CTTATAACTC AACCACACAA 900
TGTCTGATCT GCCTAAAACT TCACATGATT GATAAAAGTC CTCTCCTGAA CACATCCACA 960
TAACAATATT GAGTCAGAGT CATAGCGCCA CCTGCTGGCA GAAGGTAGTT TGGCTTGTAA 1020
CTCGGCCACA CAATGTCAGA TCTGCCTAAA ATGCACATGG TTGATGAAAG TCCTCTCCTA 1080
AACACATCTT CATAATAATA TTGAGTCAGT CATAACGCCA CCTGCTGGCA GAATGTAGTT 1140
TGTCTTAAAA CACAATCTCC ACACAATCTC TGATCTGCCT GAAACTTCAC ATGGTTGATA 1200
AAAGTCCGCT CCTGAACACA TCC 1223